EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000004123 (Gene tree)
Gene ID: 100228729
Gene Symbol: SRP9
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4661 bases
Position: chr3:18627288-18631948
Accession: 100228729
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000004245	SRP9-21	PF05486.12	2e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000004290	SRP9-201	846	-	ENSTGUP00000004245	86 (aa)	XP_002197417	H0Z107

Gene Model

Click here to download ENSTGUG00000004123's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tgu03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTGUG00000004123's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSG00000143742	SRP9	100	81.395	Homo_sapiens
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSAPOG00000006089	srp9	100	79.070	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	87.209	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	56.977	ENSACIG00000022298	srp9	100	56.977	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSAOCG00000014643	srp9	100	79.070	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSAPEG00000004398	srp9	100	79.070	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSATEG00000014339	srp9	100	80.233	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000004123	SRP9	81	98.571	ENSAPLG00000015368	SRP9	100	98.571	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	94.186	ENSACAG00000005788	SRP9	100	94.186	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	83.721	ENSANAG00000022626	SRP9	100	83.721	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSACLG00000018392	srp9	100	80.233	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSAMXG00000010366	srp9	100	80.233	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	87.209	Bos_taurus
ENSTGUG00000004123	SRP9	88	52.632	WBGene00013984	ZK512.4	100	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	83.721	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	83.721	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	87.209	Canis_familiaris
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	87.209	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	87.209	Capra_hircus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	81.395	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	84.884	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	84.884	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	82.558	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	82.558	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSCATG00000041813	SRP9	100	81.395	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	84.884	ENSCLAG00000001368	-	100	84.884	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000004123	SRP9	99	78.824	ENSCLAG00000017687	-	99	78.824	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	54.651	ENSCHOG00000012912	-	100	54.651	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSCHOG00000006096	-	100	87.209	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000004123	SRP9	58	90.000	ENSCHOG00000008435	-	100	90.000	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	96.512	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	96.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSCANG00000012015	-	100	80.233	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSCANG00000030765	-	100	81.395	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	87.209	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000004123	SRP9	95	70.732	ENSCGRG00000009651	Srp9	95	70.732	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSCSEG00000018438	srp9	100	79.070	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSCVAG00000001083	srp9	100	81.395	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	77.907	ENSDARG00000042851	srp9	100	77.907	Danio_rerio
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSDNOG00000013412	-	100	87.209	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000004123	SRP9	90	38.961	FBgn0035827	Srp9	100	38.961	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSETEG00000012291	SRP9	100	80.233	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000004123	SRP9	98	69.048	ENSEBUG00000009080	srp9	100	69.048	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSECAG00000033839	SRP9	100	87.209	Equus_caballus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	81.395	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSELUG00000001506	srp9	100	81.395	Esox_lucius
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	87.209	Felis_catus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	100.000	ENSFALG00000011689	SRP9	100	100.000	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	86.047	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	86.047	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSFHEG00000011666	srp9	100	81.395	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSGMOG00000003565	srp9	100	80.233	Gadus_morhua
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	98.837	ENSGALG00000026009	SRP9	100	98.837	Gallus_gallus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSGAFG00000009506	srp9	100	80.233	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSGACG00000004110	srp9	100	81.395	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	96.512	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	96.512	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	81.395	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSHBUG00000021430	srp9	100	80.233	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000004123	SRP9	81	82.857	ENSHGLG00000019830	-	100	82.857	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000004123	SRP9	98	77.381	ENSHGLG00000006535	-	99	77.381	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	87.209	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000004123	SRP9	93	88.750	ENSHGLG00000020925	-	100	88.750	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSHGLG00000020168	-	100	81.395	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSHGLG00100020800	-	100	81.395	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSHGLG00100019986	-	100	87.209	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000004123	SRP9	95	87.805	ENSHGLG00100016521	-	100	87.805	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	72.093	ENSHGLG00100011806	-	100	72.093	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000004123	SRP9	98	77.381	ENSHGLG00100009760	-	99	77.381	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	58.140	ENSHCOG00000006978	srp9	100	58.140	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSIPUG00000020674	srp9	100	79.070	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	87.209	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	82.558	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	82.558	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSKMAG00000014117	srp9	100	81.395	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSLBEG00000020620	srp9	100	80.233	