EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000003462 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9425 bases
Position: chrGeneScaffold_5660:88346-97770
Accession: 10898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000003044	rRNA_proc-arch	PF13234.6	4.1e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000003508	SKIV2L-201	3741	-	ENSTBEP00000003044	1246 (aa)	-	UPI0000F5E2CF

Gene Model

Click here to download ENSTBEG00000003462's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTBEG00000003462's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	70	57.407	ENSTBEG00000007769	MTREX	80	57.407

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.374	ENSG00000204351	SKIV2L	98	94.382	Homo_sapiens
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.558	ENSAPOG00000008257	skiv2l	93	63.558	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.006	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	94	93.006	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	61.104	ENSACIG00000016719	skiv2l	93	61.104	Amphilophus_citrinellus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.190	ENSAOCG00000017352	skiv2l	93	63.190	Amphiprion_ocellaris
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.067	ENSAPEG00000001055	skiv2l	93	63.067	Amphiprion_percula
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.067	ENSATEG00000007601	skiv2l	93	63.067	Anabas_testudineus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	67.235	ENSACAG00000011746	SKIV2L	93	67.235	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSANAG00000037992	SKIV2L	94	93.252	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.558	ENSACLG00000006886	skiv2l	93	63.558	Astatotilapia_calliptera
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	61.472	ENSAMXG00000011517	skiv2l	93	61.472	Astyanax_mexicanus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.129	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	94	93.129	Bos_taurus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	90	39.721	WBGene00008502	skih-2	94	39.837	Caenorhabditis_elegans
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	94	93.252	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	93.497	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	94	93.497	Canis_familiaris
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	93.497	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	94	93.497	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.883	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	94	92.883	Capra_hircus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.515	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	94	92.515	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.393	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	94	92.393	Cavia_porcellus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	94	93.252	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSCATG00000036901	SKIV2L	94	93.252	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.638	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	94	92.638	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.374	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	94	93.374	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	80	68.632	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	89	68.632	Chrysemys_picta_bellii
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	88	51.038	ENSCING00000005576	-	94	51.038	Ciona_intestinalis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.742	ENSCANG00000039709	SKIV2L	94	93.742	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.137	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	94	93.137	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.791	ENSCSEG00000011326	skiv2l	92	62.791	Cynoglossus_semilaevis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.331	ENSCVAG00000003072	skiv2l	94	62.331	Cyprinodon_variegatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.255	ENSDARG00000062206	skiv2l	93	62.255	Danio_rerio
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	88	95.415	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	88	95.415	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	88	41.677	FBgn0039117	tst	91	41.796	Drosophila_melanogaster
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	72	91.131	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	93.056	Echinops_telfairi
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	84	59.243	ENSEBUG00000013680	-	91	58.360	Eptatretus_burgeri
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	87	93.252	ENSEASG00005015534	SKIV2L	94	93.252	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	90	92.758	ENSECAG00000021823	SKIV2L	91	92.758	Equus_caballus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	52	96.903	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	55	96.903	Erinaceus_europaeus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	85	77.500	ENSELUG00000000181	skiv2l	88	80.519	Esox_lucius
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.374	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	94	93.374	Felis_catus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	89.571	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	94	89.571	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.822	ENSFHEG00000008853	skiv2l	93	62.822	Fundulus_heteroclitus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	60.595	ENSGMOG00000005926	skiv2l	92	60.595	Gadus_morhua
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	66	69.444	ENSGALG00000035499	SKIV2L	90	67.532	Gallus_gallus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	ENSGAFG00000002382	skiv2l	93	62.699	Gambusia_affinis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.990	ENSGACG00000002927	skiv2l	93	62.990	Gasterosteus_aculeatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	94	93.252	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.436	ENSHBUG00000000726	skiv2l	93	63.436	Haplochromis_burtoni
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.432	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	94	91.432	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	87.515	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	94	88.022	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	92	61.963	ENSHCOG00000007191	skiv2l	94	62.086	Hippocampus_comes
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	61.718	ENSIPUG00000016263	skiv2l	94	61.718	Ictalurus_punctatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.988	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	94	93.988	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	63	55.108	ENSLACG00000002986	-	65	55.524	Latimeria_chalumnae
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.761	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	94	92.761	Loxodonta_africana
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	94	93.497	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	94	93.497	Macaca_mulatta
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	94	93.497	Macaca_nemestrina
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.374	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	94	93.374	Mandrillus_leucophaeus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	ENSMAMG00000002927	skiv2l	93	62.699	Mastacembelus_armatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.436	ENSMZEG00005026415	skiv2l	93	63.436	Maylandia_zebra
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	64	68.966	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	89	68.966	Meleagris_gallopavo
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.015	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	94	93.015	Mesocricetus_auratus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSMICG00000046331	SKIV2L	94	93.252	Microcebus_murinus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.299	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	94	91.299	Microtus_ochrogaster
