EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000019802 (Gene tree)
Gene ID: 101964163
Gene Symbol: EEFSEC
Alias: EFSEC|SELB|eEFSec
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 64152 bases
Position: chrJH393608.1:448105-512256
Accession: 101964163
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000019011	GTP_EFTU	PF00009.27	3.6e-07	1	1
ENSSTOP00000026832	GTP_EFTU	PF00009.27	5.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000036324	EEFSEC-202	726	-	ENSSTOP00000026832	242 (aa)	-	A0A287CZU2
ENSSTOT00000024459	EEFSEC-201	1748	XM_013365269	ENSSTOP00000019011	487 (aa)	XP_013220723	I3N3R5

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000019802's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000019802's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	95.395	ENSG00000132394	EEFSEC	82	86.122	Homo_sapiens
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.012	ENSAPOG00000015931	eefsec	83	61.663	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	84.884	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	97	80.658	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	87	70.142	ENSACIG00000022407	eefsec	74	64.607	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.012	ENSAOCG00000008603	eefsec	83	61.663	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.258	ENSAPEG00000017090	eefsec	83	61.866	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.382	ENSATEG00000002753	eefsec	83	61.460	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	85	82.781	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	76.224	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	62	79.333	ENSACAG00000028177	-	99	80.128	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	93.421	ENSANAG00000032691	EEFSEC	82	84.898	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.122	ENSACLG00000024565	eefsec	83	61.992	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	59.596	ENSAMXG00000002260	eefsec	82	59.596	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	92.105	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	83	82.857	Bos_taurus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	81	46.809	WBGene00008133	efsc-1	75	31.075	Caenorhabditis_elegans
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.694	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	82	84.694	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.286	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	66	84.286	Canis_familiaris
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.286	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	82	84.286	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	89.474	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	85	82.618	Capra_hircus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.286	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	82	84.286	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	82.418	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	77.959	Cavia_aperea
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.490	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	84	84.490	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	85.306	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	82	85.306	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	94.079	ENSCATG00000019414	EEFSEC	100	85.331	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.049	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	84	84.049	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	85.510	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	82	85.510	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	84.667	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	71	75.529	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	52.058	ENSCSAVG00000002208	-	88	52.049	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	92.763	ENSCANG00000031492	EEFSEC	82	85.102	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	92.763	ENSCGRG00001018089	Eefsec	84	85.336	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	92.763	ENSCGRG00000010063	Eefsec	84	85.336	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	60.922	ENSCSEG00000003008	eefsec	82	60.922	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.729	ENSCVAG00000005381	eefsec	82	62.805	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.414	ENSDARG00000004696	eefsec	83	61.818	Danio_rerio
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	81.109	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	83	81.762	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	69.939	ENSDORG00000000264	Eefsec	99	85.567	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	89	41.667	FBgn0034627	eEFSec	78	41.667	Drosophila_melanogaster
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	72.131	ENSETEG00000007406	EEFSEC	82	72.131	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	70	55.780	ENSEBUG00000015029	eefsec	66	55.460	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.490	ENSEASG00005006786	EEFSEC	82	84.490	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.898	ENSECAG00000016565	EEFSEC	82	84.898	Equus_caballus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	59.192	ENSELUG00000016632	eefsec	82	59.476	Esox_lucius
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.490	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	82	84.490	Felis_catus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	83.444	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	71.663	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	89.583	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	91.447	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.272	ENSFHEG00000007155	eefsec	82	62.677	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.140	ENSGMOG00000007705	eefsec	82	62.423	Gadus_morhua
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	82.667	ENSGALG00000038684	EEFSEC	83	71.605	Gallus_gallus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.933	ENSGAFG00000021692	eefsec	83	62.933	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	62.041	ENSGACG00000000793	eefsec	84	60.966	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	84.667	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	82	71.458	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	94.737	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	94	86.327	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.218	ENSHBUG00000008917	eefsec	80	64.501	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	89.167	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	100	91.447	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.082	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	81	84.082	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.711	ENSHCOG00000004193	eefsec	83	61.992	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	60.649	ENSIPUG00000017291	eefsec	80	63.657	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	88.750	ENSJJAG00000020703	-	99	92.763	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.789	ENSKMAG00000019907	eefsec	83	62.069	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.336	ENSLBEG00000017908	eefsec	82	61.616	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	80.667	ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	69.342	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	96	74.667	ENSLOCG00000014535	eefsec	82	63.747	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	78.937	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	84	79.959	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	85.918	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	82	85.918	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	93.421	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	100	85.537	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	85.714	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	82	85.714	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	94.079	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	92	85.714	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.122	ENSMAMG00000023964	eefsec	83	61.400	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	69.014	ENSMZEG00005009380	eefsec	72	64.045	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	79	72.680	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	99	72.680	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	83	91.447	ENSMAUG00000011197	Eefsec	80	86.682	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	91.447	ENSMOCG00000017748	Eefsec	84	85.743	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	69.159	ENSMMOG00000021820	eefsec	73	64.607	Mola_mola
