EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000017333 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: FUBP1
Alias: FBP|FUBP
Full Name: far upstream element binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35133 bases
Position: chrGeneScaffold_4866:155822-190954
Accession: 4004
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000015082	KH_1	PF00013.29	5.6e-49	1	3
ENSTBEP00000015082	KH_1	PF00013.29	5.6e-49	2	3
ENSTBEP00000015082	KH_1	PF00013.29	5.6e-49	3	3
ENSTBEP00000015082	KH_2	PF07650.17	1.1e-16	1	1
ENSTBEP00000015082	DUF1897	PF09005.10	7.5e-12	1	2
ENSTBEP00000015082	DUF1897	PF09005.10	7.5e-12	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000017344	FUBP1-201	1848	-	ENSTBEP00000015082	615 (aa)	-	UPI0000F5F499

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSG00000162613	FUBP1	82	100.000	Homo_sapiens
ENSTBEG00000017333	FUBP1	64	88.095	ENSAPOG00000014845	fubp1	77	82.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSAMEG00000007372	FUBP1	82	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSACIG00000020024	fubp1	77	82.738	Amphilophus_citrinellus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	53	88.095	ENSAPEG00000012232	fubp1	77	82.143	Amphiprion_percula
ENSTBEG00000017333	FUBP1	64	88.095	ENSATEG00000018619	fubp1	78	82.143	Anabas_testudineus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	99.405	ENSAPLG00000005965	FUBP1	87	99.405	Anas_platyrhynchos
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSACAG00000006310	FUBP1	80	100.000	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSACLG00000006708	fubp1	78	82.738	Astatotilapia_calliptera
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCJAG00000007062	FUBP1	82	100.000	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSCAFG00000020361	FUBP1	82	100.000	Canis_familiaris
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSTSYG00000000148	FUBP1	87	100.000	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCPOG00000002757	FUBP1	82	100.000	Cavia_porcellus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCCAG00000036537	FUBP1	78	100.000	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCATG00000042126	FUBP1	82	100.000	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCLAG00000005621	FUBP1	82	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSCSAG00000001402	FUBP1	82	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCHOG00000008177	FUBP1	82	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCGRG00001007103	Fubp1	83	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSCGRG00000003372	Fubp1	87	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	80.952	ENSCSEG00000021412	fubp1	78	80.357	Cynoglossus_semilaevis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.095	ENSCVAG00000014487	fubp1	74	87.500	Cyprinodon_variegatus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	60	81.609	ENSDARG00000029248	fubp1	78	83.908	Danio_rerio
ENSTBEG00000017333	FUBP1	57	77.381	ENSDNOG00000034565	-	71	77.381	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSDORG00000016534	Fubp1	83	100.000	Dipodomys_ordii
ENSTBEG00000017333	FUBP1	56	100.000	ENSETEG00000000948	-	56	100.000	Echinops_telfairi
ENSTBEG00000017333	FUBP1	54	100.000	ENSEEUG00000001287	FUBP1	69	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	61	80.588	ENSELUG00000007990	fubp1	79	80.588	Esox_lucius
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	99.405	ENSFALG00000005768	FUBP1	80	99.405	Ficedula_albicollis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	99.405	ENSFDAG00000014210	FUBP1	82	99.405	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSFHEG00000005230	fubp1	80	82.716	Fundulus_heteroclitus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	63	82.119	ENSGMOG00000003370	fubp1	75	81.457	Gadus_morhua
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	98.817	ENSGALG00000008939	FUBP1	87	98.817	Gallus_gallus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSGAFG00000020972	fubp1	78	82.738	Gambusia_affinis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	85.030	ENSGACG00000016563	fubp1	78	84.118	Gasterosteus_aculeatus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSHBUG00000009835	fubp1	78	82.738	Haplochromis_burtoni
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSHGLG00000008415	-	82	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000017333	FUBP1	66	95.726	ENSHGLG00000002808	-	84	95.726	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSHGLG00100003417	-	82	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000017333	FUBP1	66	95.726	ENSHGLG00100001414	-	84	95.726	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	83.529	ENSHCOG00000000910	fubp1	79	84.118	Hippocampus_comes
ENSTBEG00000017333	FUBP1	60	88.690	ENSIPUG00000009896	fubp1	78	86.905	Ictalurus_punctatus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSSTOG00000014312	FUBP1	82	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	99.405	ENSJJAG00000020069	Fubp1	82	99.405	Jaculus_jaculus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSKMAG00000018897	fubp1	78	82.738	Kryptolebias_marmoratus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	87.500	ENSLBEG00000012700	fubp1	81	81.548	Labrus_bergylta
