EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000011337 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 39031 bases
Position: chrGeneScaffold_1244:66589-105619
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000009830	GTP_EFTU	PF00009.27	1.7e-45	1	1
ENSTBEP00000009830	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.3e-13	1	1
ENSTBEP00000009830	EFG_IV	PF03764.18	3.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000011374	EFTUD2-201	2919	-	ENSTBEP00000009830	972 (aa)	-	UPI0000F5F895

Gene Model

Click here to download ENSTBEG00000011337's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTBEG00000011337's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	ENSG00000108883	EFTUD2	100	99.324	Homo_sapiens
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.934	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	86.728	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	94.136	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	83.436	ENSACIG00000009096	eftud2	100	83.230	Amphilophus_citrinellus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	82.000	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	82.000	Amphiprion_ocellaris
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.037	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	86.831	Amphiprion_percula
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.346	ENSATEG00000000457	eftud2	100	87.140	Anabas_testudineus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	99	88.774	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.774	Anas_platyrhynchos
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.181	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.181	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	94.342	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.934	ENSACLG00000001296	eftud2	100	86.728	Astatotilapia_calliptera
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.387	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	86.285	Astyanax_mexicanus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	93.827	Bos_taurus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	99	65.702	WBGene00001166	eftu-2	99	65.496	Caenorhabditis_elegans
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	94.342	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	94.136	Canis_familiaris
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	94.136	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	93.827	Capra_hircus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.930	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	93.930	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.313	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	93.313	Cavia_aperea
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.313	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	93.313	Cavia_porcellus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	94.342	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	94.342	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.210	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	93.210	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	94.342	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	91	80.631	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.631	Choloepus_hoffmanni
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.107	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	93.107	Chrysemys_picta_bellii
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	72.615	ENSCING00000009372	-	100	72.615	Ciona_intestinalis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	99	73.218	ENSCSAVG00000004985	-	92	93.182	Ciona_savignyi
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	94.342	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	93.827	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	93.827	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.523	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	86.317	Cynoglossus_semilaevis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.934	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	86.728	Cyprinodon_variegatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.714	ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.141	Danio_rerio
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.724	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	93.724	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.724	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	93.724	Dipodomys_ordii
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	70.154	FBgn0039566	CG4849	100	69.641	Drosophila_melanogaster
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	99.259	ENSETEG00000005678	EFTUD2	87	99.259	Echinops_telfairi
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	74	84.423	ENSEBUG00000004047	-	96	79.694	Eptatretus_burgeri
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	94.136	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.033	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	94.033	Equus_caballus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.597	ENSELUG00000017169	eftud2	100	85.597	Esox_lucius
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.033	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	94.033	Felis_catus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.387	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.387	Ficedula_albicollis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.519	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	93.519	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	92	99.259	ENSFHEG00000013479	eftud2	92	99.259	Fundulus_heteroclitus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.905	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	86.317	Gadus_morhua
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.490	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	92.780	Gallus_gallus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	86.626	Gambusia_affinis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.420	ENSGACG00000009163	eftud2	100	86.214	Gasterosteus_aculeatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	94.342	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.831	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	86.626	Haplochromis_burtoni
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.107	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	93.107	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.107	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	93.107	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.700	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	85.700	Hippocampus_comes
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.008	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	86.626	Ictalurus_punctatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.860	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	87.860	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	96	93.590	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	93.590	Jaculus_jaculus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.420	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	86.214	Kryptolebias_marmoratus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	95	86.192	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	86.588	Labrus_bergylta
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	88.889	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	89.414	Latimeria_chalumnae
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	86.728	Lepisosteus_oculatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	93.621	Loxodonta_africana
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	94.342	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	94.342	Macaca_mulatta
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	94.342	Macaca_nemestrina
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	94.342	Mandrillus_leucophaeus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.346	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	87.140	Mastacembelus_armatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.934	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	86.728	Maylandia_zebra
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.505	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.505	Meleagris_gallopavo
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	93.827	Mesocricetus_auratus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	94.342	Microcebus_murinus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.930	ENSMOCG00000009039	-	100	93.930	Microtus_ochrogaster
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	92	75.843	ENSMOCG00000017653	-	90	75.843	Microtus_ochrogaster
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	87.765	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	87.765	Mola_mola
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.930	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	93.930	Monodelphis_domestica
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	86.000	ENSMALG00000014501	eftud2	100	86.000	Monopterus_albus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	93.621	Mus_caroli
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	93.621	Mus_musculus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	93.621	Mus_pahari
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	93.621	Mus_spretus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	97	93.750	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	93.750	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	94.136	Myotis_lucifugus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	93.827	Nannospalax_galili
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.831	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	86.626	Neolamprologus_brichardi
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	97	92.349	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	92.349	Nomascus_leucogenys
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	90.329	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	90.329	Notamacropus_eugenii
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.905	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	85.905	Ochotona_princeps
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	83.735	ENSODEG00000003385	-	96	83.735	Octodon_degus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.901	ENSODEG00000018041	-	100	92.901	Octodon_degus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.934	ENSONIG00000000912	eftud2	100	86.728	Oreochromis_niloticus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	94.136	Oryctolagus_cuniculus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.523	ENSORLG00000003109	eftud2	100	86.523	Oryzias_latipes
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.420	ENSORLG00020009865	eftud2	100	86.420	Oryzias_latipes_hni
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.420	ENSORLG00015002611	eftud2	100	87.908	Oryzias_latipes_hsok
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.078	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	92.078	Otolemur_garnettii
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	93.827	Ovis_aries
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	94.239	Pan_paniscus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	94.136	Panthera_pardus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	94.136	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	94.239	Pan_troglodytes
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	94.342	Papio_anubis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	100.000	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	93	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	94	98.519	ENSPMGG00000007281	eftud2	94	98.519	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	93.827	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.033	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	94.033	Phascolarctos_cinereus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	86.626	Poecilia_formosa
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	86.626	Poecilia_latipinna
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	86.626	Poecilia_mexicana
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.901	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	92.901	Pongo_abelii
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	90.021	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	90.021	Procavia_capensis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	94.239	Propithecus_coquereli
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	89.300	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	89.300	Pteropus_vampyrus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.831	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	86.626	Pundamilia_nyererei
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.626	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	87.140	Pygocentrus_nattereri
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	93.621	Rattus_norvegicus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	94.239	Rhinopithecus_bieti
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	94.239	Rhinopithecus_roxellana
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	91	41.667	YKL173W	SNU114	85	41.667	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	94.342	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	97	93.817	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	93.817	Sarcophilus_harrisii
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.317	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	86.317	Scleropages_formosus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	86.523	Scophthalmus_maximus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.037	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	86.831	Seriola_dumerili
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.140	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	86.934	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.494	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	85.494	Sorex_araneus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.078	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.078	Sphenodon_punctatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.140	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	86.934	Stegastes_partitus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.930	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	93.930	Sus_scrofa
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	84	90.754	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	90.754	Taeniopygia_guttata
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.111	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	85.905	Takifugu_rubripes
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	81.660	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	81.455	Tetraodon_nigroviridis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	93	100.000	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	93	100.000	Tursiops_truncatus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.018	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	93.018	Ursus_americanus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	94.136	Ursus_maritimus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	87	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.136	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	94.136	Vulpes_vulpes
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	97	89.126	ENSXETG00000003394	eftud2	98	89.989	Xenopus_tropicalis
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	81	86.862	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	86.862	Xiphophorus_couchianus
ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	86.626	Xiphophorus_maculatus