EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000012505 (Gene tree)
Gene ID: 101973056
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16977 bases
Position: chrJH393323.1:10762398-10779374
Accession: 101973056
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000011216	RRM_1	PF00076.22	4.9e-17	1	2
ENSSTOP00000011216	RRM_1	PF00076.22	4.9e-17	2	2
ENSSTOP00000029411	RRM_1	PF00076.22	5.7e-17	1	2
ENSSTOP00000029411	RRM_1	PF00076.22	5.7e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000012515	HTATSF1-202	2202	-	ENSSTOP00000011216	733 (aa)	-	I3MJA9
ENSSTOT00000036745	HTATSF1-201	3273	XM_005325175	ENSSTOP00000029411	766 (aa)	XP_005325232	A0A287D7C1
ENSSTOT00000034991	HTATSF1-203	733	-	ENSSTOP00000025359	190 (aa)	-	A0A287CVR1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.395	ENSG00000102241	HTATSF1	100	92.213	Homo_sapiens
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	56	60.471	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	60.520	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	82.445	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	80.990	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	63.317	ENSACIG00000020459	htatsf1	95	60.271	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	62.025	ENSAOCG00000020994	htatsf1	92	58.661	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	61.832	ENSAPEG00000016432	htatsf1	89	60.000	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	57	57.631	ENSATEG00000008903	htatsf1	96	57.631	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	94	68.486	ENSANAG00000027986	-	96	66.667	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	93	76.741	ENSANAG00000025458	-	99	75.683	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	55	59.302	ENSACLG00000008096	htatsf1	95	58.542	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.213	ENSAMXG00000008387	htatsf1	79	63.660	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	77.474	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	79.688	Bos_taurus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	71.736	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	74.831	Bos_taurus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	77.474	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	79.688	Bos_taurus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	80.723	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	78.600	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	81.472	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	80.132	Canis_familiaris
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	81.169	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	79.844	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	79.369	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	79.578	Capra_hircus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	81.340	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	81.472	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	81.152	ENSCCAG00000022701	-	99	79.515	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	75.953	ENSCCAG00000025329	-	99	76.081	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.343	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	79.183	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	77.937	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.842	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.475	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	79.315	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	52	70.130	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	86	69.832	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.739	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	79.578	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	81	80.190	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	76.087	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	73	73.063	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	69.958	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	65.051	ENSCVAG00000014070	htatsf1	81	64.171	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	53	60.349	ENSDARG00000056649	htatsf1	99	54.664	Danio_rerio
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	76.618	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	78.261	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	90	44.807	ENSETEG00000006377	-	73	48.087	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	50.483	ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.653	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	77.836	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	77.836	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	77.836	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	77.836	Equus_caballus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	67.670	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	99	67.497	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	50	62.240	ENSELUG00000005486	htatsf1	84	59.579	Esox_lucius
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	79.346	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	79.288	Felis_catus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	52	67.424	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	66.667	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	79.255	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	77.690	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.975	ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.830	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	52	68.217	ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.217	Gallus_gallus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.796	ENSGAFG00000003041	htatsf1	81	63.904	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	55	59.953	ENSGACG00000020459	htatsf1	97	58.904	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.263	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	99	79.183	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	55	59.302	ENSHBUG00000004392	htatsf1	95	58.542	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	79.228	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	99	79.024	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	61.832	ENSHCOG00000009056	htatsf1	90	62.217	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.474	ENSIPUG00000017828	htatsf1	76	64.738	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.721	ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.096	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	63.753	ENSLBEG00000001154	htatsf1	88	62.439	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	66.053	ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.746	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	43.878	ENSLOCG00000015118	htatsf1	89	41.135	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	69.921	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	78.571	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.211	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	79.051	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.211	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	79.051	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	78.069	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	76.033	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.211	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	79.051	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	63.544	ENSMAMG00000021225	htatsf1	83	63.200	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	55	59.302	ENSMZEG00005000485	htatsf1	95	58.542	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	74.805	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	74.766	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	81.299	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	81.617	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	75.033	ENSMOCG00000023007	-	99	75.165	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	73.325	ENSMOCG00000022370	-	96	71.791	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	63.131	ENSMMOG00000011013	htatsf1	82	62.169	Mola_mola
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	52	71.802	ENSMODG00000014087	-	84	71.802	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	56	58.661	ENSMALG00000019977	htatsf1	94	58.661	Monopterus_albus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	74.735	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	75.499	Mus_caroli
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	75.913	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	76.596	Mus_musculus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	75.507	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	76.197	Mus_spretus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	81.419	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	99	80.208	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	100	69.120	ENSMLUG00000009234	-	98	68.318	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	73.499	ENSMLUG00000028418	-	99	71.242	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	78.434	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	78.562	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	62	56.757	ENSNBRG00000003818	htatsf1	99	56.757	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.132	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	99	79.183	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	55	68.227	ENSMEUG00000004133	-	86	70.787	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.573	ENSONIG00000008638	htatsf1	95	59.955	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	80.366	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	99	80.443	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	50	64.359	ENSORLG00000002356	htatsf1	94	59.268	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	50	64.615	ENSORLG00020017818	htatsf1	91	59.497	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	50	64.267	ENSORLG00015002268	htatsf1	94	59.584	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	56	59.725	ENSOMEG00000007564	htatsf1	94	59.725	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	77.116	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	99	78.010	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	76.953	ENSOARG00000011215	-	99	79.167	Ovis_aries
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	74.548	ENSOARG00000000481	-	99	75.750	Ovis_aries
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.395	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	99	79.315	Pan_paniscus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	80.548	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	80.501	Panthera_pardus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	92	79.466	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	79.403	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	80.395	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	79.315	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	68.602	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	67.104	Papio_anubis
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	67.109	ENSPKIG00000024852	htatsf1	79	66.574	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	63.659	ENSPMGG00000006172	htatsf1	82	63.130	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	76.729	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	76.702	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	58	62.824	ENSPCIG00000018896	-	95	62.824	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	69.657	ENSPCIG00000030173	-	83	68.698	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	53	63.636	ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	64.267	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	53	63.145	ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	63.145	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	53	63.636	ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.267	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	65.063	ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.533	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	82	84.579	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	84	83.513	Pongo_abelii
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	92	68.596	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	99	64.919	Procavia_capensis
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	82.152	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	81.926	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	74.827	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	72.951	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	55	60.417	ENSPNYG00000016693	htatsf1	95	59.637	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	66.223	ENSPNAG00000006166	htatsf1	79	65.826	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	75.161	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	99	77.073	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	70.976	ENSRBIG00000035486	HTATSF1	99	69.302	Rhinopithecus_bieti
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