EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTBEG00000017370 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Tupaia_belangeri
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45987 bases
Position: chrGeneScaffold_1151:36563-82549
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTBEP00000015095	SYF2	PF08231.12	2.2e-22	1	2
ENSTBEP00000015095	SYF2	PF08231.12	2.2e-22	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTBET00000017359	SYF2-201	618	-	ENSTBEP00000015095	206 (aa)	-	UPI0000F5E1D3

Gene Model

Click here to download ENSTBEG00000017370's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTBEG00000017370's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.370	ENSG00000117614	SYF2	100	70.782	Homo_sapiens
ENSTBEG00000017370	SYF2	89	62.162	ENSAPOG00000001174	syf2	100	59.259	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTBEG00000017370	SYF2	98	68.182	ENSAMEG00000010115	-	99	68.595	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000017370	SYF2	76	66.667	ENSAMEG00000010134	-	100	67.179	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.225	ENSACIG00000023688	syf2	99	56.225	Amphilophus_citrinellus
ENSTBEG00000017370	SYF2	91	57.522	ENSAOCG00000010912	syf2	69	57.522	Amphiprion_ocellaris
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.671	ENSAOCG00000022046	syf2	98	60.944	Amphiprion_ocellaris
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.671	ENSAPEG00000018858	syf2	92	59.671	Amphiprion_percula
ENSTBEG00000017370	SYF2	87	60.829	ENSATEG00000007745	syf2	100	57.613	Anabas_testudineus
ENSTBEG00000017370	SYF2	79	62.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	63.000	Anas_platyrhynchos
ENSTBEG00000017370	SYF2	81	61.765	ENSACAG00000013653	-	98	62.000	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000017370	SYF2	61	51.534	ENSACAG00000026777	-	98	51.534	Anolis_carolinensis
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSANAG00000032473	SYF2	100	70.370	Aotus_nancymaae
ENSTBEG00000017370	SYF2	89	59.459	ENSACLG00000019916	syf2	100	57.563	Astatotilapia_calliptera
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	58.197	ENSAMXG00000004051	syf2	100	58.197	Astyanax_mexicanus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.204	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	70.763	Bos_taurus
ENSTBEG00000017370	SYF2	83	40.000	WBGene00019402	syf-2	90	39.810	Caenorhabditis_elegans
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.370	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	70.782	Callithrix_jacchus
ENSTBEG00000017370	SYF2	86	62.963	ENSCAFG00000030331	-	92	63.426	Canis_familiaris
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.512	ENSCAFG00000012895	-	100	69.919	Canis_familiaris
ENSTBEG00000017370	SYF2	59	61.635	ENSCAFG00020021094	-	84	61.635	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.512	ENSCAFG00020021091	-	100	69.919	Canis_lupus_dingo
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.136	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	70.588	Capra_hircus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.193	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	71.605	Carlito_syrichta
ENSTBEG00000017370	SYF2	78	68.182	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	68.687	Cavia_aperea
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.082	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	70.492	Cavia_porcellus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.370	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	70.782	Cebus_capucinus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	ENSCATG00000026917	SYF2	100	70.782	Cercocebus_atys
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.311	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	71.721	Chinchilla_lanigera
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	70.782	Chlorocebus_sabaeus
ENSTBEG00000017370	SYF2	74	66.883	ENSCHOG00000005273	-	84	67.532	Choloepus_hoffmanni
ENSTBEG00000017370	SYF2	90	67.411	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	67.249	Chrysemys_picta_bellii
ENSTBEG00000017370	SYF2	84	40.845	ENSCING00000003017	-	89	40.845	Ciona_intestinalis
ENSTBEG00000017370	SYF2	84	39.906	ENSCSAVG00000006627	-	97	39.906	Ciona_savignyi
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	74.762	ENSCANG00000037322	SYF2	100	76.190	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	70.370	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTBEG00000017370	SYF2	77	67.347	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	67.839	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTBEG00000017370	SYF2	87	55.963	ENSCSEG00000000117	syf2	93	55.405	Cynoglossus_semilaevis
ENSTBEG00000017370	SYF2	89	60.633	ENSCVAG00000019543	syf2	100	58.025	Cyprinodon_variegatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	98	59.167	ENSDARG00000004706	syf2	99	59.167	Danio_rerio
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.429	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	71.837	Dasypus_novemcinctus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	ENSDORG00000001274	Syf2	100	70.082	Dipodomys_ordii
ENSTBEG00000017370	SYF2	92	41.739	FBgn0033556	CG12343	99	41.739	Drosophila_melanogaster
ENSTBEG00000017370	SYF2	92	59.211	ENSETEG00000015729	SYF2	99	59.649	Echinops_telfairi
ENSTBEG00000017370	SYF2	77	42.541	ENSEBUG00000015402	syf2	95	42.541	Eptatretus_burgeri
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	67.220	ENSEASG00005004232	-	100	67.635	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.612	ENSEASG00005004224	-	100	71.020	Equus_asinus_asinus
