EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000013011 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 42212 bases
Position: chrGeneScaffold_4008:52217-94428
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000011261	PRP4	PF08799.11	6.6e-14	1	1
ENSTBEP00000011261	Prp18	PF02840.15	2e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000012999	-	1029	-	ENSTBEP00000011261	342 (aa)	-	UPI0000F60A97

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSG00000165630	PRPF18	79	100.000	Homo_sapiens
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSAPOG00000024177	prpf18	79	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSAMEG00000013591	-	79	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSACIG00000001186	prpf18	79	98.718	Amphilophus_citrinellus
ENSTBEG00000013011	-	77	100.000	ENSAOCG00000006572	prpf18	74	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSAPEG00000004564	prpf18	79	100.000	Amphiprion_percula
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSATEG00000000303	prpf18	79	98.718	Anabas_testudineus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSAPLG00000003387	-	79	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSACAG00000000818	-	80	100.000	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSANAG00000037445	-	80	100.000	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSACLG00000026296	prpf18	79	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSAMXG00000012848	prpf18	80	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSBTAG00000017244	PRPF18	80	100.000	Bos_taurus
ENSTBEG00000013011	-	61	68.000	WBGene00009320	F32B6.3	59	68.000	Caenorhabditis_elegans
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCJAG00000009432	-	80	100.000	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCAFG00000004735	-	79	100.000	Canis_familiaris
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCAFG00020007712	-	79	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCHIG00000000499	-	80	100.000	Capra_hircus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSTSYG00000003517	-	80	100.000	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCPOG00000021069	-	80	100.000	Cavia_porcellus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCCAG00000036822	-	80	100.000	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCATG00000016633	-	77	100.000	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCLAG00000011770	-	80	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCSAG00000013109	-	80	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCPBG00000003100	-	81	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSTBEG00000013011	-	78	83.117	ENSCING00000020481	-	56	83.117	Ciona_intestinalis
ENSTBEG00000013011	-	59	83.117	ENSCSAVG00000010546	-	57	83.117	Ciona_savignyi
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCANG00000034900	-	80	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCGRG00001023665	Prpf18	79	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCGRG00000014690	Prpf18	79	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSCSEG00000005536	prpf18	79	98.718	Cynoglossus_semilaevis
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSCVAG00000012401	prpf18	80	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSDARG00000058306	prpf18	80	100.000	Danio_rerio
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSDNOG00000035607	-	79	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSDORG00000000858	Prpf18	79	100.000	Dipodomys_ordii
ENSTBEG00000013011	-	78	90.667	FBgn0027784	Prp18	77	90.667	Drosophila_melanogaster
ENSTBEG00000013011	-	79	95.855	ENSETEG00000015060	-	79	95.855	Echinops_telfairi
ENSTBEG00000013011	-	79	93.590	ENSEBUG00000016502	prpf18	79	93.590	Eptatretus_burgeri
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSEASG00005019373	-	80	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSECAG00000006997	PRPF18	80	100.000	Equus_caballus
ENSTBEG00000013011	-	72	100.000	ENSEEUG00000001171	-	78	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSELUG00000022190	prpf18	80	98.718	Esox_lucius
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSFCAG00000004436	-	80	100.000	Felis_catus
ENSTBEG00000013011	-	72	100.000	ENSFALG00000001912	-	76	100.000	Ficedula_albicollis
ENSTBEG00000013011	-	65	79.487	ENSFDAG00000010713	-	62	79.487	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000013011	-	65	100.000	ENSFDAG00000014026	-	70	100.000	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000013011	-	59	97.436	ENSFHEG00000020125	prpf18	72	97.436	Fundulus_heteroclitus
ENSTBEG00000013011	-	79	94.805	ENSGMOG00000012210	prpf18	79	94.805	Gadus_morhua
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSGALG00000043593	-	80	100.000	Gallus_gallus
ENSTBEG00000013011	-	79	97.436	ENSGAFG00000006034	prpf18	79	97.436	Gambusia_affinis
ENSTBEG00000013011	-	79	97.436	ENSGACG00000012232	prpf18	79	97.436	Gasterosteus_aculeatus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSGAGG00000016878	-	80	100.000	Gopherus_agassizii
ENSTBEG00000013011	-	72	100.000	ENSGGOG00000025188	-	75	100.000	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSHBUG00000010264	prpf18	80	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSHGLG00000018534	PRPF18	79	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000013011	-	65	100.000	ENSHGLG00100012161	-	68	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSHCOG00000015987	prpf18	79	98.718	Hippocampus_comes
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSIPUG00000007432	prpf18	80	100.000	Ictalurus_punctatus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSSTOG00000008735	-	80	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSKMAG00000012124	prpf18	83	98.718	Kryptolebias_marmoratus
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ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSLACG00000009885	prpf18	80	100.000	Latimeria_chalumnae
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ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSMFAG00000000540	-	80	100.000	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSMMUG00000015071	PRPF18	80	100.000	Macaca_mulatta
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ENSTBEG00000013011	-	75	84.615	ENSMODG00000016902	-	72	84.615	Monodelphis_domestica
ENSTBEG00000013011	-	74	98.718	ENSMALG00000005486	prpf18	79	98.718	Monopterus_albus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0023143	Prpf18	100	100.000	Mus_caroli
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSMUSG00000039449	Prpf18	100	100.000	Mus_musculus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	MGP_PahariEiJ_G0019203	Prpf18	100	100.000	Mus_pahari
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0024061	Prpf18	100	100.000	Mus_spretus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSMPUG00000000938	-	79	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSMLUG00000009200	-	79	100.000	Myotis_lucifugus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSNGAG00000012500	-	79	100.000	Nannospalax_galili
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSNBRG00000001778	prpf18	79	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSNLEG00000012186	-	80	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSTBEG00000013011	-	79	76.923	ENSMEUG00000005032	-	80	76.923	Notamacropus_eugenii
ENSTBEG00000013011	-	56	60.622	ENSOPRG00000002153	-	73	60.622	Ochotona_princeps
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSODEG00000003770	-	79	100.000	Octodon_degus
ENSTBEG00000013011	-	77	98.592	ENSONIG00000014854	prpf18	75	98.592	Oreochromis_niloticus
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSOANG00000015404	-	80	98.718	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSOCUG00000027756	-	67	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSORLG00000010293	prpf18	80	98.718	Oryzias_latipes
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSORLG00020001530	prpf18	80	98.718	Oryzias_latipes_hni
ENSTBEG00000013011	-	79	98.718	ENSORLG00015013705	prpf18	80	98.718	Oryzias_latipes_hsok
ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSOMEG00000009167	prpf18	79	100.000	Oryzias_melastigma
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ENSTBEG00000013011	-	79	100.000	ENSOARG00000006243	-	80	100.000	Ovis_aries
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