EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000000922 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 182423 bases
Position: chr28:4340927-4523349
Accession: 9192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000000943	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	3.1e-35	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000000955	POLR2E-201	426	-	ENSTGUP00000000943	142 (aa)	-	H0YRN4

Gene Model

Click here to download ENSTGUG00000000922's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTGUG00000000922's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	89.286	ENSG00000099817	POLR2E	77	85.106	Homo_sapiens
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSAPOG00000002935	polr2eb	75	84.783	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSAMEG00000003159	POLR2E	66	90.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000000922	POLR2E	96	85.507	ENSACIG00000024371	polr2eb	75	85.507	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSAOCG00000018166	polr2eb	75	84.783	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSAPEG00000009000	polr2eb	66	87.857	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSATEG00000023760	polr2eb	75	84.783	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSANAG00000038488	POLR2E	76	85.816	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSACLG00000005254	polr2eb	75	85.507	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSAMXG00000018915	POLR2E	66	87.857	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSBTAG00000020776	POLR2E	66	90.000	Bos_taurus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	98	69.065	WBGene00019246	rpb-5	65	69.065	Caenorhabditis_elegans
ENSTGUG00000000922	POLR2E	53	97.333	ENSCJAG00000038275	-	96	97.333	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCAFG00000019546	POLR2E	66	90.000	Canis_familiaris
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCAFG00020017111	POLR2E	66	90.000	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCHIG00000014151	POLR2E	66	90.000	Capra_hircus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSTSYG00000026377	POLR2E	74	99.145	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000000922	POLR2E	86	88.525	ENSCAPG00000010843	POLR2E	59	88.525	Cavia_aperea
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCPOG00000001542	POLR2E	66	90.000	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCCAG00000025658	POLR2E	77	85.816	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCATG00000008926	POLR2E	77	85.816	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCLAG00000014874	-	66	90.000	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000000922	POLR2E	98	65.468	ENSCLAG00000009238	-	63	65.468	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCSAG00000012336	POLR2E	66	90.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.714	ENSCPBG00000009702	POLR2E	66	90.714	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	79.433	ENSCING00000024933	-	66	79.433	Ciona_intestinalis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCANG00000025560	POLR2E	77	85.816	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCGRG00001022927	Polr2e	66	90.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSCGRG00000016441	Polr2e	65	90.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	86.429	ENSCSEG00000007107	polr2eb	75	83.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSCVAG00000019940	polr2eb	75	84.783	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	86.429	ENSDARG00000026183	polr2eb	66	86.429	Danio_rerio
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSDNOG00000044994	POLR2E	61	90.000	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSDORG00000001154	Polr2e	66	90.000	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	77.143	FBgn0033571	Rpb5	66	77.143	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	82.143	ENSEBUG00000010159	-	67	82.143	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSECAG00000011124	POLR2E	77	85.816	Equus_caballus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSELUG00000005815	POLR2E	64	94.915	Esox_lucius
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.143	ENSELUG00000020646	polr2e	64	94.068	Esox_lucius
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSFCAG00000007318	POLR2E	77	85.816	Felis_catus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	86	89.344	ENSFALG00000013986	POLR2E	62	89.344	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSFDAG00000014539	POLR2E	66	90.000	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSFHEG00000022398	polr2eb	75	84.783	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSGMOG00000007615	polr2eb	66	87.857	Gadus_morhua
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.714	ENSGALG00000002591	POLR2E	66	90.714	Gallus_gallus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSGAFG00000005087	polr2eb	75	85.507	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.143	ENSGACG00000013247	polr2eb	66	87.143	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.714	ENSGAGG00000008356	POLR2E	66	90.714	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSGGOG00000011267	POLR2E	77	85.816	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000000922	POLR2E	51	69.444	ENSHBUG00000011099	polr2eb	59	62.857	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSHGLG00000013330	POLR2E	66	88.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSHGLG00100011014	POLR2E	66	88.571	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	85.714	ENSHCOG00000000906	polr2eb	75	82.609	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000000922	POLR2E	76	81.481	ENSHCOG00000012099	-	84	81.481	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSIPUG00000019801	polr2e	66	87.857	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSSTOG00000002853	POLR2E	66	90.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSJJAG00000016595	-	66	90.000	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	96	78.261	ENSJJAG00000003145	-	74	78.261	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	98	72.662	ENSJJAG00000015812	-	85	72.662	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSKMAG00000005954	polr2eb	66	87.857	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSLBEG00000024802	polr2eb	75	84.783	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSLACG00000013686	POLR2E	66	87.857	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSLOCG00000004599	POLR2E	86	88.571	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	60.563	ENSLAFG00000025587	POLR2E	66	60.563	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMFAG00000002884	POLR2E	77	85.816	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMMUG00000013927	POLR2E	77	85.816	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMNEG00000034046	-	77	85.816	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	65.000	ENSMNEG00000033452	-	73	65.000	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000000922	POLR2E	87	60.163	ENSMLEG00000012405	POLR2E	54	60.163	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSMAMG00000018703	polr2eb	75	84.783	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSMZEG00005010796	polr2eb	75	85.507	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.652	ENSMGAG00000003769	POLR2E	66	88.652	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000000922	POLR2E	87	87.805	ENSMAUG00000010125	-	63	88.430	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	51.429	ENSMAUG00000011003	-	59	51.429	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMICG00000013063	POLR2E	77	85.816	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMOCG00000013414	Polr2e	66	90.000	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000000922	POLR2E	85	78.512	ENSMMOG00000001167	polr2eb	55	78.512	Mola_mola