ENSTBEG00000017370	SYF2	95	70.940	ENSECAG00000010440	-	98	71.368	Equus_caballus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.204	ENSECAG00000012023	-	100	70.612	Equus_caballus
ENSTBEG00000017370	SYF2	81	72.515	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	73.099	Erinaceus_europaeus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.836	ENSELUG00000003465	syf2	99	59.836	Esox_lucius
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.325	ENSFCAG00000043095	-	100	70.732	Felis_catus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.388	ENSFCAG00000010324	-	85	69.796	Felis_catus
ENSTBEG00000017370	SYF2	81	60.784	ENSFALG00000000460	SYF2	92	60.870	Ficedula_albicollis
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	70.370	Fukomys_damarensis
ENSTBEG00000017370	SYF2	90	48.430	ENSFHEG00000007238	syf2	99	48.430	Fundulus_heteroclitus
ENSTBEG00000017370	SYF2	86	62.326	ENSGMOG00000019138	syf2	96	62.791	Gadus_morhua
ENSTBEG00000017370	SYF2	90	65.179	ENSGALG00000013639	SYF2	100	61.905	Gallus_gallus
ENSTBEG00000017370	SYF2	98	56.250	ENSGAFG00000019435	syf2	99	56.250	Gambusia_affinis
ENSTBEG00000017370	SYF2	86	60.930	ENSGACG00000007305	syf2	99	57.083	Gasterosteus_aculeatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	90	67.857	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	67.686	Gopherus_agassizii
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	71.193	Gorilla_gorilla
ENSTBEG00000017370	SYF2	93	59.130	ENSHBUG00000020477	syf2	100	57.202	Haplochromis_burtoni
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	70.082	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000017370	SYF2	92	58.407	ENSHGLG00000004304	-	100	58.678	Heterocephalus_glaber_female
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	70.082	Heterocephalus_glaber_male
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	58.025	ENSHCOG00000012904	syf2	78	58.025	Hippocampus_comes
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	60.082	ENSIPUG00000019859	syf2	100	60.082	Ictalurus_punctatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	59	82.540	ENSSTOG00000023984	SYF2	86	83.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	78	67.839	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	68.342	Jaculus_jaculus
ENSTBEG00000017370	SYF2	90	60.965	ENSKMAG00000013856	syf2	96	60.965	Kryptolebias_marmoratus
ENSTBEG00000017370	SYF2	88	61.187	ENSLBEG00000014425	syf2	100	57.202	Labrus_bergylta
ENSTBEG00000017370	SYF2	87	65.138	ENSLACG00000012064	SYF2	92	66.055	Latimeria_chalumnae
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	61.728	ENSLOCG00000002728	syf2	95	61.728	Lepisosteus_oculatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	65	55.000	ENSLAFG00000030814	-	75	59.574	Loxodonta_africana
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.204	ENSLAFG00000023150	-	100	70.612	Loxodonta_africana
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	71.193	Macaca_fascicularis
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	70.782	Macaca_mulatta
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	71.193	Macaca_nemestrina
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	70.782	Mandrillus_leucophaeus
ENSTBEG00000017370	SYF2	87	59.908	ENSMAMG00000010403	syf2	98	57.613	Mastacembelus_armatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	57.202	ENSMZEG00005006429	syf2	100	57.202	Maylandia_zebra
ENSTBEG00000017370	SYF2	78	62.814	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	63.317	Meleagris_gallopavo
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.136	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	69.547	Mesocricetus_auratus
ENSTBEG00000017370	SYF2	78	67.839	ENSMICG00000016191	SYF2	100	68.342	Microcebus_murinus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.370	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	70.782	Microtus_ochrogaster
ENSTBEG00000017370	SYF2	89	59.009	ENSMMOG00000002396	syf2	93	59.009	Mola_mola
ENSTBEG00000017370	SYF2	91	67.105	ENSMODG00000013951	-	99	67.105	Monodelphis_domestica
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.967	ENSMALG00000010706	syf2	100	57.377	Monopterus_albus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	70.370	Mus_caroli
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	70.370	Mus_musculus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	70.370	Mus_pahari
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	70.370	Mus_spretus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.325	ENSMPUG00000015802	-	100	70.732	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	68.699	ENSMPUG00000015801	-	100	69.106	Mustela_putorius_furo
ENSTBEG00000017370	SYF2	97	69.328	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	69.748	Myotis_lucifugus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.732	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	71.138	Nannospalax_galili
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	51.004	ENSNBRG00000010720	syf2	99	51.004	Neolamprologus_brichardi
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	71.193	Nomascus_leucogenys
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	69.959	Ochotona_princeps
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	63.090	ENSODEG00000014338	-	100	63.090	Octodon_degus
ENSTBEG00000017370	SYF2	95	70.386	ENSODEG00000017664	-	98	70.815	Octodon_degus
ENSTBEG00000017370	SYF2	89	59.459	ENSONIG00000008213	syf2	100	57.563	Oreochromis_niloticus
ENSTBEG00000017370	SYF2	80	64.851	ENSOANG00000009552	SYF2	100	64.851	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.721	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	72.131	Oryctolagus_cuniculus
