EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000007848 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 84766 bases
Position: chrGeneScaffold_600:90-84855
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000006808	IBN_N	PF03810.19	4.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000007872	TNPO1-201	2697	-	ENSTBEP00000006808	898 (aa)	-	UPI0000F5E63B

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	94.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000007848	TNPO1	73	94.667	ENSACIG00000003711	tnpo1	85	94.667	Amphilophus_citrinellus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSAOCG00000008154	tnpo1	87	94.667	Amphiprion_ocellaris
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	94.667	Amphiprion_percula
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	ENSATEG00000010408	tnpo1	87	93.333	Anabas_testudineus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSAPLG00000009619	-	87	98.667	Anas_platyrhynchos
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSACAG00000009599	TNPO1	87	98.667	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	77	96.000	ENSANAG00000025351	-	79	96.000	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000007848	TNPO1	74	70.667	ENSANAG00000027118	-	81	70.667	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSANAG00000022453	-	86	100.000	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSACLG00000027223	tnpo1	87	94.667	Astatotilapia_calliptera
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.333	Astyanax_mexicanus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSBTAG00000007979	TNPO1	87	100.000	Bos_taurus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	100.000	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCAFG00000008081	TNPO1	91	100.000	Canis_familiaris
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCAFG00020017397	TNPO1	87	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCHIG00000023462	TNPO1	87	100.000	Capra_hircus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSTSYG00000001871	TNPO1	89	98.667	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	100.000	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCATG00000043792	TNPO1	87	100.000	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCSAG00000015616	TNPO1	86	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	81	100.000	ENSCHOG00000001746	TNPO1	85	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	98.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	80.000	ENSCSAVG00000010981	-	88	80.000	Ciona_savignyi
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCANG00000004353	TNPO1	86	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	91	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	92.000	ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	92.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	93.333	Cyprinodon_variegatus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	92.000	ENSDARG00000035390	tnpo1	87	92.000	Danio_rerio
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSDNOG00000006647	TNPO1	86	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	83	100.000	ENSDORG00000006476	Tnpo1	90	100.000	Dipodomys_ordii
ENSTBEG00000007848	TNPO1	84	51.073	FBgn0035693	CG8219	78	60.043	Drosophila_melanogaster
ENSTBEG00000007848	TNPO1	72	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	75	99.625	Echinops_telfairi
ENSTBEG00000007848	TNPO1	85	75.000	ENSEBUG00000001895	tnpo1	90	75.000	Eptatretus_burgeri
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSEASG00005018055	TNPO1	87	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSECAG00000024424	TNPO1	86	100.000	Equus_caballus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	89.333	ENSELUG00000002821	tnpo1	87	89.333	Esox_lucius
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSFCAG00000013181	TNPO1	87	100.000	Felis_catus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSFALG00000010292	TNPO1	87	98.667	Ficedula_albicollis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	100.000	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	94.667	Fundulus_heteroclitus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	92.000	ENSGMOG00000000347	tnpo1	87	92.000	Gadus_morhua
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSGALG00000015014	TNPO1	87	98.667	Gallus_gallus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	94.667	Gambusia_affinis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSGACG00000015841	tnpo1	86	94.667	Gasterosteus_aculeatus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	98.667	Gopherus_agassizii
ENSTBEG00000007848	TNPO1	84	93.220	ENSGGOG00000022535	-	85	93.220	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSGGOG00000026800	TNPO1	87	100.000	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	94.667	Haplochromis_burtoni
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSHGLG00000000970	-	86	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSHGLG00100017090	-	90	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000007848	TNPO1	78	90.541	ENSHGLG00100000963	-	84	90.541	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	100.000	Jaculus_jaculus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	92.000	ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	92.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	77	93.333	ENSLBEG00000009521	tnpo1	83	93.333	Labrus_bergylta
ENSTBEG00000007848	TNPO1	80	94.667	ENSLACG00000012199	TNPO1	84	94.667	Latimeria_chalumnae
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSLOCG00000011092	tnpo1	84	94.667	Lepisosteus_oculatus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSLAFG00000011796	TNPO1	90	98.667	Loxodonta_africana
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMFAG00000003636	TNPO1	86	100.000	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	98.667	Macaca_mulatta
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMNEG00000044581	TNPO1	86	100.000	Macaca_nemestrina
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMLEG00000030740	TNPO1	86	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	94.667	Mastacembelus_armatus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	94.667	Maylandia_zebra
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	86	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	79	100.000	ENSMICG00000008468	TNPO1	82	100.000	Microcebus_murinus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSTBEG00000007848	TNPO1	73	94.667	ENSMMOG00000005551	tnpo1	85	94.667	Mola_mola
ENSTBEG00000007848	TNPO1	77	98.667	ENSMODG00000001721	TNPO1	64	98.667	Monodelphis_domestica
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	92.000	ENSMALG00000009782	tnpo1	87	92.000	Monopterus_albus
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ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	87	100.000	Mus_musculus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	86	100.000	Mus_pahari
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	86	100.000	Mus_spretus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMPUG00000014387	TNPO1	86	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSMLUG00000016317	TNPO1	91	100.000	Myotis_lucifugus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	87	100.000	Nannospalax_galili
ENSTBEG00000007848	TNPO1	73	94.667	ENSNBRG00000009998	tnpo1	85	94.667	Neolamprologus_brichardi
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSNLEG00000004572	TNPO1	87	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSTBEG00000007848	TNPO1	72	100.000	ENSOPRG00000012390	TNPO1	72	100.000	Ochotona_princeps
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSODEG00000001771	TNPO1	86	98.667	Octodon_degus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSONIG00000011151	tnpo1	86	94.667	Oreochromis_niloticus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	82	98.667	ENSOANG00000015785	TNPO1	90	98.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSOCUG00000013318	TNPO1	90	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	73	93.333	ENSORLG00000003182	tnpo1	85	93.333	Oryzias_latipes
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	ENSORLG00020011559	tnpo1	87	93.333	Oryzias_latipes_hni
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	ENSORLG00015019113	tnpo1	87	93.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	93.333	Oryzias_melastigma
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSOGAG00000000808	TNPO1	86	100.000	Otolemur_garnettii
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSOARG00000005038	TNPO1	73	100.000	Ovis_aries
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSPPAG00000042518	TNPO1	86	100.000	Pan_paniscus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSPPRG00000022336	TNPO1	87	100.000	Panthera_pardus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSPTIG00000018839	TNPO1	87	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000007848	TNPO1	81	90.667	ENSPTRG00000047731	-	86	90.667	Pan_troglodytes
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSPTRG00000016972	TNPO1	87	100.000	Pan_troglodytes
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSPANG00000006074	TNPO1	86	100.000	Papio_anubis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSPKIG00000019795	tnpo1	89	94.667	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	98.667	Pelodiscus_sinensis
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	93.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	91	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSPFOG00000011447	tnpo1	87	94.667	Poecilia_formosa
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	94.667	Poecilia_latipinna
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	94.667	Poecilia_mexicana
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	ENSPREG00000020705	tnpo1	87	94.667	Poecilia_reticulata
ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	100.000	ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	100.000	Pongo_abelii
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