EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000027378 (Gene tree)
Gene ID: 106144696
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4764 bases
Position: chrJH393290.1:14577381-14582144
Accession: 106144696
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000016884	eRF1_2	PF03464.15	2.1e-37	1	1
ENSSTOP00000016884	eRF1_3	PF03465.15	5.1e-27	1	1
ENSSTOP00000016884	eRF1_1	PF03463.15	1.5e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000020086	PELO-201	4459	XM_013356084	ENSSTOP00000016884	385 (aa)	XP_013211538	I3MXN9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	ENSG00000152684	PELO	100	98.182	Homo_sapiens
ENSSTOG00000027378	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.000	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000027378	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000027378	PELO	97	77.212	ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.260	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.260	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.260	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.260	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000027378	PELO	77	84.899	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.899	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000027378	PELO	98	90.426	ENSACAG00000004352	PELO	100	90.130	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.701	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.779	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000027378	PELO	97	81.233	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	Bos_taurus
ENSSTOG00000027378	PELO	99	58.268	WBGene00011280	pelo-1	100	58.268	Caenorhabditis_elegans
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	Capra_hircus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.961	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000027378	PELO	100	99.481	ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.481	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.961	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000027378	PELO	100	99.481	ENSCLAG00000005043	PELO	100	99.481	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	ENSCHOG00000000523	PELO	100	98.182	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000027378	PELO	98	93.883	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000027378	PELO	97	68.633	ENSCING00000001979	-	100	69.091	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000027378	PELO	100	69.870	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.870	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.701	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	96.104	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000027378	PELO	100	97.403	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.403	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.519	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.519	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.558	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	Danio_rerio
ENSSTOG00000027378	PELO	100	95.337	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.337	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.182	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000027378	PELO	96	67.385	FBgn0011207	pelo	96	67.282	Drosophila_melanogaster
ENSSTOG00000027378	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.442	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.519	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	Esox_lucius
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.701	Felis_catus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	94.805	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.805	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000027378	PELO	74	98.944	ENSFDAG00000002076	PELO	88	98.944	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000027378	PELO	98	80.902	ENSGMOG00000005849	pelo	100	80.779	Gadus_morhua
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.039	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.260	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000027378	PELO	98	94.149	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.701	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.779	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.961	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000027378	PELO	100	96.623	ENSHGLG00100017627	PELO	100	96.623	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000027378	PELO	100	78.442	ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.442	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.260	ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	94.805	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.805	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.818	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000027378	PELO	99	80.729	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.701	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.701	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.701	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.701	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.701	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000027378	PELO	97	83.110	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.779	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000027378	PELO	100	97.403	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	97.403	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.961	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	97.922	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.922	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000027378	PELO	100	79.221	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.221	Mola_mola
ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.597	ENSMALG00000008194	pelo	100	82.597	Monopterus_albus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	98.182	Mus_caroli
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	98.182	Mus_musculus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	98.442	Mus_pahari
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	98.182	Mus_spretus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	95.584	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.584	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	98.182	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.701	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000027378	PELO	100	94.545	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.545	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000027378	PELO	98	97.361	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.361	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	ENSODEG00000017579	PELO	100	98.182	Octodon_degus
ENSSTOG00000027378	PELO	96	81.081	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.779	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.558	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.078	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.078	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.182	ENSOGAG00000027940	PELO	100	98.182	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.961	Ovis_aries
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.701	Pan_paniscus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSPPRG00000018800	PELO	100	98.701	Panthera_pardus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.701	Papio_anubis
ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.857	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000027378	PELO	98	93.617	ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.247	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000027378	PELO	67	78.682	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.682	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	97.922	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.922	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000027378	PELO	100	96.883	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.883	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.078	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.078	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.818	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.818	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.078	ENSPREG00000023071	pelo	100	82.078	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.442	ENSPPYG00000015451	PELO	96	98.442	Pongo_abelii
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.961	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.961	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.779	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000027378	PELO	97	81.769	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.519	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000027378	PELO	100	97.922	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.922	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000027378	PELO	98	34.545	YNL001W	-	98	34.545	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	ENSSBOG00000036140	PELO	100	98.701	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000027378	PELO	63	95.492	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	Sarcophilus_harrisii
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