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Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000023221 (Gene tree)
Gene ID: 101974674
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 48500 bases
Position: chrJH393368.1:1393799-1442298
Accession: 101974674
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000018865	ResIII	PF04851.15	8.8e-08	1	1
ENSSTOP00000015258	ResIII	PF04851.15	1.2e-07	1	1
ENSSTOP00000031603	ResIII	PF04851.15	1.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000022066	SBNO1-203	3810	-	ENSSTOP00000018865	1269 (aa)	-	I3N3B9
ENSSTOT00000023032	SBNO1-202	4074	XM_013360464	ENSSTOP00000015258	1357 (aa)	XP_013215918	I3MT13
ENSSTOT00000042506	SBNO1-201	5581	XM_005329560	ENSSTOP00000031603	1392 (aa)	XP_005329617	A0A287DDI5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000023221	SBNO1	82	57.795	ENSSTOG00000025832	SBNO2	70	67.800

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	ENSG00000139697	SBNO1	100	98.204	Homo_sapiens
ENSSTOG00000023221	SBNO1	84	83.393	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.341	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.138	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.105	ENSACIG00000008088	sbno1	95	82.105	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.679	ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.679	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.679	ENSAPEG00000006069	sbno1	94	82.679	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	85.018	ENSATEG00000006667	sbno1	95	85.018	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	94.937	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.032	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	93.548	ENSACAG00000015441	SBNO1	84	93.885	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.084	ENSANAG00000029958	-	100	98.084	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	76.194	ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.281	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	86.847	ENSAMXG00000019473	sbno1	95	86.847	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.275	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	98.600	Bos_taurus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.277	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	97.990	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.495	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	98.495	Canis_familiaris
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.110	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	98.110	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.275	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	98.818	Capra_hircus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.895	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.895	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000023221	SBNO1	97	99.458	ENSCAPG00000000384	SBNO1	100	97.971	Cavia_aperea
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	ENSCPOG00000008109	SBNO1	100	98.399	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	94.952	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	93.615	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	99.458	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	ENSCLAG00000008995	SBNO1	100	98.399	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000023221	SBNO1	85	99.136	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	99.136	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	95	98.049	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.514	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	94.444	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	92.121	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	92.826	ENSCANG00000042688	-	100	92.755	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.109	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	98.109	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.109	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	98.109	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.765	ENSCSEG00000011919	sbno1	96	82.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.303	ENSCVAG00000007038	sbno1	95	83.303	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	86.076	ENSDARG00000099080	sbno1	95	86.076	Danio_rerio
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	97.082	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	97.842	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	84.666	ENSDORG00000015261	Sbno1	100	84.666	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000023221	SBNO1	92	98.582	ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000023221	SBNO1	72	86.802	ENSEBUG00000013823	sbno1	85	86.802	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000023221	SBNO1	54	96.637	ENSEASG00005012595	-	92	98.813	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.708	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	98.708	Equus_caballus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	83	98.901	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	98.901	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	86.847	ENSELUG00000002886	sbno1	95	86.847	Esox_lucius
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.457	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	98.779	Felis_catus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	95.118	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	92.175	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	95.830	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.830	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.483	ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	96	84.587	ENSGMOG00000018229	sbno1	100	78.848	Gadus_morhua
ENSSTOG00000023221	SBNO1	87	96.701	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.283	Gallus_gallus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.662	ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	96	84.489	ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.489	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	94.624	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.503	ENSGGOG00000015000	SBNO1	100	98.503	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	70.373	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	70.481	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	99.281	ENSHGLG00000014165	-	99	99.458	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000023221	SBNO1	93	84.676	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	85.791	ENSIPUG00000015830	Sbno1	93	88.978	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	97.775	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	97.775	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.755	ENSKMAG00000009696	sbno1	95	84.211	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	85.278	ENSLBEG00000007623	sbno1	95	85.278	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	81.201	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	89.029	ENSLOCG00000005725	sbno1	95	89.029	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	98.553	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.272	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.577	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	98.134	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.577	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	98.204	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	99.458	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	84.838	ENSMAMG00000005473	sbno1	95	84.838	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	95.298	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	92.103	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000023221	SBNO1	52	97.879	ENSMAUG00000004834	-	100	97.888	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	97.347	ENSMICG00000006573	-	100	97.347	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	97.951	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	97.951	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.750	ENSMMOG00000008691	sbno1	94	83.750	Mola_mola
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	97.101	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	95.043	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.585	ENSMALG00000001056	sbno1	95	82.585	Monopterus_albus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.275	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	100	97.888	Mus_caroli
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.275	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	98.190	Mus_musculus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	98.923	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	97.888	Mus_pahari
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.275	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	98.190	Mus_spretus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.492	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	98.492	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	97.846	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	97.846	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.277	ENSNGAG00000012620	Sbno1	100	98.134	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	76.432	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	76.518	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	94.547	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.547	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000023221	SBNO1	60	96.774	ENSMEUG00000008768	-	93	89.241	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	97.653	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.763	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	99.640	ENSODEG00000009997	SBNO1	100	98.346	Octodon_degus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.574	ENSONIG00000015348	sbno1	95	83.574	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	98	96.569	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	96.569	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.852	ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.852	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.852	ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.852	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.032	ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.032	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.303	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	75.747	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000023221	SBNO1	52	94.554	ENSOGAG00000010781	-	100	95.030	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.275	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.349	Ovis_aries
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.425	ENSPPAG00000024635	SBNO1	100	98.425	Pan_paniscus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.457	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.779	Panthera_pardus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.492	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.492	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.504	ENSPTRG00000005597	SBNO1	100	98.504	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.504	ENSPANG00000011640	SBNO1	100	98.504	Papio_anubis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	86.126	ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.126	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	94.245	ENSPSIG00000009572	-	100	91.753	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	91	91.216	ENSPSIG00000009256	-	100	87.714	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	97.715	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.715	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	96.739	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	94.698	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.662	ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.662	ENSPLAG00000015015	sbno1	95	83.662	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.662	ENSPMEG00000021212	sbno1	95	83.662	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.303	ENSPREG00000017746	sbno1	95	83.303	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	99.458	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	97.845	Pongo_abelii
ENSSTOG00000023221	SBNO1	89	92.730	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	92.700	Procavia_capensis
ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.452	ENSPCOG00000024277	SBNO1	100	98.452	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000023221	SBNO1	92	99.206	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	99.206	Pteropus_vampyrus
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