EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000023984 (Gene tree)
Gene ID: 101956513
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4331 bases
Position: chrJH393284.1:9968469-9972799
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000017637	SYF2	PF08231.12	2.1e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000020076	SYF2-201	441	-	ENSSTOP00000017637	146 (aa)	-	I3MZU1

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000023984's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000023984's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSG00000117614	SYF2	60	97.260	Homo_sapiens
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	79.452	ENSAPOG00000001174	syf2	61	79.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSAMEG00000010115	-	60	96.575	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000023984	SYF2	97	94.366	ENSAMEG00000010134	-	73	94.366	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	ENSACIG00000023688	syf2	58	76.027	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	ENSAOCG00000022046	syf2	62	80.137	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	ENSAPEG00000018858	syf2	56	80.137	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	ENSATEG00000007745	syf2	61	78.082	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	ENSAPLG00000016435	SYF2	73	84.932	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	83.562	ENSACAG00000013653	-	72	83.562	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000023984	SYF2	77	72.566	ENSACAG00000026777	-	61	72.816	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSANAG00000032473	SYF2	60	97.945	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	ENSACLG00000019916	syf2	61	76.027	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	ENSAMXG00000004051	syf2	61	77.397	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSBTAG00000001651	SYF2	62	97.260	Bos_taurus
ENSSTOG00000023984	SYF2	99	47.260	WBGene00019402	syf-2	62	47.260	Caenorhabditis_elegans
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSCJAG00000046570	SYF2	60	97.945	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	89.726	ENSCAFG00000030331	-	64	89.726	Canis_familiaris
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSCAFG00000012895	-	59	95.890	Canis_familiaris
ENSSTOG00000023984	SYF2	88	82.946	ENSCAFG00020021094	-	54	94.175	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSCAFG00020021091	-	59	95.890	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSCHIG00000020874	SYF2	61	97.260	Capra_hircus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSTSYG00000005114	SYF2	60	95.890	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSCAPG00000010006	SYF2	74	96.575	Cavia_aperea
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSCPOG00000005326	SYF2	60	96.575	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSCCAG00000022459	SYF2	60	97.945	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSCATG00000026917	SYF2	60	96.575	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSCLAG00000008474	SYF2	60	97.260	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSCSAG00000000948	SYF2	60	96.575	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000023984	SYF2	88	91.473	ENSCHOG00000005273	-	79	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	86.301	ENSCPBG00000025073	SYF2	59	86.301	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000023984	SYF2	97	50.000	ENSCING00000003017	-	60	50.000	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000023984	SYF2	97	48.611	ENSCSAVG00000006627	-	66	48.611	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000023984	SYF2	78	96.491	ENSCANG00000037322	SYF2	54	96.491	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.151	ENSCGRG00001020733	Syf2	60	93.151	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000023984	SYF2	98	93.706	ENSCGRG00000005095	Syf2	70	93.793	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	71.233	ENSCSEG00000000117	syf2	61	71.233	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	ENSCVAG00000019543	syf2	61	75.342	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	ENSDARG00000004706	syf2	61	77.397	Danio_rerio
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.205	ENSDNOG00000047605	SYF2	60	95.205	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSDORG00000001274	Syf2	60	96.575	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000023984	SYF2	99	51.020	FBgn0033556	CG12343	65	51.020	Drosophila_melanogaster
ENSSTOG00000023984	SYF2	99	51.389	ENSEBUG00000015402	syf2	67	51.389	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSEASG00005004224	-	59	96.575	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000023984	SYF2	77	98.230	ENSEASG00005004232	-	55	69.531	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSECAG00000010440	-	61	96.575	Equus_caballus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSECAG00000012023	-	60	97.945	Equus_caballus
ENSSTOG00000023984	SYF2	95	86.232	ENSEEUG00000015084	SYF2	75	86.232	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	81.507	ENSELUG00000003465	syf2	61	81.507	Esox_lucius
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSFCAG00000010324	-	51	97.260	Felis_catus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSFCAG00000043095	-	59	95.890	Felis_catus
ENSSTOG00000023984	SYF2	99	81.379	ENSFALG00000000460	SYF2	59	81.379	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSFDAG00000008310	SYF2	60	96.575	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000023984	SYF2	99	55.172	ENSFHEG00000007238	syf2	64	55.172	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.767	ENSGMOG00000019138	syf2	65	78.767	Gadus_morhua
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	ENSGALG00000013639	SYF2	58	84.932	Gallus_gallus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.288	ENSGAFG00000019435	syf2	61	73.288	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	ENSGACG00000007305	syf2	61	77.397	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	86.986	ENSGAGG00000010670	SYF2	59	86.986	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSGGOG00000012796	SYF2	60	97.945	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	ENSHBUG00000020477	syf2	63	76.027	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	ENSHGLG00000004304	-	58	74.658	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSHGLG00000014393	SYF2	60	96.575	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSHGLG00100014722	SYF2	60	96.575	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	79.452	ENSIPUG00000019859	syf2	61	79.452	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSJJAG00000013301	Syf2	69	95.890	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.712	ENSKMAG00000013856	syf2	62	76.712	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	ENSLBEG00000014425	syf2	61	78.082	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	81.507	ENSLACG00000012064	SYF2	61	81.507	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.822	ENSLOCG00000002728	syf2	58	80.822	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	97	71.127	ENSLAFG00000030814	-	77	71.127	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.205	ENSLAFG00000023150	-	60	95.205	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSMFAG00000041831	SYF2	60	96.575	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSMMUG00000002968	SYF2	60	96.575	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSMNEG00000030180	SYF2	60	96.575	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSMLEG00000030248	SYF2	60	96.575	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	ENSMAMG00000010403	syf2	61	75.342	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	ENSMZEG00005006429	syf2	61	76.027	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	ENSMGAG00000002019	SYF2	73	84.932	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.151	ENSMAUG00000018974	Syf2	60	93.151	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSMICG00000016191	SYF2	73	95.890	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	94.521	ENSMOCG00000022938	Syf2	60	94.521	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	ENSMMOG00000002396	syf2	61	73.973	Mola_mola
