EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000002328 (Gene tree)
Gene ID: 100190680
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6588 bases
Position: chr3:2035578-2042165
Accession: 9758
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000002400	MMR_HSR1	PF01926.23	9.5e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000002422	RAB1A-201	1227	-	ENSTGUP00000002400	205 (aa)	-	H0YVS9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	34.010	ENSTGUG00000017468	-	90	34.010
ENSTGUG00000002328	RAB1A	78	39.264	ENSTGUG00000007832	RAB7A	79	39.264
ENSTGUG00000002328	RAB1A	77	41.615	ENSTGUG00000009985	-	67	41.615
ENSTGUG00000002328	RAB1A	80	38.415	ENSTGUG00000000988	NRAS	87	38.922
ENSTGUG00000002328	RAB1A	57	31.092	ENSTGUG00000002488	ARL4A	59	31.092
ENSTGUG00000002328	RAB1A	82	49.704	ENSTGUG00000009889	RAB12	68	49.704
ENSTGUG00000002328	RAB1A	95	44.330	ENSTGUG00000003236	RAB5A	90	44.330
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	53.299	ENSTGUG00000009359	RAB35	98	53.299
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	43.204	ENSTGUG00000006657	RAB14	96	43.204
ENSTGUG00000002328	RAB1A	80	35.928	ENSTGUG00000004727	MRAS	80	35.928
ENSTGUG00000002328	RAB1A	67	31.159	ENSTGUG00000000378	-	70	31.159
ENSTGUG00000002328	RAB1A	89	40.284	ENSTGUG00000001105	-	94	39.640
ENSTGUG00000002328	RAB1A	84	35.028	ENSTGUG00000009877	HRAS	93	35.028
ENSTGUG00000002328	RAB1A	94	45.000	ENSTGUG00000003680	-	99	45.000
ENSTGUG00000002328	RAB1A	89	48.087	ENSTGUG00000011182	RAB2A	98	44.712
ENSTGUG00000002328	RAB1A	95	38.144	ENSTGUG00000008195	RAB22A	97	38.144
ENSTGUG00000002328	RAB1A	80	51.220	ENSTGUG00000012941	RAB30	81	51.220
ENSTGUG00000002328	RAB1A	81	40.361	ENSTGUG00000013171	-	99	40.361
ENSTGUG00000002328	RAB1A	71	36.986	ENSTGUG00000012794	RAB23	66	36.709
ENSTGUG00000002328	RAB1A	67	33.333	ENSTGUG00000007096	ARFRP1	72	33.333
ENSTGUG00000002328	RAB1A	80	45.238	ENSTGUG00000005228	RAB33A	82	45.238
ENSTGUG00000002328	RAB1A	80	37.576	ENSTGUG00000012235	KRAS	95	35.912
ENSTGUG00000002328	RAB1A	84	33.898	ENSTGUG00000016028	-	82	33.898
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	41.509	ENSTGUG00000003675	RAB25	99	41.509
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	33.838	ENSTGUG00000003786	RAB17	92	33.838
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	46.341	ENSTGUG00000009279	RAB11A	95	46.341
ENSTGUG00000002328	RAB1A	57	31.933	ENSTGUG00000003095	ARL4C	61	31.933
ENSTGUG00000002328	RAB1A	81	35.119	ENSTGUG00000009776	-	97	35.119
ENSTGUG00000002328	RAB1A	94	38.889	ENSTGUG00000013470	RAB6A	93	38.889
ENSTGUG00000002328	RAB1A	78	39.024	ENSTGUG00000006516	RAB9B	82	39.024
ENSTGUG00000002328	RAB1A	81	51.807	ENSTGUG00000000084	-	76	51.807
ENSTGUG00000002328	RAB1A	95	40.201	ENSTGUG00000002436	RAB33B	88	40.201

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSG00000138069	RAB1A	100	99.083	Homo_sapiens
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.059	ENSAPOG00000008143	-	100	94.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	97.073	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.059	ENSAOCG00000020606	-	99	95.939	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.059	ENSAPEG00000022488	-	100	94.059	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	97.073	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.554	ENSACLG00000003326	-	100	94.554	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	92.574	ENSAMXG00000034850	-	100	92.574	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	99.492	Bos_taurus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	99.492	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	97.073	Canis_familiaris
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	97.073	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	99.492	Capra_hircus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	97.073	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	97.073	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	97.073	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	97.073	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.561	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	97.561	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	94.634	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	96.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCGRG00001012691	-	100	97.073	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSCGRG00000008456	-	100	97.073	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	97.073	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSDORG00000028628	-	100	97.073	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	83.010	FBgn0285937	Rab1	100	83.010	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	97.525	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	97.525	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	97.073	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	97.073	Equus_caballus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	97.525	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	97.525	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	93.627	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	93.627	Esox_lucius
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	97.073	Felis_catus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSFDAG00000019505	-	100	97.073	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	93.069	ENSFHEG00000014414	-	100	93.069	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.561	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	97.561	Gallus_gallus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	93.069	ENSGAFG00000000918	-	100	93.069	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.561	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	97.561	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSGGOG00000026603	RAB1A	99	99.492	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	97.073	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	99.492	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSSTOG00000020693	-	100	97.073	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	99.492	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	93.564	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	93.564	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	95.610	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	95.610	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	97.073	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	97.073	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	99.492	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000002328	RAB1A	95	96.907	ENSMNEG00000028414	-	97	96.907	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	97.073	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.554	ENSMZEG00005013959	-	100	94.554	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	100.000	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	96.585	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	96.585	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	97.073	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	96.585	ENSMOCG00000017022	Rab1a	98	98.985	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	92.079	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	92.079	Mola_mola
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.561	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	97.561	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	97.073	Mus_caroli
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	97.525	Mus_musculus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	97.073	Mus_pahari
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	97.525	Mus_spretus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	97.073	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	97.073	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	97.073	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.554	ENSNBRG00000020492	-	100	94.554	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	99.492	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000002328	RAB1A	94	99.479	ENSODEG00000011248	-	96	99.479	Octodon_degus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	92.157	ENSONIG00000006819	-	100	92.157	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.561	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	97.561	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	97.073	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	97.073	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	99.492	Ovis_aries
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	97.525	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	97.525	Pan_paniscus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	97.073	Panthera_pardus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	99.492	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	99.492	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSPTRG00000011989	RAB1A	98	99.492	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	97.073	Papio_anubis
ENSTGUG00000002328	RAB1A	96	100.000	ENSPSIG00000008028	RAB1A	96	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.118	ENSPMGG00000021015	-	99	94.118	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	ENSPEMG00000009340	Rab1a	100	97.073	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.561	ENSPCIG00000023212	RAB1A	100	97.561	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	91.667	ENSPFOG00000000498	-	99	91.667	Poecilia_formosa
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