ENSTBEG00000017333	FUBP1	57	89.286	ENSLOCG00000003745	fubp1	79	86.905	Lepisosteus_oculatus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSLAFG00000003273	FUBP1	86	100.000	Loxodonta_africana
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSMFAG00000031825	FUBP1	82	100.000	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSMMUG00000002899	FUBP1	82	100.000	Macaca_mulatta
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSMNEG00000045212	FUBP1	83	99.405	Macaca_nemestrina
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSMAMG00000007489	fubp1	78	82.738	Mastacembelus_armatus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSMZEG00005024298	fubp1	78	82.738	Maylandia_zebra
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	98.817	ENSMGAG00000009424	FUBP1	87	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSMAUG00000016428	Fubp1	82	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSMOCG00000014751	Fubp1	83	100.000	Microtus_ochrogaster
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ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0026693	Fubp1	83	100.000	Mus_spretus
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ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	99.405	ENSNLEG00000009772	FUBP1	82	99.405	Nomascus_leucogenys
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ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSOPRG00000001175	FUBP1	77	100.000	Ochotona_princeps
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSODEG00000002600	-	82	100.000	Octodon_degus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	70.470	ENSODEG00000003657	-	70	70.470	Octodon_degus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSONIG00000018381	fubp1	76	82.738	Oreochromis_niloticus
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ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	85.714	ENSORLG00000003540	fubp1	76	79.762	Oryzias_latipes
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	85.714	ENSORLG00020005908	fubp1	77	79.762	Oryzias_latipes_hni
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	85.714	ENSORLG00015008779	fubp1	78	79.762	Oryzias_latipes_hsok
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	85.714	ENSOMEG00000021943	fubp1	77	79.762	Oryzias_melastigma
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSOGAG00000014233	FUBP1	82	100.000	Otolemur_garnettii
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSOARG00000013259	FUBP1	82	100.000	Ovis_aries
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSPPRG00000000413	FUBP1	82	100.000	Panthera_pardus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSPTIG00000019450	FUBP1	82	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSPSIG00000012965	FUBP1	86	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	61	86.826	ENSPMGG00000009060	fubp1	78	84.524	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSPEMG00000021802	Fubp1	83	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSPFOG00000000238	fubp1	78	82.738	Poecilia_formosa
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	87.500	ENSPLAG00000021170	fubp1	77	82.738	Poecilia_latipinna
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSPMEG00000004747	fubp1	76	82.738	Poecilia_mexicana
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	88.690	ENSPREG00000017911	fubp1	78	84.091	Poecilia_reticulata
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSPCAG00000012617	FUBP1	82	100.000	Procavia_capensis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSPCOG00000024974	FUBP1	82	100.000	Propithecus_coquereli
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSPVAG00000014637	FUBP1	82	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	64	88.690	ENSPNYG00000004552	fubp1	80	82.738	Pundamilia_nyererei
ENSTBEG00000017333	FUBP1	60	82.659	ENSPNAG00000016207	fubp1	80	85.549	Pygocentrus_nattereri
ENSTBEG00000017333	FUBP1	65	100.000	ENSRNOG00000043370	Fubp1	82	100.000	Rattus_norvegicus
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ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	99.405	ENSRROG00000043534	FUBP1	82	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSSBOG00000027299	FUBP1	84	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSTBEG00000017333	FUBP1	59	86.310	ENSSFOG00015010213	fubp1	77	84.524	Scleropages_formosus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	62	87.500	ENSSMAG00000012029	fubp1	76	81.548	Scophthalmus_maximus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	64	88.095	ENSSDUG00000007383	fubp1	77	82.143	Seriola_dumerili
ENSTBEG00000017333	FUBP1	64	88.095	ENSSLDG00000022863	fubp1	79	82.143	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTBEG00000017333	FUBP1	67	100.000	ENSSARG00000011730	FUBP1	67	100.000	Sorex_araneus
ENSTBEG00000017333	FUBP1	66	95.726	ENSSPUG00000008389	FUBP1	79	95.726	Sphenodon_punctatus
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