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	83.721	ENSLACG00000007546	SRP9	100	83.721	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSLOCG00000015903	srp9	100	80.233	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	88.372	ENSLAFG00000004081	SRP9	100	88.372	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	81.395	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	81.395	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	81.395	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	81.395	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSMAMG00000004755	srp9	100	80.233	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSMZEG00005015517	srp9	100	80.233	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	98.837	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	98.837	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	87.209	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSMICG00000030104	-	100	87.209	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	87.209	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	78.161	ENSMMOG00000014838	srp9	100	78.161	Mola_mola
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	89.535	ENSMODG00000025664	SRP9	100	89.535	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	77.907	ENSMALG00000004262	srp9	100	77.907	Monopterus_albus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	87.209	Mus_caroli
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	87.209	Mus_musculus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	84.884	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	84.884	Mus_pahari
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	87.209	Mus_spretus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	88.372	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	88.372	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	88.372	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	88.372	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSNBRG00000010915	srp9	100	80.233	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	81.395	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	87.209	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSODEG00000015075	-	100	80.233	Octodon_degus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	75.000	ENSODEG00000010125	-	76	75.000	Octodon_degus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSONIG00000011409	srp9	100	79.070	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	90.698	ENSOANG00000001472	SRP9	100	90.698	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	87.209	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSORLG00020003090	srp9	100	79.070	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSORLG00015001636	srp9	89	79.070	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSOMEG00000020548	srp9	100	80.233	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	82.558	ENSOGAG00000001752	-	100	82.558	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	82.558	ENSOGAG00000031299	-	100	82.558	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	81.395	Pan_paniscus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	87.209	Panthera_pardus
ENSTGUG00000004123	SRP9	71	90.164	ENSPTIG00000014838	SRP9	71	90.164	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	81.395	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSPANG00000030164	SRP9	100	81.395	Papio_anubis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSPKIG00000015012	srp9	100	79.070	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	96.512	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	96.512	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	59.302	ENSPMGG00000002318	srp9	100	59.302	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	88.372	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	88.372	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	89.535	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	89.535	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSPREG00000020242	srp9	100	80.233	Poecilia_reticulata
ENSTGUG00000004123	SRP9	97	81.928	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	81.928	Pongo_abelii
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	87.209	Procavia_capensis
ENSTGUG00000004123	SRP9	71	88.525	ENSPCOG00000021743	-	98	88.525	Propithecus_coquereli
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	68.539	ENSPCOG00000012531	-	100	68.539	Propithecus_coquereli
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	87.209	Pteropus_vampyrus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSPNYG00000010536	srp9	100	80.233	Pundamilia_nyererei
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSPNAG00000008264	srp9	100	79.070	Pygocentrus_nattereri
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	89.535	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	89.535	Rattus_norvegicus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	81.395	Rhinopithecus_bieti
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	81.395	ENSRROG00000028703	SRP9	100	81.395	Rhinopithecus_roxellana
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	83.721	ENSSBOG00000034573	SRP9	100	83.721	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	89.535	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	89.535	Sarcophilus_harrisii
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	Scleropages_formosus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSSMAG00000001318	srp9	100	79.070	Scophthalmus_maximus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSSDUG00000008772	srp9	100	79.070	Seriola_dumerili
ENSTGUG00000004123	SRP9	87	81.333	ENSSLDG00000019141	srp9	95	81.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTGUG00000004123	SRP9	99	75.294	ENSSPUG00000014436	SRP9	99	75.294	Sphenodon_punctatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSSPAG00000017244	srp9	100	80.233	Stegastes_partitus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSSSCG00000031664	-	100	87.209	Sus_scrofa
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSTRUG00000024107	srp9	100	79.070	Takifugu_rubripes
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	Tetraodon_nigroviridis
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	86.047	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	86.047	Tupaia_belangeri
ENSTGUG00000004123	SRP9	71	90.164	ENSTTRG00000010081	SRP9	98	90.164	Tursiops_truncatus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	87.209	Ursus_americanus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	87.209	Ursus_maritimus
ENSTGUG00000004123	SRP9	71	90.164	ENSVPAG00000001698	SRP9	98	90.164	Vicugna_pacos
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	87.209	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	87.209	Vulpes_vulpes
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSXCOG00000000662	srp9	100	79.070	Xiphophorus_couchianus
ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	ENSXMAG00000029514	srp9	100	79.070	Xiphophorus_maculatus