EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000016514 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31818 bases
Position: chrGeneScaffold_2409:139175-170992
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000014366	PAZ	PF02170.22	8.8e-29	1	1
ENSTBEP00000014366	Piwi	PF02171.17	2.2e-83	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000016528	AGO1-201	2160	-	ENSTBEP00000014366	720 (aa)	-	UPI0000F5FA64

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTBEG00000016514	AGO1	73	84.000	ENSTBEG00000003401	-	77	84.000
ENSTBEG00000016514	AGO1	88	87.261	ENSTBEG00000016565	AGO3	75	87.261
ENSTBEG00000016514	AGO1	80	79.732	ENSTBEG00000016478	AGO4	68	79.732

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSG00000092847	AGO1	89	99.423	Homo_sapiens
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSAPOG00000024299	ago1	84	97.512	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSAMEG00000000504	AGO1	84	99.445	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000016514	AGO1	85	90.701	ENSACIG00000005298	ago1	85	90.701	Amphilophus_citrinellus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSAOCG00000017727	ago1	84	96.671	Amphiprion_ocellaris
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSAPEG00000004458	ago1	85	96.671	Amphiprion_percula
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSATEG00000008523	ago1	84	96.671	Anabas_testudineus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	92.138	ENSAPLG00000010440	AGO1	83	92.138	Anas_platyrhynchos
ENSTBEG00000016514	AGO1	96	99.278	ENSACAG00000029174	AGO1	89	99.278	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSANAG00000037711	AGO1	84	99.445	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.533	ENSACLG00000000890	ago1	84	96.533	Astatotilapia_calliptera
ENSTBEG00000016514	AGO1	83	98.157	ENSAMXG00000001917	ago1	85	98.157	Astyanax_mexicanus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.307	ENSBTAG00000012253	AGO1	84	99.307	Bos_taurus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCJAG00000032023	AGO1	84	99.445	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCAFG00000003443	AGO1	84	99.445	Canis_familiaris
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCAFG00020009251	AGO1	85	99.445	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	98.890	ENSCHIG00000011848	-	84	98.347	Capra_hircus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	79.889	ENSTSYG00000032426	-	87	80.360	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSTSYG00000009767	-	85	99.445	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000016514	AGO1	88	91.603	ENSCAPG00000010228	AGO1	81	90.513	Cavia_aperea
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCPOG00000011568	AGO1	84	99.445	Cavia_porcellus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCCAG00000011823	AGO1	84	99.445	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCATG00000031521	AGO1	89	99.423	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCLAG00000011507	AGO1	85	99.445	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCSAG00000001091	AGO1	84	99.445	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000016514	AGO1	84	90.780	ENSCHOG00000011591	AGO1	71	90.780	Choloepus_hoffmanni
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.307	ENSCPBG00000018594	AGO1	84	99.307	Chrysemys_picta_bellii
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCANG00000039798	AGO1	84	99.445	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCGRG00001022708	Ago1	84	99.445	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSCGRG00000010386	Ago1	85	99.445	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	94.701	ENSCSEG00000001051	ago1	85	94.701	Cynoglossus_semilaevis
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSCVAG00000018173	ago1	84	96.671	Cyprinodon_variegatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.810	ENSDARG00000092644	ago1	84	96.810	Danio_rerio
ENSTBEG00000016514	AGO1	96	99.423	ENSDNOG00000008077	AGO1	89	99.423	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000016514	AGO1	88	99.051	ENSDORG00000008494	Ago1	81	99.841	Dipodomys_ordii
ENSTBEG00000016514	AGO1	94	92.582	ENSETEG00000007626	AGO1	93	92.582	Echinops_telfairi
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSEASG00005012086	AGO1	84	99.445	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSECAG00000024353	AGO1	84	99.445	Equus_caballus
ENSTBEG00000016514	AGO1	97	89.971	ENSEEUG00000005349	AGO1	81	89.971	Erinaceus_europaeus
ENSTBEG00000016514	AGO1	96	96.537	ENSELUG00000016803	ago1	89	96.537	Esox_lucius
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSFCAG00000000746	AGO1	84	99.445	Felis_catus
ENSTBEG00000016514	AGO1	96	90.647	ENSFALG00000000790	AGO1	89	90.647	Ficedula_albicollis
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSFDAG00000017210	AGO1	84	99.445	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	92.094	ENSFHEG00000017927	ago1	85	92.094	Fundulus_heteroclitus
ENSTBEG00000016514	AGO1	91	82.576	ENSGMOG00000019413	ago1	88	82.576	Gadus_morhua
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.307	ENSGALG00000002249	AGO1	84	99.307	Gallus_gallus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSGAFG00000009775	ago1	84	96.671	Gambusia_affinis
ENSTBEG00000016514	AGO1	91	96.677	ENSGACG00000012443	ago1	88	96.677	Gasterosteus_aculeatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	96	99.278	ENSGAGG00000012893	-	89	99.278	Gopherus_agassizii
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSGGOG00000003316	AGO1	84	99.445	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.533	ENSHBUG00000010459	ago1	84	96.533	Haplochromis_burtoni
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSHGLG00000011540	AGO1	84	99.445	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSHGLG00100005568	AGO1	84	99.445	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSHCOG00000005708	ago1	85	96.671	Hippocampus_comes
