EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000028487 (Gene tree)
Gene ID: 101959586
Gene Symbol: RAB7A
Alias: RAB7
Full Name: RAB7A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9111 bases
Position: chrJH393608.1:296066-305176
Accession: 101959586
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000022028	MMR_HSR1	PF01926.23	3.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000020968	RAB7A-201	3760	XM_005340448	ENSSTOP00000022028	207 (aa)	XP_005340505	I3NCD1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000028487	RAB7A	88	36.264	ENSSTOG00000011222	-	88	36.264
ENSSTOG00000028487	RAB7A	97	34.597	ENSSTOG00000025248	RAB14	95	34.597
ENSSTOG00000028487	RAB7A	87	37.563	ENSSTOG00000008386	RAB33A	81	37.563
ENSSTOG00000028487	RAB7A	79	37.576	ENSSTOG00000000634	RAB25	75	37.576
ENSSTOG00000028487	RAB7A	86	40.782	ENSSTOG00000026229	RAB5A	81	40.782
ENSSTOG00000028487	RAB7A	66	32.117	ENSSTOG00000021206	HRAS	96	30.808
ENSSTOG00000028487	RAB7A	81	31.250	ENSSTOG00000000084	-	80	31.250
ENSSTOG00000028487	RAB7A	97	37.561	ENSSTOG00000027511	RAB33B	86	37.561
ENSSTOG00000028487	RAB7A	88	38.043	ENSSTOG00000020966	RAB30	88	38.043
ENSSTOG00000028487	RAB7A	77	32.500	ENSSTOG00000012534	MRAS	80	33.918
ENSSTOG00000028487	RAB7A	96	36.500	ENSSTOG00000023497	RAB6A	94	36.500
ENSSTOG00000028487	RAB7A	76	33.121	ENSSTOG00000009530	KRAS	87	33.929
ENSSTOG00000028487	RAB7A	83	34.884	ENSSTOG00000010962	RAB23	70	34.884
ENSSTOG00000028487	RAB7A	83	42.442	ENSSTOG00000006620	RAB5C	77	42.442
ENSSTOG00000028487	RAB7A	96	52.764	ENSSTOG00000004081	RAB9B	99	52.764
ENSSTOG00000028487	RAB7A	82	38.235	ENSSTOG00000020693	-	82	38.235
ENSSTOG00000028487	RAB7A	78	40.491	ENSSTOG00000031571	RAB11B	72	40.491
ENSSTOG00000028487	RAB7A	73	30.519	ENSSTOG00000023505	RERG	74	30.519
ENSSTOG00000028487	RAB7A	79	39.264	ENSSTOG00000011052	RAB1B	79	39.264
ENSSTOG00000028487	RAB7A	81	39.521	ENSSTOG00000014560	-	79	39.521
ENSSTOG00000028487	RAB7A	83	42.442	ENSSTOG00000010536	RAB5B	78	42.442
ENSSTOG00000028487	RAB7A	84	57.225	ENSSTOG00000024550	RAB9A	86	57.225
ENSSTOG00000028487	RAB7A	79	34.545	ENSSTOG00000011237	RAB39B	76	34.545
ENSSTOG00000028487	RAB7A	86	38.674	ENSSTOG00000001886	RAB2B	80	40.881
ENSSTOG00000028487	RAB7A	73	33.113	ENSSTOG00000023151	NRAS	83	33.951
ENSSTOG00000028487	RAB7A	96	32.020	ENSSTOG00000002723	-	87	32.020
ENSSTOG00000028487	RAB7A	77	32.727	ENSSTOG00000028430	ERAS	67	32.727
ENSSTOG00000028487	RAB7A	85	32.955	ENSSTOG00000000861	RAB15	81	33.520
ENSSTOG00000028487	RAB7A	78	41.104	ENSSTOG00000015255	RAB11A	73	41.104
ENSSTOG00000028487	RAB7A	58	34.146	ENSSTOG00000000518	ARL4D	59	34.146
ENSSTOG00000028487	RAB7A	79	36.145	ENSSTOG00000006080	DNAJC27	60	36.145
ENSSTOG00000028487	RAB7A	96	36.181	ENSSTOG00000014123	RAB6B	94	36.181
ENSSTOG00000028487	RAB7A	88	36.612	ENSSTOG00000025122	RAB12	82	36.316
ENSSTOG00000028487	RAB7A	82	34.483	ENSSTOG00000008444	RAB36	63	34.483

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSG00000075785	RAB7A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSAPOG00000002585	RAB7A	100	98.068	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSAPOG00000016091	-	100	98.068	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSAMEG00000015249	RAB7A	100	99.034	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	95.169	ENSACIG00000022381	-	100	95.169	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	97.101	ENSACIG00000013630	RAB7A	100	97.101	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	86.473	ENSACIG00000022208	-	100	86.473	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSAOCG00000008820	-	100	98.068	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSAOCG00000005772	RAB7A	100	98.068	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSAPEG00000017200	RAB7A	100	98.068	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSAPEG00000000306	RAB7A	100	98.068	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSATEG00000002860	RAB7A	100	98.068	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSATEG00000017237	RAB7A	100	98.068	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	85	98.870	ENSAPLG00000004323	RAB7A	100	98.870	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.551	ENSACAG00000005993	RAB7A	100	98.551	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSANAG00000029692	RAB7A	100	99.034	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	77.143	ENSACLG00000024456	-	100	77.143	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSACLG00000018847	RAB7A	100	98.068	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	94.203	ENSACLG00000024502	-	100	94.203	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	93.720	ENSAMXG00000002254	-	100	93.720	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	89.855	ENSAMXG00000031957	zgc:100918	100	89.855	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.551	ENSAMXG00000032027	rab7a	100	98.551	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSBTAG00000010193	RAB7A	100	99.034	Bos_taurus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSCJAG00000017521	RAB7A	100	99.034	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSCAFG00000004157	RAB7A	100	99.034	Canis_familiaris