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	88.514	ENSMODG00000013951	-	65	88.514	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.871	ENSMALG00000010706	syf2	61	76.871	Monopterus_albus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.836	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	60	93.836	Mus_caroli
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.836	ENSMUSG00000028821	Syf2	60	93.836	Mus_musculus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.836	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	60	93.836	Mus_pahari
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.836	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	60	93.836	Mus_spretus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSMPUG00000015801	-	59	95.890	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSMPUG00000015802	-	59	96.575	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSMLUG00000001885	SYF2	60	95.890	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSNGAG00000007912	Syf2	59	96.575	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	65.753	ENSNBRG00000010720	syf2	62	63.946	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSNLEG00000035185	SYF2	60	97.945	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.151	ENSOPRG00000012870	SYF2	60	93.151	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.767	ENSODEG00000014338	-	56	78.767	Octodon_degus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSODEG00000017664	-	61	97.260	Octodon_degus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	ENSONIG00000008213	syf2	61	75.342	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	88.356	ENSOANG00000009552	SYF2	72	88.356	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSOCUG00000013050	SYF2	60	97.260	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	ENSORLG00000028820	syf2	63	77.397	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	ENSORLG00020018333	syf2	62	77.397	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	ENSORLG00015014665	syf2	61	77.397	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	ENSOMEG00000013911	syf2	61	78.082	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSOGAG00000009962	SYF2	60	96.575	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000023984	SYF2	96	72.143	ENSOARG00000006269	-	72	72.143	Ovis_aries
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.946	ENSOARG00000006348	-	60	95.946	Ovis_aries
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSPPAG00000036579	SYF2	60	97.945	Pan_paniscus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSPPRG00000001651	-	59	95.890	Panthera_pardus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSPPRG00000001638	-	59	97.260	Panthera_pardus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSPTIG00000007036	-	59	95.890	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSPTIG00000005711	-	53	97.260	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSPTRG00000000352	SYF2	60	97.945	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSPANG00000008139	SYF2	60	96.575	Papio_anubis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	ENSPKIG00000008130	syf2	62	80.137	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	85.616	ENSPSIG00000011816	SYF2	57	85.616	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.712	ENSPMGG00000008755	syf2	57	76.712	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.836	ENSPEMG00000008283	Syf2	60	93.836	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	94.521	ENSPCIG00000014235	SYF2	58	94.521	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	ENSPFOG00000004116	syf2	60	73.973	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	ENSPLAG00000006691	syf2	63	73.973	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000023984	SYF2	99	75.694	ENSPMEG00000011684	syf2	64	75.694	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	ENSPREG00000003009	syf2	61	73.973	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	ENSPPYG00000001713	SYF2	60	97.945	Pongo_abelii
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	ENSPNYG00000004979	syf2	61	76.027	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	ENSPNAG00000015570	syf2	61	80.137	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.836	ENSRNOG00000060597	Syf2	60	93.836	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	92.466	ENSRBIG00000042970	SYF2	60	92.466	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	ENSRROG00000001347	SYF2	60	96.575	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSSBOG00000020184	SYF2	60	97.260	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	91.781	ENSSHAG00000015630	-	59	91.781	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.151	ENSSHAG00000007152	-	71	93.151	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	ENSSFOG00015023647	syf2	62	80.137	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	ENSSMAG00000009867	syf2	61	75.342	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	ENSSDUG00000013072	syf2	61	78.082	Seriola_dumerili
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	ENSSLDG00000012677	syf2	61	78.082	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	ENSSPUG00000005251	SYF2	58	84.932	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	ENSSPAG00000009626	syf2	61	78.082	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	ENSSSCG00000037481	SYF2	60	97.260	Sus_scrofa
ENSSTOG00000023984	SYF2	71	77.885	ENSTGUG00000001126	SYF2	51	79.208	Taeniopygia_guttata
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	ENSTRUG00000001499	syf2	59	75.342	Takifugu_rubripes
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	74.658	ENSTNIG00000016912	syf2	65	74.658	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000023984	SYF2	86	83.333	ENSTBEG00000017370	SYF2	59	82.540	Tupaia_belangeri
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSTTRG00000003550	SYF2	60	95.890	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSUAMG00000002897	SYF2	59	95.890	Ursus_americanus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSUMAG00000013108	SYF2	59	95.890	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.205	ENSVPAG00000005705	SYF2	60	95.205	Vicugna_pacos
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	ENSVVUG00000027175	-	59	95.890	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	94.521	ENSVVUG00000027181	-	59	94.521	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	81.507	ENSXETG00000022797	syf2	59	81.507	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	ENSXMAG00000022698	syf2	61	73.973	Xiphophorus_maculatus