EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000014596 (Gene tree)
Gene ID: 101977789
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11041 bases
Position: chrJH393537.1:1579212-1590252
Accession: 101977789
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000013095	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.2e-41	1	1
ENSSTOP00000013095	DEAD	PF00270.29	1.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000014618	SKIV2L-201	4195	XM_005338967	ENSSTOP00000013095	1246 (aa)	XP_005339024	I3MN95

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000014596's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000014596's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	76	36.875	ENSSTOG00000010802	MTREX	88	36.875

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.462	ENSG00000204351	SKIV2L	100	94.462	Homo_sapiens
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.569	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.185	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.185	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.064	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	60.176	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.032	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.014	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.032	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	60.870	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.939	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.859	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	65.333	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	66.091	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.703	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	94.703	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.569	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.252	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	59.696	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.368	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.783	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	94.783	Bos_taurus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	96	39.688	WBGene00008502	skih-2	99	39.657	Caenorhabditis_elegans
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.382	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.382	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	95.102	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	94.703	Canis_familiaris
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	95.020	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	94.623	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.703	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	94.703	Capra_hircus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.382	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	94.382	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.178	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	93.178	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.543	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	94.543	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.462	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	94.462	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.740	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.740	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.141	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	94.141	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	87	63.883	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	98	64.572	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	94	51.184	ENSCING00000005576	-	99	50.972	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	94.618	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	94.618	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.547	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	94.547	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.022	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	61.164	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.612	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	61.293	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.616	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.300	Danio_rerio
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	94	94.231	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	88.409	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	93	44.081	FBgn0039117	tst	97	44.165	Drosophila_melanogaster
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	72	93.830	ENSETEG00000009522	SKIV2L	72	93.830	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	89	56.424	ENSEBUG00000013680	-	99	55.778	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	93	95.780	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	95.780	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	96	94.622	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	94.622	Equus_caballus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	54	98.814	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	60	98.814	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.032	ENSELUG00000000181	skiv2l	95	67.116	Esox_lucius
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.345	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	95.345	Felis_catus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	90.537	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.778	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	60.463	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.076	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	59.247	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	59.247	Gadus_morhua
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	79	60.588	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.427	Gallus_gallus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.758	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.599	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.587	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.508	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.302	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	94.302	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.410	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.094	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	91.987	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	92.388	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	89.503	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	89.904	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	59.642	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.561	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.111	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.305	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	71	59.472	ENSLACG00000002986	-	75	59.857	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.222	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.222	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.302	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	94.302	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.222	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	94.222	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.222	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	94.222	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.462	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	94.462	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.997	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	60.680	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.569	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.252	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	70	51.363	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	52.119	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.745	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.910	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.623	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	94.623	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	92.622	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.783	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.974	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	60.531	Mola_mola
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	88.070	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.070	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	59.984	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	59.984	Monopterus_albus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.467	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	94.467	Mus_caroli
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.387	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	94.387	Mus_musculus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.066	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	94.066	Mus_pahari
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.986	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	93.986	Mus_spretus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.944	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	94.944	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.499	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	93.499	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.654	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	60.686	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	91.606	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	91.519	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.222	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.222	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	92.536	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	92.536	Octodon_degus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.992	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.231	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.666	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	95.666	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.472	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	60.463	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.392	ENSORLG00020009462	skiv2l	97	65.191	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.203	ENSORLG00015016750	skiv2l	96	65.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	62.272	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.636	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.345	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	95.345	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	89.193	ENSOARG00000002411	-	100	89.193	Ovis_aries
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	93.679	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	93.574	Pan_paniscus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.425	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	95.425	Panthera_pardus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.104	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.104	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.462	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	94.462	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	93.512	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	93.408	Papio_anubis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.348	ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.908	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.579	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	60.740	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.226	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	94.226	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	88.160	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	88.160	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.490	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.252	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.618	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.380	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.569	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.331	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	59.696	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	59.615	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.981	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.981	Pongo_abelii
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	77	94.737	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	94.737	Procavia_capensis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.987	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	95.987	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.258	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.258	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	59.116	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	66.943	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	61.107	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.288	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.868	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	94.868	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	92.146	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	91.987	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.382	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	94.382	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	93	38.065	YLR398C	-	93	38.084	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.703	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.703	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	87.750	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.709	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.024	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.787	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.053	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	61.120	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.331	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.094	Seriola_dumerili
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.499	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	59.887	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	62.023	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	62.257	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	94	61.487	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.236	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.944	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	Sus_scrofa
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	70	65.945	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.052	Takifugu_rubripes
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	59.809	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	59.666	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	94	93.988	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.988	Tupaia_belangeri
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	89.406	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.406	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	95.506	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.506	Ursus_americanus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	93	95.780	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	95.780	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	95.273	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	95.081	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	58.651	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.907	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.828	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	61.748	Xiphophorus_couchianus
ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.045	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.808	Xiphophorus_maculatus