ENSTBEG00000017370	SYF2	92	59.471	ENSORLG00000028820	syf2	97	59.471	Oryzias_latipes
ENSTBEG00000017370	SYF2	89	60.360	ENSORLG00020018333	syf2	94	60.360	Oryzias_latipes_hni
ENSTBEG00000017370	SYF2	87	61.009	ENSORLG00015014665	syf2	92	61.009	Oryzias_latipes_hsok
ENSTBEG00000017370	SYF2	95	59.244	ENSOMEG00000013911	syf2	100	59.244	Oryzias_melastigma
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.311	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	71.721	Otolemur_garnettii
ENSTBEG00000017370	SYF2	76	54.688	ENSOARG00000006269	-	100	54.688	Ovis_aries
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.388	ENSOARG00000006348	-	99	69.796	Ovis_aries
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	71.193	Pan_paniscus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.262	ENSPPRG00000001638	-	99	69.672	Panthera_pardus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.325	ENSPPRG00000001651	-	100	70.732	Panthera_pardus
ENSTBEG00000017370	SYF2	86	70.833	ENSPTIG00000005711	-	81	70.852	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.325	ENSPTIG00000007036	-	100	70.732	Panthera_tigris_altaica
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	71.193	Pan_troglodytes
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSPANG00000008139	SYF2	100	71.193	Papio_anubis
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	60.246	ENSPKIG00000008130	syf2	100	60.246	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTBEG00000017370	SYF2	93	65.502	ENSPSIG00000011816	SYF2	89	65.939	Pelodiscus_sinensis
ENSTBEG00000017370	SYF2	94	59.307	ENSPMGG00000008755	syf2	89	59.307	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	71.605	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTBEG00000017370	SYF2	91	68.889	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	65.200	Phascolarctos_cinereus
ENSTBEG00000017370	SYF2	95	58.798	ENSPFOG00000004116	syf2	95	58.798	Poecilia_formosa
ENSTBEG00000017370	SYF2	95	58.798	ENSPLAG00000006691	syf2	100	58.798	Poecilia_latipinna
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.829	ENSPMEG00000011684	syf2	100	59.574	Poecilia_mexicana
ENSTBEG00000017370	SYF2	86	60.648	ENSPREG00000003009	syf2	97	58.442	Poecilia_reticulata
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.782	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	71.193	Pongo_abelii
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.809	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	59.809	Propithecus_coquereli
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	65.714	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	66.122	Pteropus_vampyrus
ENSTBEG00000017370	SYF2	89	59.459	ENSPNYG00000004979	syf2	100	57.563	Pundamilia_nyererei
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.671	ENSPNAG00000015570	syf2	100	60.082	Pygocentrus_nattereri
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	70.370	Rattus_norvegicus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.421	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	69.835	Rhinopithecus_bieti
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	ENSRROG00000001347	SYF2	100	71.193	Rhinopithecus_roxellana
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.136	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	69.547	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTBEG00000017370	SYF2	91	69.027	ENSSHAG00000015630	-	100	65.462	Sarcophilus_harrisii
ENSTBEG00000017370	SYF2	81	66.505	ENSSHAG00000007152	-	100	66.505	Sarcophilus_harrisii
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	60.494	ENSSFOG00015023647	syf2	100	60.494	Scleropages_formosus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.790	ENSSMAG00000009867	syf2	100	56.790	Scophthalmus_maximus
ENSTBEG00000017370	SYF2	87	60.550	ENSSDUG00000013072	syf2	100	56.379	Seriola_dumerili
ENSTBEG00000017370	SYF2	87	60.550	ENSSLDG00000012677	syf2	100	56.379	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	54.098	ENSSARG00000012889	SYF2	100	54.918	Sorex_araneus
ENSTBEG00000017370	SYF2	93	66.376	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	66.812	Sphenodon_punctatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.790	ENSSPAG00000009626	syf2	100	56.790	Stegastes_partitus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.796	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	70.204	Sus_scrofa
ENSTBEG00000017370	SYF2	73	53.548	ENSTGUG00000001126	SYF2	77	54.088	Taeniopygia_guttata
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	55.556	ENSTRUG00000001499	syf2	89	59.009	Takifugu_rubripes
ENSTBEG00000017370	SYF2	90	57.848	ENSTNIG00000016912	syf2	100	57.848	Tetraodon_nigroviridis
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	71.721	Tursiops_truncatus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.106	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	69.512	Ursus_americanus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.512	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	69.919	Ursus_maritimus
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.902	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	71.311	Vicugna_pacos
ENSTBEG00000017370	SYF2	81	67.805	ENSVVUG00000027181	-	100	65.726	Vulpes_vulpes
ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.512	ENSVVUG00000027175	-	100	69.919	Vulpes_vulpes
ENSTBEG00000017370	SYF2	95	62.661	ENSXETG00000022797	syf2	94	63.090	Xenopus_tropicalis
ENSTBEG00000017370	SYF2	86	60.465	ENSXMAG00000022698	syf2	100	55.967	Xiphophorus_maculatus