EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000001126 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3207 bases
Position: chr23:3233843-3237049
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000001159	SYF2	PF08231.12	1.3e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000001171	SYF2-201	597	-	ENSTGUP00000001159	199 (aa)	-	H0YS99

Gene Model

Click here to download ENSTGUG00000001126's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTGUG00000001126's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	ENSG00000117614	SYF2	58	73.504	Homo_sapiens
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	56.364	ENSAPOG00000001174	syf2	63	54.967	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000001126	SYF2	93	57.754	ENSAMEG00000010115	-	61	60.265	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	52.353	ENSACIG00000023688	syf2	60	52.318	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	54.857	ENSAOCG00000022046	syf2	63	54.967	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	54.857	ENSAPEG00000018858	syf2	58	54.967	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000001126	SYF2	78	55.063	ENSATEG00000007745	syf2	63	52.318	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	89.109	ENSAPLG00000016435	SYF2	55	82.727	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	69.608	ENSACAG00000026777	-	63	67.619	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	77.451	ENSACAG00000013653	-	65	62.963	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000001126	SYF2	96	55.440	ENSANAG00000032473	SYF2	58	73.504	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.333	ENSACLG00000019916	syf2	63	52.318	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000001126	SYF2	83	56.886	ENSAMXG00000004051	syf2	71	56.548	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.857	ENSBTAG00000001651	SYF2	63	59.603	Bos_taurus
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	61.491	ENSCJAG00000046570	SYF2	58	73.504	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.500	ENSCAFG00000012895	-	61	60.265	Canis_familiaris
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	52.353	ENSCAFG00000030331	-	65	54.967	Canis_familiaris
ENSTGUG00000001126	SYF2	54	76.852	ENSCAFG00020021094	-	57	76.852	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.500	ENSCAFG00020021091	-	61	60.265	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.857	ENSCHIG00000020874	SYF2	62	59.603	Capra_hircus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	58.857	ENSTSYG00000005114	SYF2	69	62.676	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	79.208	ENSCAPG00000010006	SYF2	53	77.885	Cavia_aperea
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	60.227	ENSCPOG00000005326	SYF2	61	60.265	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000001126	SYF2	96	55.440	ENSCCAG00000022459	SYF2	58	73.504	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	ENSCATG00000026917	SYF2	58	71.795	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	59.887	ENSCLAG00000008474	SYF2	61	60.265	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000001126	SYF2	88	52.000	ENSCHOG00000005273	-	62	72.549	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	61.176	ENSCPBG00000025073	SYF2	60	60.927	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000001126	SYF2	70	58.741	ENSCANG00000037322	SYF2	58	67.327	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	58.235	ENSCGRG00001020733	Syf2	62	58.278	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	76.238	ENSCGRG00000005095	Syf2	50	75.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000001126	SYF2	77	52.258	ENSCSEG00000000117	syf2	62	49.664	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	53.529	ENSCVAG00000019543	syf2	62	52.318	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	88	56.742	ENSDARG00000004706	syf2	63	54.967	Danio_rerio
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	55.172	ENSDNOG00000047605	SYF2	61	58.940	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	61.047	ENSDORG00000001274	Syf2	70	60.694	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000001126	SYF2	72	56.552	ENSETEG00000015729	SYF2	51	58.475	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	57.609	ENSEASG00005004224	-	61	60.927	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	59.770	ENSECAG00000012023	-	61	60.265	Equus_caballus
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	60.947	ENSECAG00000010440	-	62	60.927	Equus_caballus
ENSTGUG00000001126	SYF2	78	52.229	ENSEEUG00000015084	SYF2	78	50.345	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	57.310	ENSELUG00000003465	syf2	63	56.954	Esox_lucius
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	57.500	ENSFCAG00000043095	-	57	74.359	Felis_catus
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	61.176	ENSFCAG00000010324	-	59	61.047	Felis_catus
