EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000002065 (Gene tree)
Gene ID: 100229316
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18023 bases
Position: chr27:1148871-1166893
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000002150	GTP_EFTU	PF00009.27	2.3e-46	1	1
ENSTGUP00000002150	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.5e-13	1	1
ENSTGUP00000002150	EFG_IV	PF03764.18	8.4e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000002170	EFTUD2-201	2466	-	ENSTGUP00000002150	822 (aa)	-	H0YV29

Gene Model

Click here to download ENSTGUG00000002065's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tgu03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTGUG00000002065's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	66	35.079	ENSTGUG00000001004	EEF2	98	35.192

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSG00000108883	EFTUD2	87	97.442	Homo_sapiens
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.910	ENSAPOG00000002433	eftud2	83	92.910	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	84	97.445	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	88.433	ENSACIG00000009096	eftud2	82	88.433	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	89	86.104	ENSAOCG00000023385	eftud2	86	86.104	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.910	ENSAPEG00000003321	eftud2	83	92.910	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	ENSATEG00000000457	eftud2	83	93.159	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	94.789	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	83	94.796	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.689	ENSACAG00000007637	EFTUD2	84	97.689	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSANAG00000025320	EFTUD2	84	97.324	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.662	ENSACLG00000001296	eftud2	83	92.662	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.893	ENSAMXG00000000568	eftud2	82	92.902	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	84	97.202	Bos_taurus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	69.259	WBGene00001166	eftu-2	82	69.814	Caenorhabditis_elegans
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	84	97.324	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	84	97.445	Canis_familiaris
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	84	97.445	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	84	97.202	Capra_hircus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	84	97.080	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	84	96.837	Cavia_aperea
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	84	96.837	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	84	97.324	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSCATG00000035809	EFTUD2	84	97.324	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.715	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	84	96.715	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	84	97.324	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	83.811	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	89	83.811	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.932	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	84	97.932	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	77.543	ENSCING00000009372	-	83	77.543	Ciona_intestinalis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	78.908	ENSCSAVG00000004985	-	89	78.877	Ciona_savignyi
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSCANG00000026557	EFTUD2	84	97.324	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	ENSCGRG00001009904	Eftud2	84	97.080	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	ENSCGRG00000003825	Eftud2	84	97.080	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.164	ENSCSEG00000016775	eftud2	83	92.164	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	83	93.284	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.145	ENSDARG00000012261	eftud2	92	90.650	Danio_rerio
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.715	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	84	96.715	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSDORG00000011566	Eftud2	84	97.202	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	73.839	FBgn0039566	CG4849	82	74.906	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	90	98.485	ENSETEG00000005678	EFTUD2	76	98.485	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	76	96.078	ENSEBUG00000004047	-	83	86.174	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSEASG00005010321	EFTUD2	84	97.445	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSECAG00000019363	EFTUD2	78	97.445	Equus_caballus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	84	76.623	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	78	76.623	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.040	ENSELUG00000017169	eftud2	83	92.040	Esox_lucius
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	84	97.324	Felis_catus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	99.270	ENSFALG00000007551	EFTUD2	84	99.270	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	84	97.080	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.035	ENSFHEG00000013479	eftud2	83	93.035	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.164	ENSGMOG00000014277	eftud2	83	92.164	Gadus_morhua
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	99.148	ENSGALG00000000988	EFTUD2	87	99.261	Gallus_gallus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	ENSGAFG00000002263	eftud2	83	93.159	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.164	ENSGACG00000009163	eftud2	83	92.164	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	84	97.324	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.662	ENSHBUG00000023546	eftud2	84	92.662	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.959	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	84	96.959	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.959	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	84	96.959	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.040	ENSHCOG00000017689	eftud2	83	92.040	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.777	ENSIPUG00000023182	Eftud2	82	92.777	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	94	97.539	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	87	94.869	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	97.317	ENSJJAG00000018268	Eftud2	87	97.317	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.910	ENSKMAG00000021027	eftud2	83	92.910	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.537	ENSLBEG00000005875	eftud2	87	92.916	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	95.404	ENSLACG00000012918	EFTUD2	83	95.404	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.284	ENSLOCG00000011460	eftud2	83	93.284	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.959	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	84	96.959	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	84	97.324	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	84	97.324	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	84	97.324	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	84	97.324	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	ENSMAMG00000022190	eftud2	83	93.159	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.662	ENSMZEG00005022885	eftud2	83	92.662	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	99.270	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	84	99.270	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSMAUG00000021178	Eftud2	84	97.202	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSMICG00000016592	EFTUD2	84	97.324	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSMOCG00000009039	-	84	97.202	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	81.219	ENSMOCG00000017653	-	81	81.242	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	89	92.779	ENSMMOG00000020811	eftud2	86	92.779	Mola_mola
