EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000022718 (Gene tree)
Gene ID: 101971503
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14122 bases
Position: chrJH393339.1:6952540-6966661
Accession: 101971503
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000023230	MMR_HSR1	PF01926.23	3.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000021850	SRPRB-201	771	XM_005327028	ENSSTOP00000023230	256 (aa)	XP_005327085	I3NFT3

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000022718's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000022718's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSG00000144867	SRPRB	100	85.240	Homo_sapiens
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.764	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	83.764	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.133	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	84.133	Bos_taurus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.764	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	83.764	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	84.502	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.395	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	83.395	Capra_hircus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.764	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	83.764	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	88.672	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	88.672	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	81.550	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	81.550	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	85.240	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	85.240	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	85.240	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	76.384	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	76.384	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	74.609	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	74.609	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.133	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	84.133	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000022718	SRPRB	95	84.496	ENSCGRG00000014367	Srprb	99	84.496	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	81.181	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	81.181	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	85	78.017	ENSDORG00000000764	Srprb	85	80.734	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	84.871	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	84.871	Equus_caballus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	84.871	Felis_catus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.764	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	83.764	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.609	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	85.609	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	85.240	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	85.240	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	85.240	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	85.240	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	85.240	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	85.240	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	84.502	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	84.871	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	77.122	ENSMODG00000018493	SRPRB	100	77.122	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	84.871	Mus_caroli
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	84.502	Mus_musculus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	85.240	Mus_pahari
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.133	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	84.133	Mus_spretus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.026	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	83.026	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	ENSNGAG00000024311	-	100	84.502	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	ENSNLEG00000003655	SRPRB	99	84.815	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	84.871	Octodon_degus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.609	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	85.609	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.133	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	84.133	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000022718	SRPRB	84	80.870	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	83.486	Ovis_aries
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	85.240	Pan_paniscus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	84.871	Panthera_pardus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	84.871	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	85.240	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	85.240	Papio_anubis
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	84.871	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	84.871	Pongo_abelii
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	82.657	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	82.657	Procavia_capensis
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	85.240	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	84.871	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.871	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	84.871	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000022718	SRPRB	71	87.912	ENSSBOG00000015129	SRPRB	91	87.912	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	81.919	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	81.919	Sorex_araneus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.133	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	84.133	Sus_scrofa
ENSSTOG00000022718	SRPRB	99	81.413	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	82.156	Tupaia_belangeri
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	82.288	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	82.288	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.764	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	83.764	Ursus_americanus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.395	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	83.395	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.502	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	84.502	Vulpes_vulpes