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.190	ENSMMOG00000014547	skiv2l	92	63.190	Mola_mola
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	88.466	ENSMODG00000015052	SKIV2L	94	88.466	Monodelphis_domestica
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	61.963	ENSMALG00000010535	skiv2l	92	61.963	Monopterus_albus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.892	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	94	92.892	Mus_caroli
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.015	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	94	93.015	Mus_musculus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.525	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	94	92.525	Mus_pahari
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.402	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	94	92.402	Mus_spretus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.883	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	94	92.883	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.902	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	94	91.902	Myotis_lucifugus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.577	ENSNBRG00000018650	skiv2l	92	62.577	Neolamprologus_brichardi
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	90.294	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	93	90.294	Nomascus_leucogenys
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	72	90.265	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	72	90.265	Notamacropus_eugenii
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	94	93.497	Ochotona_princeps
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.086	ENSODEG00000017516	SKIV2L	94	91.086	Octodon_degus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.558	ENSONIG00000013500	skiv2l	93	63.558	Oreochromis_niloticus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	94.110	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	94	94.110	Oryctolagus_cuniculus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.190	ENSORLG00000002021	skiv2l	93	63.190	Oryzias_latipes
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.067	ENSORLG00020009462	skiv2l	90	83.117	Oryzias_latipes_hni
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	ENSORLG00015016750	skiv2l	93	62.699	Oryzias_latipes_hsok
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.558	ENSOMEG00000008531	skiv2l	93	63.558	Oryzias_melastigma
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.865	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	94	93.865	Otolemur_garnettii
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	87.166	ENSOARG00000002411	-	94	87.166	Ovis_aries
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	91.849	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	93	91.849	Pan_paniscus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.620	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	94	93.620	Panthera_pardus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.497	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	94	93.497	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	94	93.252	Pan_troglodytes
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	93.497	ENSPANG00000011501	SKIV2L	94	93.497	Papio_anubis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.469	ENSPKIG00000011876	skiv2l	87	80.519	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.926	ENSPMGG00000019707	skiv2l	92	63.926	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.647	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	94	92.647	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	88.344	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	94	88.344	Phascolarctos_cinereus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.822	ENSPFOG00000002424	skiv2l	93	62.822	Poecilia_formosa
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.945	ENSPLAG00000018304	skiv2l	93	62.945	Poecilia_latipinna
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.822	ENSPMEG00000006997	skiv2l	93	62.822	Poecilia_mexicana
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.454	ENSPREG00000002277	skiv2l	92	62.454	Poecilia_reticulata
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.270	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	94	92.270	Pongo_abelii
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	77	92.105	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	92.105	Procavia_capensis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.742	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	94	93.742	Propithecus_coquereli
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.656	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	94	91.656	Pteropus_vampyrus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.745	ENSPNYG00000017853	skiv2l	91	79.221	Pundamilia_nyererei
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	62.209	ENSPNAG00000011823	skiv2l	93	62.209	Pygocentrus_nattereri
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.260	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	94	93.260	Rattus_norvegicus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	90.882	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	93	90.882	Rhinopithecus_bieti
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.252	ENSRROG00000036429	SKIV2L	94	93.252	Rhinopithecus_roxellana
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	86	35.340	YLR398C	-	86	35.340	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.006	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	94	93.006	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	87.975	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	94	87.975	Sarcophilus_harrisii
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	ENSSFOG00015016930	skiv2l	93	62.822	Scleropages_formosus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.067	ENSSMAG00000020185	skiv2l	94	63.067	Scophthalmus_maximus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	63.681	ENSSDUG00000019977	skiv2l	93	63.681	Seriola_dumerili
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.086	ENSSLDG00000024382	skiv2l	92	62.086	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	61.058	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	93	61.058	Sphenodon_punctatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	89	63.017	ENSSPAG00000012904	skiv2l	92	63.017	Stegastes_partitus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.865	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	94	93.865	Sus_scrofa
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	79	53.446	ENSTRUG00000000966	skiv2l	92	53.641	Takifugu_rubripes
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.209	ENSTNIG00000004382	skiv2l	92	62.209	Tetraodon_nigroviridis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.365	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	94	91.365	Tursiops_truncatus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.620	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	94	93.620	Ursus_americanus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	87	93.796	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	94	93.796	Ursus_maritimus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	93.374	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	93	93.374	Vulpes_vulpes
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	60.292	ENSXETG00000010932	skiv2l	94	60.292	Xenopus_tropicalis
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	ENSXCOG00000019517	skiv2l	90	62.699	Xiphophorus_couchianus
ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.577	ENSXMAG00000014079	skiv2l	93	62.577	Xiphophorus_maculatus