ENSTGUG00000001126	SYF2	74	69.536	ENSFALG00000000460	SYF2	69	72.674	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	57.627	ENSFDAG00000008310	SYF2	61	58.940	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000001126	SYF2	79	56.688	ENSFHEG00000007238	syf2	62	53.378	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	54.321	ENSGMOG00000019138	syf2	67	52.980	Gadus_morhua
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	66.860	ENSGALG00000013639	SYF2	78	63.366	Gallus_gallus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	51.429	ENSGAFG00000019435	syf2	63	50.993	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	54.938	ENSGACG00000007305	syf2	62	53.642	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	61.765	ENSGAGG00000010670	SYF2	60	61.589	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	ENSGGOG00000012796	SYF2	58	73.504	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.000	ENSHBUG00000020477	syf2	64	52.318	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.192	ENSHGLG00000014393	SYF2	61	58.940	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.192	ENSHGLG00100014722	SYF2	61	58.940	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	57.647	ENSIPUG00000019859	syf2	63	56.291	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	79.208	ENSSTOG00000023984	SYF2	71	77.885	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	55.152	ENSKMAG00000013856	syf2	71	54.118	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	55.828	ENSLBEG00000014425	syf2	63	53.642	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000001126	SYF2	82	58.084	ENSLACG00000012064	SYF2	63	56.954	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000001126	SYF2	99	52.000	ENSLOCG00000002728	syf2	59	56.291	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	75	45.455	ENSLAFG00000030814	-	79	46.259	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	56.897	ENSLAFG00000023150	-	61	58.278	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	ENSMFAG00000041831	SYF2	64	66.165	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	59.627	ENSMMUG00000002968	SYF2	58	71.795	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	ENSMNEG00000030180	SYF2	64	66.165	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	ENSMLEG00000030248	SYF2	58	71.795	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000001126	SYF2	78	55.063	ENSMAMG00000010403	syf2	62	52.318	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.000	ENSMZEG00005006429	syf2	63	52.318	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	89.109	ENSMGAG00000002019	SYF2	55	82.727	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000001126	SYF2	98	52.041	ENSMAUG00000018974	Syf2	62	57.616	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	61.635	ENSMICG00000016191	SYF2	65	73.504	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.523	ENSMOCG00000022938	Syf2	62	58.940	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	52.121	ENSMMOG00000002396	syf2	62	50.993	Mola_mola
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	58.857	ENSMODG00000013951	-	66	57.325	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000001126	SYF2	90	50.543	ENSMALG00000010706	syf2	62	52.632	Monopterus_albus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.302	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	62	59.603	Mus_caroli
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.302	ENSMUSG00000028821	Syf2	62	59.603	Mus_musculus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.302	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	62	59.603	Mus_pahari
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.302	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	62	59.603	Mus_spretus
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	57.000	ENSMPUG00000015802	-	61	60.265	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000001126	SYF2	93	58.602	ENSMPUG00000015801	-	61	59.603	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	59.195	ENSMLUG00000001885	SYF2	61	59.603	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	59.884	ENSNGAG00000007912	Syf2	61	59.603	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	43.529	ENSNBRG00000010720	syf2	62	41.026	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	ENSNLEG00000035185	SYF2	58	73.504	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	57.714	ENSOPRG00000012870	SYF2	61	57.616	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	59.322	ENSODEG00000017664	-	63	60.927	Octodon_degus