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSMODG00000011347	EFTUD2	84	97.445	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	89	90.872	ENSMALG00000014501	eftud2	86	90.872	Monopterus_albus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	84	96.837	Mus_caroli
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	ENSMUSG00000020929	Eftud2	84	97.073	Mus_musculus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	84	96.837	Mus_pahari
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	84	96.837	Mus_spretus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	78	97.324	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	84	97.445	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSNGAG00000017834	Eftud2	84	97.324	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.537	ENSNBRG00000020081	eftud2	83	92.537	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	95.255	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	84	95.255	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	84	97.324	Notamacropus_eugenii
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	88.075	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	83	88.075	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	90	79.021	ENSODEG00000003385	-	78	79.021	Octodon_degus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.350	ENSODEG00000018041	-	84	96.350	Octodon_degus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.662	ENSONIG00000000912	eftud2	83	92.662	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	84	97.202	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.413	ENSORLG00000003109	eftud2	83	92.413	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.413	ENSORLG00020009865	eftud2	83	92.413	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.413	ENSORLG00015002611	eftud2	87	92.394	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	95.404	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	83	95.404	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSOARG00000009078	EFTUD2	82	97.202	Ovis_aries
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	84	97.324	Pan_paniscus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	84	97.445	Panthera_pardus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	84	97.445	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	84	97.324	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSPANG00000021284	EFTUD2	84	97.324	Papio_anubis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.723	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	90	96.723	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	83.935	ENSPMGG00000007281	eftud2	92	79.114	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	ENSPEMG00000005129	Eftud2	84	97.080	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	84	97.324	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	ENSPFOG00000008515	eftud2	83	93.159	Poecilia_formosa
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	ENSPLAG00000010393	eftud2	83	93.159	Poecilia_latipinna
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	ENSPMEG00000005087	eftud2	83	93.159	Poecilia_mexicana
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	95.499	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	84	95.499	Pongo_abelii
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	84	96.837	Procavia_capensis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	84	97.324	Propithecus_coquereli
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.795	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	83	92.795	Pteropus_vampyrus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.537	ENSPNYG00000012448	eftud2	83	92.537	Pundamilia_nyererei
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.026	ENSPNAG00000012490	eftud2	82	93.026	Pygocentrus_nattereri
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	97.195	ENSRNOG00000002818	Eftud2	84	97.195	Rattus_norvegicus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	84	97.202	Rhinopithecus_bieti
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.202	ENSRROG00000042925	EFTUD2	84	97.202	Rhinopithecus_roxellana
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	32.916	YKL173W	SNU114	81	33.567	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	84	97.324	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	87	97.445	Sarcophilus_harrisii
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.910	ENSSFOG00015023272	eftud2	83	92.910	Scleropages_formosus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.164	ENSSMAG00000010174	eftud2	83	92.164	Scophthalmus_maximus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.786	ENSSDUG00000022675	eftud2	83	92.786	Seriola_dumerili
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.910	ENSSLDG00000001595	eftud2	83	92.910	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	89.068	ENSSARG00000008664	EFTUD2	83	89.068	Sorex_araneus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	97.317	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	84	97.317	Sphenodon_punctatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.786	ENSSPAG00000016235	eftud2	82	92.786	Stegastes_partitus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	84	97.445	Sus_scrofa
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	91.542	ENSTRUG00000016422	eftud2	83	91.542	Takifugu_rubripes
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	86.262	ENSTNIG00000005346	eftud2	82	86.139	Tetraodon_nigroviridis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	90.754	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	84	90.754	Tupaia_belangeri
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	89	97.954	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	75	97.954	Tursiops_truncatus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.350	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	84	96.350	Ursus_americanus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	84	97.445	Ursus_maritimus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	92	88.492	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	78	88.492	Vicugna_pacos
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	84	97.445	Vulpes_vulpes
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	94.039	ENSXETG00000003394	eftud2	85	95.268	Xenopus_tropicalis
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	89	93.324	ENSXCOG00000017309	eftud2	90	93.324	Xiphophorus_couchianus
ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	ENSXMAG00000008494	eftud2	83	93.159	Xiphophorus_maculatus