EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000006116 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16610 bases
Position: chrGeneScaffold_711:82681-99290
Accession: 24085
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000005254	MMR_HSR1	PF01926.23	4.2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000006106	SRPRB-201	810	-	ENSTBEP00000005254	269 (aa)	-	UPI0000F5EE6B

Gene Model

Click here to download ENSTBEG00000006116's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTBEG00000006116's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.591	ENSG00000144867	SRPRB	99	93.082	Homo_sapiens
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSANAG00000028236	SRPRB	93	90.514	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	90.335	ENSBTAG00000044075	SRPRB	91	89.219	Bos_taurus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSCJAG00000002845	SRPRB	93	90.514	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSCAFG00020027568	SRPRB	99	88.476	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSCHIG00000019717	SRPRB	99	88.848	Capra_hircus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	85.821	ENSTSYG00000031948	SRPRB	99	85.821	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	79.026	ENSCPOG00000030107	SRPRB	93	79.842	Cavia_porcellus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	98	88.258	ENSCCAG00000033027	SRPRB	93	88.933	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSCATG00000033438	SRPRB	93	91.304	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.015	ENSCLAG00000002810	SRPRB	93	88.538	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSCSAG00000010699	SRPRB	93	91.304	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	97	81.609	ENSCHOG00000011792	SRPRB	93	82.072	Choloepus_hoffmanni
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	74.721	ENSCANG00000043327	SRPRB	92	74.803	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.060	ENSCGRG00001018121	Srprb	94	89.723	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000006116	SRPRB	96	88.760	ENSCGRG00000014367	Srprb	97	89.723	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.060	ENSDNOG00000032146	SRPRB	94	89.370	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	86	83.913	ENSDORG00000000764	Srprb	85	86.697	Dipodomys_ordii
ENSTBEG00000006116	SRPRB	94	90.909	ENSEASG00005003967	SRPRB	93	90.909	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	94	90.909	ENSECAG00000036666	SRPRB	93	90.909	Equus_caballus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSFCAG00000037571	SRPRB	85	90.909	Felis_catus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.764	ENSFDAG00000017529	SRPRB	93	90.119	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	90.335	ENSGGOG00000027849	SRPRB	99	89.963	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000006116	SRPRB	94	88.933	ENSHGLG00000016818	SRPRB	93	88.933	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000006116	SRPRB	94	88.933	ENSHGLG00100018893	SRPRB	93	88.933	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	82.156	ENSSTOG00000022718	SRPRB	99	81.413	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSMFAG00000039758	SRPRB	93	91.304	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSMMUG00000008918	SRPRB	93	91.304	Macaca_mulatta
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSMNEG00000032832	SRPRB	93	91.304	Macaca_nemestrina
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSMLEG00000035589	SRPRB	93	91.304	Mandrillus_leucophaeus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.433	ENSMAUG00000021695	Srprb	94	90.119	Mesocricetus_auratus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.963	ENSMICG00000048959	SRPRB	99	89.219	Microcebus_murinus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	97	83.206	ENSMODG00000018493	SRPRB	94	84.190	Monodelphis_domestica
ENSTBEG00000006116	SRPRB	100	88.848	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	88.848	Mus_caroli
ENSTBEG00000006116	SRPRB	100	88.104	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	88.104	Mus_musculus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	100	88.104	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	88.104	Mus_pahari
ENSTBEG00000006116	SRPRB	100	87.361	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	87.361	Mus_spretus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	86.989	ENSMPUG00000009687	SRPRB	99	86.617	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000006116	SRPRB	98	88.258	ENSNGAG00000024311	-	94	88.933	Nannospalax_galili
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSNLEG00000003655	SRPRB	93	90.514	Nomascus_leucogenys
ENSTBEG00000006116	SRPRB	94	87.747	ENSODEG00000018092	SRPRB	93	87.747	Octodon_degus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	90.335	ENSOCUG00000007623	SRPRB	99	89.591	Oryctolagus_cuniculus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.848	ENSOGAG00000005243	SRPRB	99	88.104	Otolemur_garnettii
ENSTBEG00000006116	SRPRB	86	89.130	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	91.743	Ovis_aries
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.591	ENSPPAG00000023940	SRPRB	99	89.219	Pan_paniscus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSPPRG00000023305	SRPRB	93	90.909	Panthera_pardus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSPTIG00000007351	SRPRB	93	90.514	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.591	ENSPTRG00000015413	SRPRB	99	89.219	Pan_troglodytes
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.591	ENSPANG00000023015	SRPRB	93	90.909	Papio_anubis
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.806	ENSPEMG00000017954	Srprb	99	87.313	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.591	ENSPPYG00000014115	SRPRB	99	89.219	Pongo_abelii
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	79.851	ENSPCAG00000013823	SRPRB	99	79.851	Procavia_capensis
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.219	ENSPVAG00000011319	SRPRB	93	90.909	Pteropus_vampyrus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	98	90.530	ENSRBIG00000027819	SRPRB	93	91.304	Rhinopithecus_bieti
ENSTBEG00000006116	SRPRB	98	90.530	ENSRROG00000030536	SRPRB	93	91.304	Rhinopithecus_roxellana
ENSTBEG00000006116	SRPRB	74	85.930	ENSSBOG00000015129	SRPRB	91	87.978	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	87.732	ENSSARG00000012943	SRPRB	99	87.361	Sorex_araneus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	87.732	ENSSSCG00000011639	SRPRB	99	86.989	Sus_scrofa
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	81.413	ENSTTRG00000007802	SRPRB	99	80.669	Tursiops_truncatus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.764	ENSUAMG00000018135	SRPRB	93	90.119	Ursus_americanus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.390	ENSUMAG00000015817	SRPRB	93	89.723	Ursus_maritimus
ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	89.591	ENSVVUG00000005707	SRPRB	99	88.848	Vulpes_vulpes