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSCAFG00020004847	RAB7A	100	99.034	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSCHIG00000001138	RAB7A	100	98.068	Capra_hircus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSTSYG00000002313	RAB7A	100	99.034	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.517	ENSCAPG00000010881	RAB7A	100	99.517	Cavia_aperea
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.517	ENSCPOG00000034570	RAB7A	100	99.517	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSCCAG00000036322	RAB7A	100	99.034	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	76.812	ENSCLAG00000006333	RAB7A	100	76.812	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSCSAG00000008628	RAB7A	100	99.034	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	85	100.000	ENSCHOG00000000365	RAB7A	100	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSCPBG00000014343	RAB7A	100	98.068	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	84.058	ENSCING00000007769	-	100	84.058	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	83.575	ENSCSAVG00000011162	-	100	83.575	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSCANG00000041683	RAB7A	100	99.034	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.551	ENSCGRG00001021807	Rab7	100	98.551	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.551	ENSCGRG00000011649	Rab7	100	98.551	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	91.304	ENSCSEG00000002970	RAB7A	93	91.304	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	97.101	ENSCVAG00000000281	RAB7A	100	97.101	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	97.585	ENSCVAG00000005429	-	100	97.585	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.551	ENSDARG00000020497	rab7a	100	98.551	Danio_rerio
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ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	87.923	ENSDARG00000021287	rab7b	100	87.923	Danio_rerio
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ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSFHEG00000007101	RAB7A	100	98.068	Fundulus_heteroclitus
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ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSGALG00000005902	RAB7A	100	98.068	Gallus_gallus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSGAFG00000021688	-	100	98.068	Gambusia_affinis
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ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSGACG00000000807	-	99	98.068	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSGAGG00000012234	RAB7A	100	98.068	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSGGOG00000005557	RAB7A	100	99.034	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSHBUG00000010852	RAB7A	100	98.068	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	76.667	ENSHBUG00000009027	-	100	76.667	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	94.203	ENSHBUG00000009014	-	100	94.203	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000028487	RAB7A	85	100.000	ENSHGLG00000000127	RAB7A	88	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000028487	RAB7A	96	96.985	ENSHGLG00100008802	RAB7A	96	96.985	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	ENSHCOG00000016322	RAB7A	100	98.068	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000028487	RAB7A	99	94.175	ENSHCOG00000004225	-	98	96.482	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	90.821	ENSIPUG00000017200	-	100	90.821	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	96.618	ENSIPUG00000022445	RAB7A	100	96.618	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	89.372	ENSIPUG00000007246	rab7a	100	89.372	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	99.034	ENSJJAG00000014204	Rab7	100	99.034	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	97.585	ENSKMAG00000006812	RAB7A	100	97.585	Kryptolebias_marmoratus
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