EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000022702 (Gene tree)
Gene ID: 101954541
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14745 bases
Position: chrJH393356.1:5731825-5746569
Accession: 101954541
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000020982	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	7.8e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000026667	TWISTNB-201	3297	XM_005328792	ENSSTOP00000020982	365 (aa)	XP_005328849	I3N9D6

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000022702's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000022702's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.361	ENSG00000105849	TWISTNB	99	81.361	Homo_sapiens
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	68.895	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	99	70.876	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	90	39.766	ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.787	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	56	54.502	ENSAOCG00000024200	twistnb	50	56.771	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	56	54.502	ENSAPEG00000016750	twistnb	50	56.771	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	81.682	ENSANAG00000026418	TWISTNB	99	81.602	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	54	56.122	ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.122	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	80.655	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	99	80.896	Bos_taurus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	83.183	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	83.086	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	75.287	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	99	77.586	Canis_familiaris
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	77.485	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.532	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	78.994	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	99	79.228	Capra_hircus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	84.118	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	84.118	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	82.789	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	99	82.789	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	82.544	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	99	82.544	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.473	ENSCATG00000035621	TWISTNB	99	80.473	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.953	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.953	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.769	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	99	80.769	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	73	89.394	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	79	89.394	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	85	61.709	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	95	60.443	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.361	ENSCANG00000038759	TWISTNB	99	81.361	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	76.418	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	76.418	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	80.357	ENSDNOG00000006438	-	99	80.597	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	84	79.935	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	79.935	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	96	82.808	ENSEASG00005021702	TWISTNB	99	82.808	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	96	83.095	ENSECAG00000014563	TWISTNB	99	83.095	Equus_caballus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	82	45.338	ENSELUG00000000098	TWISTNB	51	59.239	Esox_lucius
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	82.440	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	99	82.687	Felis_catus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	79	52.922	ENSFALG00000009761	TWISTNB	99	52.597	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	82.530	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	99	82.493	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	86	55.660	ENSGALG00000010863	TWISTNB	77	55.346	Gallus_gallus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	60	50.870	ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.065	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	99	81.065	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.657	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	82.175	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.143	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	39.189	ENSIPUG00000004117	twistnb	55	51.741	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	76.488	ENSJJAG00000015887	Twistnb	99	76.488	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	53	56.410	ENSLBEG00000024225	twistnb	51	56.410	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	88	53.191	ENSLACG00000010508	TWISTNB	92	51.682	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	50	64.130	ENSLOCG00000011399	twistnb	57	63.731	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.493	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	81.493	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.769	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	99	80.769	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	80.655	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	98	80.655	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.473	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	99	80.473	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.769	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	99	80.769	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	82.544	ENSMICG00000036489	TWISTNB	99	82.789	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	88	77.950	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	78.438	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	81	60.000	ENSMODG00000001402	-	72	55.398	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	78.042	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	78.042	Mus_caroli
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	77.679	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	78.274	Mus_musculus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	77.679	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	78.274	Mus_pahari
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	77.976	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	78.571	Mus_spretus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.250	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	93	81.602	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	85	77.170	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	99	78.135	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	55	88.442	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.442	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	56	53.365	ENSNBRG00000008652	twistnb	55	53.365	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	88	81.250	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	94	81.250	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	75.510	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	99	75.510	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	80.712	ENSODEG00000007222	TWISTNB	99	81.306	Octodon_degus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.471	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	98	81.791	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	78.994	ENSOARG00000009803	TWISTNB	98	79.228	Ovis_aries
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.769	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	99	81.065	Pan_paniscus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.845	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	99	80.597	Panthera_pardus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	82	81.333	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	81.605	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.361	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	99	81.361	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.473	ENSPANG00000015736	TWISTNB	99	80.473	Papio_anubis
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	61	54.783	ENSPKIG00000025635	twistnb	54	60.204	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	87	46.313	ENSPMGG00000019023	twistnb	54	53.398	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	77	58.657	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	93	57.827	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.294	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	99	80.294	Pongo_abelii
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.294	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	82.353	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	79.412	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	99	79.412	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	53	55.670	ENSPNYG00000002674	twistnb	51	55.670	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	86	45.748	ENSPNAG00000011956	twistnb	58	54.502	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	88	80.997	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	80.997	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.009	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	98	81.009	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.769	ENSRROG00000040155	TWISTNB	99	80.769	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	91	81.325	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	99	81.548	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	81	43.168	ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.606	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	94	40.483	ENSSMAG00000012792	twistnb	54	49.761	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	84	50.926	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	95	50.165	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	53	54.639	ENSSPAG00000005871	twistnb	52	54.639	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.416	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	79.525	Sus_scrofa
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	84	42.236	ENSTNIG00000017778	twistnb	58	53.299	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	81.657	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	99	81.065	Tupaia_belangeri
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	82.440	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.789	Ursus_americanus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	82.143	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	99	82.493	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	78.006	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	99	80.059	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000022702	TWISTNB	53	57.732	ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.732	Xiphophorus_couchianus