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.394	ENSIPUG00000023216	ago1	84	96.394	Ictalurus_punctatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSSTOG00000010857	AGO1	84	99.445	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSJJAG00000019449	Ago1	84	99.445	Jaculus_jaculus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSKMAG00000019464	ago1	84	96.671	Kryptolebias_marmoratus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSLBEG00000007694	ago1	84	96.671	Labrus_bergylta
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	92.116	ENSLACG00000017009	AGO1	85	92.116	Latimeria_chalumnae
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	94.452	ENSLOCG00000000504	AGO1	84	94.452	Lepisosteus_oculatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSLAFG00000010835	AGO1	85	99.445	Loxodonta_africana
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSMFAG00000002846	AGO1	84	99.445	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	94.036	ENSMMUG00000006251	AGO1	86	93.544	Macaca_mulatta
ENSTBEG00000016514	AGO1	96	99.423	ENSMNEG00000028881	AGO1	89	99.423	Macaca_nemestrina
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSMLEG00000038388	AGO1	84	99.445	Mandrillus_leucophaeus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSMAMG00000008381	ago1	84	96.671	Mastacembelus_armatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.533	ENSMZEG00005007996	ago1	84	96.533	Maylandia_zebra
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	93.251	ENSMGAG00000003822	AGO1	84	93.251	Meleagris_gallopavo
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSMAUG00000015189	Ago1	84	99.445	Mesocricetus_auratus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSMICG00000016147	AGO1	84	99.445	Microcebus_murinus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.307	ENSMOCG00000000537	Ago1	84	99.307	Microtus_ochrogaster
ENSTBEG00000016514	AGO1	83	98.003	ENSMMOG00000018459	ago1	84	98.003	Mola_mola
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.168	ENSMODG00000023335	AGO1	84	99.168	Monodelphis_domestica
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.533	ENSMALG00000011057	ago1	86	96.255	Monopterus_albus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	84	99.445	Mus_caroli
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSMUSG00000041530	Ago1	84	99.445	Mus_musculus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	84	99.445	Mus_pahari
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	84	99.445	Mus_spretus
ENSTBEG00000016514	AGO1	87	99.364	ENSMPUG00000014872	AGO1	88	99.364	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000016514	AGO1	67	99.379	ENSMLUG00000009628	AGO1	92	99.379	Myotis_lucifugus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSNGAG00000017448	Ago1	84	99.445	Nannospalax_galili
ENSTBEG00000016514	AGO1	96	96.537	ENSNBRG00000010867	ago1	89	96.537	Neolamprologus_brichardi
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSNLEG00000011181	AGO1	84	99.445	Nomascus_leucogenys
ENSTBEG00000016514	AGO1	95	88.613	ENSMEUG00000013429	AGO1	87	88.613	Notamacropus_eugenii
ENSTBEG00000016514	AGO1	91	98.750	ENSOPRG00000012325	AGO1	77	98.750	Ochotona_princeps
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSODEG00000005321	AGO1	84	99.445	Octodon_degus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.533	ENSONIG00000016345	ago1	85	96.533	Oreochromis_niloticus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	88.919	ENSOANG00000002080	AGO1	84	90.055	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.307	ENSOCUG00000023116	AGO1	84	99.307	Oryctolagus_cuniculus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSORLG00000014965	ago1	84	96.671	Oryzias_latipes
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSORLG00020018253	ago1	84	96.671	Oryzias_latipes_hni
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSORLG00015003287	ago1	84	96.671	Oryzias_latipes_hsok
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSOMEG00000020528	ago1	84	96.671	Oryzias_melastigma
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSOGAG00000010279	AGO1	84	99.445	Otolemur_garnettii
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.307	ENSOARG00000019591	AGO1	84	99.307	Ovis_aries
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSPPAG00000034838	AGO1	84	99.445	Pan_paniscus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSPPRG00000006475	AGO1	84	99.445	Panthera_pardus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.168	ENSPTIG00000020991	AGO1	84	99.168	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSPTRG00000000528	AGO1	84	99.445	Pan_troglodytes
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSPANG00000009060	AGO1	84	99.445	Papio_anubis
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	98.613	ENSPSIG00000017482	AGO1	86	98.613	Pelodiscus_sinensis
ENSTBEG00000016514	AGO1	83	97.320	ENSPMGG00000024099	ago1	85	97.320	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSPEMG00000023313	Ago1	84	99.445	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.168	ENSPCIG00000000172	AGO1	84	99.168	Phascolarctos_cinereus
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSPFOG00000005867	ago1	84	96.671	Poecilia_formosa
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSPLAG00000002824	ago1	87	97.674	Poecilia_latipinna
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSPMEG00000001787	ago1	87	97.674	Poecilia_mexicana
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	ENSPREG00000006534	ago1	84	96.671	Poecilia_reticulata
ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	ENSPPYG00000001551	AGO1	84	99.445	Pongo_abelii
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