EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000025699 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RPP38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5362 bases
Position: chrJH393384.1:5651758-5657119
Accession: 30329
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000023277	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.8e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000028319	RPP38-201	5236	-	ENSSTOP00000023277	289 (aa)	-	I3NFY0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	77.385	ENSG00000152464	RPP38	100	77.385	Homo_sapiens
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	43.796	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.369	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	77.739	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	77.739	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	40.433	ENSACIG00000011592	rpp38	98	41.812	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	43.007	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	42.612	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	45.018	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.565	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000025699	RPP38	93	44.444	ENSATEG00000000731	rpp38	98	43.728	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000025699	RPP38	89	49.042	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	50.183	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.926	ENSACLG00000016958	rpp38	99	42.612	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.465	ENSACLG00000016962	rpp38	99	42.268	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000025699	RPP38	87	41.434	ENSAMXG00000025023	rpp38	94	43.704	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	70.671	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	70.671	Bos_taurus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	75.972	ENSCAFG00000024373	RPP38	100	75.972	Canis_familiaris
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	75.972	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	75.972	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	70.318	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	70.318	Capra_hircus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.239	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	73.239	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	76.408	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	76.408	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000025699	RPP38	91	78.113	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	78.445	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	77.817	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	77.817	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	71.579	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	72.982	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	71.579	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	72.982	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	42.391	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.069	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	39.568	ENSCVAG00000001676	rpp38	96	40.210	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	88	46.693	ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.756	Danio_rerio
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	75.618	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	75.618	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	69.014	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	69.014	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.592	ENSETEG00000002839	RPP38	100	73.592	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000025699	RPP38	96	75.986	ENSEASG00005019783	RPP38	98	75.986	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	68.905	ENSEEUG00000014677	RPP38	100	68.905	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000025699	RPP38	86	44.203	ENSELUG00000010160	rpp38	94	44.406	Esox_lucius
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	72.695	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	72.695	Felis_catus
ENSSTOG00000025699	RPP38	93	50.916	ENSFALG00000014804	RPP38	93	53.114	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	76.056	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	76.056	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	41.786	ENSFHEG00000013741	rpp38	99	42.034	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000025699	RPP38	89	50.758	ENSGALG00000008794	RPP38	91	51.273	Gallus_gallus
ENSSTOG00000025699	RPP38	56	49.080	ENSGACG00000009258	rpp38	96	47.853	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.465	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	42.105	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000025699	RPP38	97	74.733	ENSHGLG00000012144	RPP38	99	74.733	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000025699	RPP38	86	45.565	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	44.569	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	74.035	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	73.333	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000025699	RPP38	85	41.948	ENSKMAG00000003986	rpp38	89	40.520	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000025699	RPP38	90	44.649	ENSLBEG00000006853	rpp38	94	42.238	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000025699	RPP38	93	48.951	ENSLACG00000006502	RPP38	100	47.667	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000025699	RPP38	94	44.637	ENSLOCG00000018347	rpp38	96	45.329	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	78.169	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	77.817	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000025699	RPP38	91	78.113	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	78.445	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000025699	RPP38	93	46.786	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	45.357	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.926	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	42.456	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.926	ENSMZEG00005003200	rpp38	99	42.612	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000025699	RPP38	89	50.000	ENSMGAG00000008217	RPP38	91	50.735	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	71.579	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	72.982	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.333	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	72.632	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000025699	RPP38	91	40.502	ENSMMOG00000003446	rpp38	94	40.293	Mola_mola
ENSSTOG00000025699	RPP38	91	63.396	ENSMODG00000024091	RPP38	99	63.799	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000025699	RPP38	89	41.481	ENSMALG00000002356	rpp38	93	40.221	Monopterus_albus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.333	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	73.333	Mus_caroli
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	72.982	ENSMUSG00000049950	Rpp38	100	72.982	Mus_musculus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.684	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	73.684	Mus_pahari
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	72.281	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	72.281	Mus_spretus
ENSSTOG00000025699	RPP38	97	76.157	ENSMPUG00000018523	RPP38	99	76.157	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000025699	RPP38	91	75.094	ENSMLUG00000002153	RPP38	100	75.972	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.333	ENSNGAG00000011066	Rpp38	100	73.333	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.465	ENSNBRG00000006994	rpp38	98	43.416	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	43.321	ENSONIG00000020467	rpp38	96	43.158	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.239	ENSOCUG00000022768	-	100	73.239	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	72.535	ENSOCUG00000024367	-	100	72.535	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000025699	RPP38	86	42.642	ENSORLG00000009219	rpp38	96	41.667	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000025699	RPP38	86	42.424	ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.111	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000025699	RPP38	86	41.887	ENSORLG00015017702	rpp38	93	40.636	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000025699	RPP38	86	44.574	ENSOMEG00000005414	rpp38	99	43.945	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	76.325	ENSOGAG00000008059	RPP38	100	76.325	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	70.318	ENSOARG00000004534	RPP38	100	69.504	Ovis_aries
ENSSTOG00000025699	RPP38	99	77.972	ENSPPAG00000041577	RPP38	92	77.972	Pan_paniscus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.404	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	73.404	Panthera_pardus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.050	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	73.050	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000025699	RPP38	99	77.622	ENSPTRG00000002318	RPP38	92	77.622	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000025699	RPP38	90	43.478	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	43.369	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000025699	RPP38	94	54.513	ENSPSIG00000001527	RPP38	97	53.957	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	74.737	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	75.789	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000025699	RPP38	99	65.172	ENSPCIG00000009096	RPP38	96	65.172	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000025699	RPP38	61	47.222	ENSPFOG00000016823	rpp38	85	47.222	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000025699	RPP38	94	38.869	ENSPLAG00000007626	rpp38	98	40.141	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000025699	RPP38	85	36.965	ENSPMEG00000020392	rpp38	98	38.163	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000025699	RPP38	87	39.925	ENSPREG00000017744	rpp38	93	40.304	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	78.092	ENSPPYG00000002113	RPP38	100	78.092	Pongo_abelii
ENSSTOG00000025699	RPP38	91	75.758	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	76.241	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000025699	RPP38	72	47.926	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	42.456	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000025699	RPP38	86	42.353	ENSPNAG00000010633	rpp38	99	41.489	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000025699	RPP38	96	71.685	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	70.251	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000025699	RPP38	96	66.308	ENSSHAG00000015529	RPP38	99	67.384	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	43.636	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	42.909	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	42.294	ENSSDUG00000001651	rpp38	98	43.110	Seriola_dumerili
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	41.667	ENSSLDG00000014355	rpp38	98	41.993	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	54.417	ENSSARG00000012099	RPP38	100	54.064	Sorex_araneus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	55.208	ENSSPUG00000005237	-	100	54.514	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	97	54.545	ENSSPUG00000018363	-	99	53.846	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	94	52.174	ENSSPUG00000008560	-	97	51.449	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	92	44.161	ENSSPAG00000020387	rpp38	96	43.728	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	68.881	ENSSSCG00000027110	RPP38	100	68.881	Sus_scrofa
ENSSTOG00000025699	RPP38	89	51.341	ENSTGUG00000001366	RPP38	96	51.648	Taeniopygia_guttata
ENSSTOG00000025699	RPP38	87	45.276	ENSTNIG00000001334	rpp38	91	45.276	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	68.905	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	68.905	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	77.385	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	77.385	Ursus_americanus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	77.465	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	78.169	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000025699	RPP38	98	75.265	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	75.265	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000025699	RPP38	90	46.296	ENSXETG00000003419	rpp38	97	46.953	Xenopus_tropicalis