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Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000002416 (Gene tree)
Gene ID: 100229005
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2280 bases
Position: chrZ:46302054-46304333
Accession: 100229005
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000002485	eRF1_2	PF03464.15	1.2e-36	1	1
ENSTGUP00000002485	eRF1_3	PF03465.15	2.5e-26	1	1
ENSTGUP00000002485	eRF1_1	PF03463.15	1.2e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000002509	PELO-201	1158	-	ENSTGUP00000002485	385 (aa)	XP_002197171	H0YW13

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tgu03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.026	ENSG00000152684	PELO	100	94.026	Homo_sapiens
ENSTGUG00000002416	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000002416	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.779	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.779	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	ENSAMEG00000007734	PELO	100	95.065	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000002416	PELO	97	76.139	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.065	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.039	ENSAOCG00000023717	pelo	100	81.039	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.039	ENSAPEG00000011235	pelo	100	81.039	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.299	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000002416	PELO	77	89.597	ENSAPLG00000013265	PELO	100	89.597	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000002416	PELO	98	92.819	ENSACAG00000004352	PELO	100	92.727	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	ENSANAG00000014096	PELO	100	95.065	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.519	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000002416	PELO	97	82.038	ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.088	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSBTAG00000003268	PELO	99	94.286	Bos_taurus
ENSTGUG00000002416	PELO	98	59.309	WBGene00011280	pelo-1	99	59.309	Caenorhabditis_elegans
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSCJAG00000035190	PELO	100	94.805	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.325	ENSCAFG00020023234	PELO	100	95.325	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.026	ENSCHIG00000016410	PELO	99	94.026	Capra_hircus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSTSYG00000005203	PELO	100	94.286	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	ENSCPOG00000027406	PELO	100	95.065	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSCCAG00000035600	PELO	100	94.805	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSCATG00000011829	PELO	100	94.545	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSCLAG00000005043	PELO	100	94.545	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSCSAG00000016692	PELO	100	94.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.026	ENSCHOG00000000523	PELO	100	94.026	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000002416	PELO	100	96.104	ENSCPBG00000007544	PELO	100	96.104	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000002416	PELO	97	68.097	ENSCING00000001979	-	100	68.571	Ciona_intestinalis
ENSTGUG00000002416	PELO	100	69.351	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.351	Ciona_savignyi
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSCANG00000023382	PELO	100	94.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000002416	PELO	97	93.298	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	92.987	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000002416	PELO	97	94.638	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	94.286	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.000	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.597	ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.597	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.597	ENSDARG00000055477	pelo	100	82.597	Danio_rerio
ENSTGUG00000002416	PELO	100	91.710	ENSDNOG00000036721	PELO	100	91.710	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSDORG00000016689	Pelo	100	94.805	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000002416	PELO	96	67.568	FBgn0011207	pelo	96	67.018	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000002416	PELO	71	80.702	ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.702	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSEASG00005013348	PELO	100	94.805	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.299	ENSELUG00000023229	pelo	100	81.299	Esox_lucius
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSFCAG00000032341	PELO	100	94.805	Felis_catus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	98.961	ENSFALG00000004559	PELO	100	98.961	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000002416	PELO	74	95.423	ENSFDAG00000002076	PELO	88	95.423	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.299	ENSFHEG00000009769	pelo	100	81.299	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000002416	PELO	98	80.371	ENSGMOG00000005849	pelo	100	80.000	Gadus_morhua
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.818	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.818	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.779	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	96.364	ENSGAGG00000004018	PELO	100	96.364	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSGGOG00000012635	PELO	100	94.545	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.519	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.519	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSHGLG00000005932	PELO	100	94.286	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000002416	PELO	100	91.948	ENSHGLG00100017627	PELO	100	91.948	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000002416	PELO	100	78.182	ENSHCOG00000016782	pelo	100	78.182	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.260	ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.260	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSSTOG00000027378	PELO	100	94.805	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	92.208	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	92.208	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.078	ENSKMAG00000021305	pelo	100	82.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000002416	PELO	99	80.990	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.990	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.026	ENSLAFG00000020551	PELO	100	94.026	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSMFAG00000000651	PELO	100	94.545	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSMMUG00000039101	PELO	100	94.545	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSMNEG00000035538	PELO	100	94.545	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSMLEG00000039113	PELO	100	94.545	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000002416	PELO	97	83.378	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.519	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.519	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	94.286	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSMICG00000044040	PELO	100	94.286	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	94.545	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000002416	PELO	100	79.221	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.221	Mola_mola
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.039	ENSMALG00000008194	pelo	100	81.039	Monopterus_albus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	95.065	Mus_caroli
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	95.065	Mus_musculus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.325	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	95.325	Mus_pahari
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	95.065	Mus_spretus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	92.208	ENSMLUG00000024132	PELO	100	92.208	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	94.545	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.519	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSNLEG00000035970	PELO	100	94.545	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000002416	PELO	100	93.766	ENSMEUG00000005468	PELO	100	93.766	Notamacropus_eugenii
ENSTGUG00000002416	PELO	98	93.140	ENSOPRG00000018793	PELO	100	93.140	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	ENSODEG00000017579	PELO	100	95.065	Octodon_degus
ENSTGUG00000002416	PELO	96	80.593	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	ENSOCUG00000023902	PELO	100	95.065	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.299	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.558	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.818	ENSORLG00015014447	pelo	100	82.222	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000002416	PELO	100	83.636	ENSOMEG00000021567	pelo	100	83.636	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	ENSOGAG00000027940	PELO	100	95.065	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSOARG00000008324	PELO	99	94.286	Ovis_aries
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSPPAG00000038951	PELO	100	94.545	Pan_paniscus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSPPRG00000018800	PELO	100	94.805	Panthera_pardus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSPTIG00000019988	PELO	100	94.805	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSPTRG00000034409	PELO	100	94.286	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSPANG00000010902	PELO	100	94.545	Papio_anubis
ENSTGUG00000002416	PELO	100	83.896	ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.896	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000002416	PELO	98	96.011	ENSPSIG00000004971	PELO	100	95.844	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000002416	PELO	67	77.132	ENSPMGG00000014561	pelo	95	77.132	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	94.286	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.026	ENSPCIG00000004880	PELO	100	94.026	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.338	ENSPFOG00000007277	pelo	100	82.338	Poecilia_formosa
ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.597	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.597	Poecilia_latipinna
ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.338	ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.338	Poecilia_mexicana
ENSTGUG00000002416	PELO	100	82.597	ENSPREG00000023071	pelo	100	82.597	Poecilia_reticulata
ENSTGUG00000002416	PELO	97	94.370	ENSPPYG00000015451	PELO	96	94.286	Pongo_abelii
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.286	ENSPCOG00000021178	PELO	100	94.286	Propithecus_coquereli
ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.519	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.519	Pundamilia_nyererei
ENSTGUG00000002416	PELO	97	82.842	ENSPNAG00000012458	pelo	99	81.818	Pygocentrus_nattereri
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.805	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	94.805	Rattus_norvegicus
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSRBIG00000007299	PELO	100	94.545	Rhinopithecus_bieti
ENSTGUG00000002416	PELO	100	94.545	ENSRROG00000035507	PELO	100	94.545	Rhinopithecus_roxellana
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