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.333	ENSONIG00000008213	syf2	63	51.656	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	80.392	ENSOANG00000009552	SYF2	66	65.185	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	61.491	ENSOCUG00000013050	SYF2	61	60.265	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	56.442	ENSORLG00000028820	syf2	64	54.967	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	56.442	ENSORLG00020018333	syf2	63	54.967	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	54.706	ENSORLG00015014665	syf2	63	54.967	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	53.714	ENSOMEG00000013911	syf2	63	54.305	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.500	ENSOGAG00000009962	SYF2	61	59.603	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.192	ENSOARG00000006348	-	61	58.824	Ovis_aries
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	ENSPPAG00000036579	SYF2	58	73.504	Pan_paniscus
ENSTGUG00000001126	SYF2	98	57.868	ENSPPRG00000001638	-	69	61.047	Panthera_pardus
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	57.500	ENSPPRG00000001651	-	57	74.359	Panthera_pardus
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	58.000	ENSPTIG00000007036	-	57	74.359	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	62.112	ENSPTIG00000005711	-	54	60.927	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	ENSPTRG00000000352	SYF2	58	73.504	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	ENSPANG00000008139	SYF2	64	66.165	Papio_anubis
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	53.143	ENSPKIG00000008130	syf2	63	52.980	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	60.694	ENSPSIG00000011816	SYF2	58	60.265	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.299	ENSPMGG00000008755	syf2	58	52.318	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	58.235	ENSPEMG00000008283	Syf2	62	58.278	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000001126	SYF2	83	62.722	ENSPCIG00000014235	SYF2	60	61.589	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	51.429	ENSPFOG00000004116	syf2	69	52.353	Poecilia_formosa
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	51.429	ENSPLAG00000006691	syf2	72	52.353	Poecilia_latipinna
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.571	ENSPMEG00000011684	syf2	75	53.529	Poecilia_mexicana
ENSTGUG00000001126	SYF2	78	54.430	ENSPREG00000003009	syf2	63	50.993	Poecilia_reticulata
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	52.353	ENSPCOG00000027011	SYF2	50	76.471	Propithecus_coquereli
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.333	ENSPNYG00000004979	syf2	63	52.318	Pundamilia_nyererei
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	58.537	ENSPNAG00000015570	syf2	71	57.059	Pygocentrus_nattereri
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.302	ENSRNOG00000060597	Syf2	62	59.603	Rattus_norvegicus
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	56.571	ENSRBIG00000042970	SYF2	64	62.879	Rhinopithecus_bieti
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	59.429	ENSRROG00000001347	SYF2	64	66.165	Rhinopithecus_roxellana
ENSTGUG00000001126	SYF2	85	59.412	ENSSBOG00000020184	SYF2	58	72.650	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	79.412	ENSSHAG00000007152	-	65	64.444	Sarcophilus_harrisii
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	60.694	ENSSHAG00000015630	-	60	59.603	Sarcophilus_harrisii
ENSTGUG00000001126	SYF2	86	54.857	ENSSFOG00015023647	syf2	63	54.967	Scleropages_formosus
ENSTGUG00000001126	SYF2	79	54.375	ENSSMAG00000009867	syf2	63	51.656	Scophthalmus_maximus
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	55.758	ENSSDUG00000013072	syf2	63	54.305	Seriola_dumerili
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	55.758	ENSSLDG00000012677	syf2	63	54.305	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTGUG00000001126	SYF2	90	56.452	ENSSPUG00000005251	SYF2	59	57.616	Sphenodon_punctatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.939	ENSSPAG00000009626	syf2	63	52.980	Stegastes_partitus
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	60.355	ENSSSCG00000037481	SYF2	61	59.603	Sus_scrofa
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	52.353	ENSTRUG00000001499	syf2	67	52.353	Takifugu_rubripes
ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.333	ENSTNIG00000016912	syf2	67	51.656	Tetraodon_nigroviridis
ENSTGUG00000001126	SYF2	77	54.088	ENSTBEG00000017370	SYF2	73	53.548	Tupaia_belangeri
ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	ENSTTRG00000003550	SYF2	61	59.603	Tursiops_truncatus
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.500	ENSUAMG00000002897	SYF2	61	59.603	Ursus_americanus
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.000	ENSUMAG00000013108	SYF2	61	59.603	Ursus_maritimus
ENSTGUG00000001126	SYF2	84	60.234	ENSVPAG00000005705	SYF2	61	60.265	Vicugna_pacos
ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.500	ENSVVUG00000027175	-	61	60.265	Vulpes_vulpes
ENSTGUG00000001126	SYF2	51	77.228	ENSVVUG00000027181	-	60	59.732	Vulpes_vulpes
ENSTGUG00000001126	SYF2	77	55.414	ENSXMAG00000022698	syf2	63	52.318	Xiphophorus_maculatus