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	97	79.343	ENSMODG00000008034	EEFSEC	75	79.343	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	97	62.628	ENSMALG00000016211	eefsec	81	65.525	Monopterus_albus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	90.000	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	99	94.079	Mus_caroli
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	90.417	ENSMUSG00000033216	Eefsec	99	94.079	Mus_musculus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	90.000	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	99	94.079	Mus_pahari
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	90.417	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	99	94.079	Mus_spretus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	83.607	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	79	83.607	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	91.447	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	99	82.449	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	89.583	ENSNGAG00000023278	-	99	92.105	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	60.922	ENSNBRG00000002387	eefsec	83	60.922	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	85.306	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	82	85.306	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	98	88.816	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	100	75.359	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	84.663	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	83	84.663	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	89.474	ENSODEG00000002928	EEFSEC	90	83.673	Octodon_degus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	60.041	ENSONIG00000019038	eefsec	100	60.905	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	98	84.211	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	73.958	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.490	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	83	84.490	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.914	ENSORLG00000001377	eefsec	82	61.992	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.711	ENSORLG00020000729	eefsec	82	61.789	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.914	ENSORLG00015001986	eefsec	82	61.992	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	60.896	ENSOMEG00000010071	eefsec	88	61.303	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	87	85.748	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	96	85.748	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	76	84.182	ENSOARG00000004600	EEFSEC	99	84.450	Ovis_aries
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	94.737	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	82	85.918	Pan_paniscus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.694	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	82	84.694	Panthera_pardus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.694	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	88	84.694	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	94.737	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	82	86.122	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	85.510	ENSPANG00000017041	EEFSEC	82	85.510	Papio_anubis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	98	72.000	ENSPKIG00000005220	eefsec	82	61.600	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	83	84.667	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	80	75.529	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	60.285	ENSPMGG00000020300	eefsec	83	60.163	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.318	ENSPEMG00000013677	Eefsec	84	84.318	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	87	72.667	ENSPMAG00000006779	eefsec	81	65.899	Petromyzon_marinus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	88.816	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	100	75.311	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.118	ENSPFOG00000003748	eefsec	82	62.118	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.118	ENSPLAG00000018012	eefsec	82	62.118	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.322	ENSPMEG00000001202	eefsec	82	62.322	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.069	ENSPREG00000012235	eefsec	83	62.069	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	85.102	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	82	85.102	Pongo_abelii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	84	73.966	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	73.966	Procavia_capensis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	85.526	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	83	78.776	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.323	ENSPNYG00000005726	eefsec	83	62.195	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	67.333	ENSPNAG00000016724	eefsec	83	60.404	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	93.421	ENSRNOG00000012954	Eefsec	84	85.947	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	93.421	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	82	85.714	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	62	94.667	ENSRROG00000030260	-	55	91.463	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	93.421	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	100	84.917	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	89.474	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	100	75.569	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	89	72.000	ENSSFOG00015021109	eefsec	82	60.861	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	92	68.667	ENSSMAG00000001454	eefsec	83	61.000	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	60.643	ENSSDUG00000007924	eefsec	83	60.721	Seriola_dumerili
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	69.333	ENSSLDG00000024985	eefsec	82	60.370	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	84.667	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	70.270	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	71.875	ENSSPAG00000001320	eefsec	83	61.400	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	92.105	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	83	84.178	Sus_scrofa
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.667	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	84	71.869	Taeniopygia_guttata
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.538	ENSTRUG00000010327	eefsec	82	61.616	Takifugu_rubripes
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	61.972	ENSTNIG00000003225	eefsec	83	61.972	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	96	91.447	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	83	83.469	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.898	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	82	84.898	Ursus_americanus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	88	85.847	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	90	85.847	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	76	72.654	ENSXETG00000002066	eefsec	80	72.654	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.322	ENSXCOG00000019916	eefsec	83	62.677	Xiphophorus_couchianus
ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	62.322	ENSXMAG00000001839	eefsec	83	62.677	Xiphophorus_maculatus