ENSTGUG00000000922	POLR2E	96	82.609	ENSMMOG00000001161	polr2eb	75	82.609	Mola_mola
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.714	ENSMODG00000005494	POLR2E	66	90.714	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSMALG00000021888	polr2eb	66	88.571	Monopterus_albus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	66	90.000	Mus_caroli
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMUSG00000004667	Polr2e	66	90.000	Mus_musculus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	66	90.000	Mus_pahari
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	66	90.000	Mus_spretus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMPUG00000008953	POLR2E	66	90.000	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000000922	POLR2E	98	84.892	ENSMLUG00000006376	-	85	84.892	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSMLUG00000013193	POLR2E	66	90.000	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	94	63.910	ENSNGAG00000017344	-	66	63.910	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSNGAG00000001147	Polr2e	66	90.000	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000000922	POLR2E	96	85.507	ENSNBRG00000022772	polr2eb	75	85.507	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000000922	POLR2E	80	80.531	ENSNLEG00000031364	-	64	70.000	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	84.286	ENSNLEG00000001207	-	63	93.913	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	72.143	ENSOPRG00000008331	POLR2E	67	72.143	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	77.857	ENSODEG00000007985	-	74	77.857	Octodon_degus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	85	79.167	ENSODEG00000011490	-	67	79.167	Octodon_degus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSODEG00000013230	-	66	90.000	Octodon_degus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSONIG00000002519	polr2eb	66	87.857	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSORLG00000015346	polr2eb	75	85.507	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSORLG00020020700	polr2e	75	85.507	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSORLG00015016842	polr2e	75	85.507	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSOMEG00000002709	polr2eb	70	87.857	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSOGAG00000012311	POLR2E	66	90.000	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSOARG00000010994	POLR2E	66	90.000	Ovis_aries
ENSTGUG00000000922	POLR2E	85	88.430	ENSPPAG00000003145	POLR2E	74	83.607	Pan_paniscus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSPPRG00000000777	POLR2E	77	85.816	Panthera_pardus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	92	83.077	ENSPTIG00000012237	POLR2E	83	83.077	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSPTRG00000010183	POLR2E	77	85.816	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSPANG00000018011	POLR2E	77	85.816	Papio_anubis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSPKIG00000024123	POLR2E	75	84.783	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.143	ENSPKIG00000009607	POLR2E	64	94.068	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000000922	POLR2E	95	84.444	ENSPSIG00000002870	POLR2E	64	84.444	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	96	84.783	ENSPMGG00000014354	polr2eb	75	84.783	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSPEMG00000023261	Polr2e	66	90.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.714	ENSPCIG00000007312	POLR2E	55	90.714	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSPFOG00000005734	polr2eb	66	88.571	Poecilia_formosa
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSPLAG00000014496	polr2eb	75	85.507	Poecilia_latipinna
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSPMEG00000008053	polr2eb	75	85.507	Poecilia_mexicana
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSPREG00000006489	polr2eb	75	85.507	Poecilia_reticulata
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSPPYG00000009305	POLR2E	66	90.000	Pongo_abelii
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSPCOG00000014491	POLR2E	76	85.816	Propithecus_coquereli
ENSTGUG00000000922	POLR2E	82	99.138	ENSPVAG00000007718	-	55	99.138	Pteropus_vampyrus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSPNYG00000019797	polr2eb	70	88.571	Pundamilia_nyererei
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSPNAG00000026263	POLR2E	75	84.783	Pygocentrus_nattereri
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSRNOG00000013545	Polr2e	66	90.000	Rattus_norvegicus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSRBIG00000028726	-	77	85.816	Rhinopithecus_bieti
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	70.000	ENSRBIG00000027259	-	69	70.000	Rhinopithecus_bieti
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSRROG00000043763	POLR2E	77	85.816	Rhinopithecus_roxellana
ENSTGUG00000000922	POLR2E	98	32.886	YBR154C	RPB5	66	32.886	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSSBOG00000027241	POLR2E	77	85.816	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.714	ENSSHAG00000010690	POLR2E	66	90.714	Sarcophilus_harrisii
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSSFOG00015006073	polr2e	75	84.783	Scleropages_formosus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSSMAG00000012782	polr2eb	73	91.129	Scophthalmus_maximus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSSDUG00000003352	polr2eb	75	84.783	Seriola_dumerili
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSSLDG00000004965	polr2eb	75	84.783	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSSPUG00000006114	POLR2E	66	88.571	Sphenodon_punctatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSSPAG00000017556	polr2eb	75	84.783	Stegastes_partitus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSSSCG00000021472	POLR2E	66	90.000	Sus_scrofa
ENSTGUG00000000922	POLR2E	96	84.783	ENSTRUG00000018238	polr2eb	75	84.783	Takifugu_rubripes
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	ENSTNIG00000013187	polr2eb	66	87.857	Tetraodon_nigroviridis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	89.286	ENSTTRG00000001484	POLR2E	66	89.286	Tursiops_truncatus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSUAMG00000009166	POLR2E	70	91.339	Ursus_americanus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	ENSXETG00000003291	polr2e	66	90.000	Xenopus_tropicalis
ENSTGUG00000000922	POLR2E	96	85.507	ENSXCOG00000009197	polr2eb	75	85.507	Xiphophorus_couchianus
ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	ENSXMAG00000026495	polr2eb	75	85.507	Xiphophorus_maculatus