EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000024979 (Gene tree)
Gene ID: 101969080
Gene Symbol: OVOL2
Alias: CHED|CHED1|HOVO2|ZNF339|bA504H3.3
Full Name: ovo like zinc finger 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 32046 bases
Position: chrJH393295.1:2096495-2128540
Accession: 101969080
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000018022	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-17	1	3
ENSSTOP00000018022	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-17	2	3
ENSSTOP00000018022	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-17	3	3
ENSSTOP00000018022	zf-met	PF12874.7	0.00032	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000028405	OVOL2-201	1711	XM_005320446	ENSSTOP00000018022	276 (aa)	XP_005320503	I3N0X6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000024979	OVOL2	52	42.157	ENSSTOG00000034297	-	66	42.157
ENSSTOG00000024979	OVOL2	62	44.444	ENSSTOG00000033893	-	66	44.444
ENSSTOG00000024979	OVOL2	55	36.082	ENSSTOG00000024118	-	77	38.667
ENSSTOG00000024979	OVOL2	63	42.466	ENSSTOG00000004741	PRDM5	68	42.466
ENSSTOG00000024979	OVOL2	55	40.000	ENSSTOG00000013458	ZNF112	57	40.000
ENSSTOG00000024979	OVOL2	50	42.667	ENSSTOG00000023536	-	66	42.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000024979	OVOL2	54	62.838	ENSAPOG00000006365	zgc:171929	67	62.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	60	84.848	ENSAPLG00000016199	OVOL2	92	84.848	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000024979	OVOL2	95	62.500	ENSACAG00000014216	OVOL2	96	63.498	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000024979	OVOL2	74	87.745	ENSANAG00000026429	OVOL2	100	87.255	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	87.681	ENSCAFG00000005453	OVOL2	100	87.591	Canis_familiaris
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	87.956	ENSCAFG00020027506	OVOL2	100	87.591	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000024979	OVOL2	61	89.881	ENSTSYG00000012790	OVOL2	84	89.881	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000024979	OVOL2	60	84.848	ENSCAPG00000005775	OVOL2	98	84.848	Cavia_aperea
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	67.376	ENSCPBG00000023454	OVOL2	100	68.592	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	72.101	ENSCANG00000033179	OVOL2	100	71.739	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	89.892	ENSDORG00000016697	Ovol2	100	89.170	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	87.726	ENSEASG00005001990	OVOL2	100	87.726	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	88.809	ENSECAG00000007899	OVOL2	100	89.170	Equus_caballus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	54	60.811	ENSELUG00000020356	zgc:171929	50	60.811	Esox_lucius
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	89.455	ENSFCAG00000027530	OVOL2	100	89.455	Felis_catus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	66.308	ENSFALG00000007594	OVOL2	100	64.360	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000024979	OVOL2	61	84.524	ENSFDAG00000008730	OVOL2	100	84.524	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000024979	OVOL2	97	68.030	ENSGALG00000008702	OVOL2	97	67.528	Gallus_gallus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	69.892	ENSGAGG00000020202	OVOL2	100	68.214	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	79.710	ENSHGLG00000016810	OVOL2	100	77.899	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000024979	OVOL2	50	60.870	ENSHCOG00000007100	zgc:171929	76	60.870	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000024979	OVOL2	96	92.424	ENSJJAG00000014942	Ovol2	100	91.667	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	91	45.560	ENSLBEG00000006082	zgc:171929	57	56.977	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	60.584	ENSLACG00000011247	OVOL2	99	60.294	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000024979	OVOL2	55	60.784	ENSMAMG00000021196	zgc:171929	60	60.784	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	58	85.000	ENSMGAG00000006770	OVOL2	96	85.000	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	90.942	ENSMICG00000032455	OVOL2	100	90.942	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	75.547	ENSMODG00000005504	OVOL2	100	73.358	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	86.232	MGP_CAROLIEiJ_G0024381	Ovol2	100	85.507	Mus_caroli
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	86.232	ENSMUSG00000037279	Ovol2	100	85.507	Mus_musculus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	87.681	MGP_PahariEiJ_G0025825	Ovol2	100	85.145	Mus_pahari
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	86.232	MGP_SPRETEiJ_G0025300	Ovol2	100	85.507	Mus_spretus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	88.768	ENSNGAG00000007174	Ovol2	100	88.406	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	75.445	ENSMEUG00000011922	OVOL2	99	73.835	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000024979	OVOL2	62	84.118	ENSOANG00000001250	OVOL2	100	84.118	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	85	85.169	ENSOCUG00000012116	OVOL2	91	85.593	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	98	83.577	ENSOGAG00000030325	OVOL2	100	83.696	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000024979	OVOL2	59	93.865	ENSPPAG00000032300	OVOL2	100	73.551	Pan_paniscus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	86.957	ENSPPRG00000006276	OVOL2	99	87.319	Panthera_pardus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	66	81.818	ENSPSIG00000006768	OVOL2	79	81.183	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	92.391	ENSPCOG00000013518	OVOL2	100	92.391	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000024979	OVOL2	87	87.917	ENSPVAG00000001140	OVOL2	99	87.917	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	100	71.181	ENSSHAG00000018466	OVOL2	100	72.569	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000024979	OVOL2	55	62.500	ENSSMAG00000003204	zgc:171929	63	62.500	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	59	90.123	ENSSARG00000006563	OVOL2	98	89.759	Sorex_araneus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	70	78.125	ENSSPUG00000001720	OVOL2	93	77.957	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	54	62.838	ENSSPAG00000001700	zgc:171929	69	62.838	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	68.100	ENSTGUG00000005909	OVOL2	100	68.100	Taeniopygia_guttata
ENSSTOG00000024979	OVOL2	60	90.964	ENSVVUG00000013094	OVOL2	60	87.356	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	62.199	ENSXETG00000024897	ovol2	99	62.199	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000024979	OVOL2	97	45.714	ENSXETG00000020587	ovol1	100	46.097	Xenopus_tropicalis