EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000016122 (Gene tree)
Gene ID: 101971472
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 41025 bases
Position: chrJH393301.1:6921319-6962343
Accession: 101971472
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000014439	CRM1_C	PF08767.11	8e-135	1	1
ENSSTOP00000024370	CRM1_C	PF08767.11	8.1e-135	1	1
ENSSTOP00000027280	CRM1_C	PF08767.11	8.1e-135	1	1
ENSSTOP00000014439	Xpo1	PF08389.12	4.9e-41	1	1
ENSSTOP00000024370	Xpo1	PF08389.12	5e-41	1	1
ENSSTOP00000027280	Xpo1	PF08389.12	5e-41	1	1
ENSSTOP00000024370	IBN_N	PF03810.19	2.2e-12	1	1
ENSSTOP00000027280	IBN_N	PF03810.19	2.2e-12	1	1
ENSSTOP00000014439	IBN_N	PF03810.19	5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000043058	XPO1-202	5177	XM_005322044	ENSSTOP00000027280	1071 (aa)	XP_005322101	A0A287CSQ9
ENSSTOT00000039850	XPO1-201	5509	XM_013357205	ENSSTOP00000024370	1071 (aa)	XP_013212659	A0A287CSQ9
ENSSTOT00000016131	XPO1-203	3192	-	ENSSTOP00000014439	1063 (aa)	-	I3MQY9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.172	ENSAPOG00000004984	-	100	96.172	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	90.319	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.319	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.720	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.720	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	96.489	ENSACIG00000010818	-	100	96.489	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.660	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.660	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.172	ENSAOCG00000010121	-	100	96.172	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.970	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.970	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000016122	XPO1	91	92.482	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.482	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.172	ENSAPEG00000007038	-	100	96.172	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.172	ENSATEG00000008816	-	100	96.172	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.597	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.597	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.533	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.533	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.346	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.346	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.880	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.985	ENSACLG00000015192	-	100	95.985	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.979	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.979	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	93.856	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.856	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.545	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.545	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.813	Bos_taurus
ENSSTOG00000016122	XPO1	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.813	Canis_familiaris
ENSSTOG00000016122	XPO1	93	99.699	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.699	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.813	Capra_hircus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.813	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000016122	XPO1	53	95.213	ENSCAPG00000006454	-	100	95.213	Cavia_aperea
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.319	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.319	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	79.777	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.020	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.723	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.533	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.533	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000016122	XPO1	83	99.870	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.870	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.440	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.440	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	81.192	ENSCING00000024562	-	100	81.192	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000016122	XPO1	99	80.299	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	94.678	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.759	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.506	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.506	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.506	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.506	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	95.319	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.319	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.078	ENSCVAG00000016788	-	100	96.078	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.223	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.223	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	93.184	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.356	Danio_rerio
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.919	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.919	Danio_rerio
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.720	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.720	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000016122	XPO1	92	96.193	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000016122	XPO1	99	71.321	FBgn0020497	emb	99	71.321	Drosophila_melanogaster
ENSSTOG00000016122	XPO1	94	98.524	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.524	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000016122	XPO1	90	79.668	ENSEBUG00000012580	-	100	88.144	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.813	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.813	Equus_caballus
ENSSTOG00000016122	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.934	ENSELUG00000014306	-	99	92.934	Esox_lucius
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	95.106	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.106	Esox_lucius
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.813	Felis_catus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.253	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.253	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.946	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.946	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.503	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.503	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	92.810	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.810	Gadus_morhua
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	90.103	ENSGMOG00000019063	-	100	90.103	Gadus_morhua
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.533	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.533	Gallus_gallus
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.553	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.553	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000016122	XPO1	91	96.189	ENSGAFG00000003355	-	98	96.189	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.892	ENSGACG00000002743	-	100	95.892	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.503	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.503	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.346	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.346	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.880	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	92.157	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.157	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.078	ENSHBUG00000020037	-	100	96.078	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.440	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.440	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.440	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.440	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	95.319	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.319	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	94.024	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.024	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.545	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.545	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.533	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.533	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.612	ENSKMAG00000016218	-	100	95.612	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.410	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.410	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.172	ENSLBEG00000005740	-	100	96.172	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	90.042	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.042	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	77.655	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.655	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.012	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.012	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.440	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.440	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.880	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.880	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.880	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.023	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	97.023	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.078	ENSMAMG00000010568	-	100	96.078	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.877	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.877	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	92.157	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.157	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.985	ENSMZEG00005018158	-	98	96.189	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000016122	XPO1	68	99.174	ENSMGAG00000001496	-	100	99.174	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.506	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.506	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.813	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.786	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.786	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	96.158	ENSMMOG00000008001	-	99	96.158	Mola_mola
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.660	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.660	Mola_mola
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.506	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.506	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	91.711	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.711	Monopterus_albus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.705	ENSMALG00000007085	-	100	95.705	Monopterus_albus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.880	Mus_caroli
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.973	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	98.973	Mus_musculus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.880	Mus_pahari
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.973	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.973	Mus_spretus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.813	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.720	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.720	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.627	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.627	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	92.157	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.157	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000016122	XPO1	96	95.450	ENSNBRG00000012229	-	100	96.596	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	94.995	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	94.995	Nomascus_leucogenys
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.226	ENSODEG00000012632	XPO1	100	98.226	Octodon_degus
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	90.943	ENSORLG00015015414	xpo1a	100	90.943	Oryzias_latipes_hsok
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.798	ENSOMEG00000001384	-	100	96.170	Oryzias_melastigma
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.720	ENSOARG00000020174	XPO1	100	99.720	Ovis_aries
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.199	ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.176	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.422	ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.558	Pelodiscus_sinensis
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ENSSTOG00000016122	XPO1	87	91.323	ENSPMGG00000019000	XPO1	100	91.323	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.973	ENSPEMG00000010103	Xpo1	100	98.973	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.713	ENSPMEG00000003904	-	100	95.713	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.985	ENSPREG00000010135	-	100	95.985	Poecilia_reticulata
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ENSSTOG00000016122	XPO1	96	96.307	ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.307	Procavia_capensis
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.813	Propithecus_coquereli
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ENSSTOG00000016122	XPO1	98	47.086	YGR218W	CRM1	99	47.086	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.223	ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.223	Scophthalmus_maximus
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ENSSTOG00000016122	XPO1	91	99.097	ENSSARG00000014000	-	91	99.097	Sorex_araneus
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.720	ENSSSCG00000028228	XPO1	100	99.720	Sus_scrofa
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ENSSTOG00000016122	XPO1	64	100.000	ENSTBEG00000014485	-	70	100.000	Tupaia_belangeri
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSUAMG00000026512	XPO1	100	99.813	Ursus_americanus
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ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	99.813	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.852	ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.852	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.553	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.553	Xiphophorus_couchianus
ENSSTOG00000016122	XPO1	78	96.931	ENSXCOG00000006625	-	97	96.931	Xiphophorus_couchianus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	95.892	ENSXMAG00000007353	-	100	95.892	Xiphophorus_maculatus
ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.690	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	91.690	Xiphophorus_maculatus