EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000005380 (Gene tree)
Gene ID: 100219947
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22031 bases
Position: chr15:2480280-2502310
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000005583	ResIII	PF04851.15	1.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000005640	SBNO1-201	4173	-	ENSTGUP00000005583	1390 (aa)	-	H0Z4T8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.103	ENSG00000139697	SBNO1	100	92.026	Homo_sapiens
ENSTGUG00000005380	SBNO1	83	81.385	ENSAPOG00000003196	sbno1	96	81.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.768	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.691	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.142	ENSACIG00000008088	sbno1	98	75.018	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.689	ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.484	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.689	ENSAPEG00000006069	sbno1	97	75.484	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.815	ENSATEG00000006667	sbno1	98	76.408	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	98.490	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	98.490	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	90.896	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	90.825	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.894	ENSANAG00000029958	-	99	95.298	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	74.893	ENSACLG00000024913	sbno1	98	74.728	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	79.715	ENSAMXG00000019473	sbno1	98	79.739	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	91.888	ENSBTAG00000020505	SBNO1	98	92.167	Bos_taurus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.894	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	91.816	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.834	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	95.833	Canis_familiaris
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.105	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	92.948	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	91.954	ENSCHIG00000008382	SBNO1	97	95.627	Capra_hircus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.324	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.247	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000005380	SBNO1	96	92.342	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	95.118	Cavia_aperea
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.673	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	95.118	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	87.599	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	87.518	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	90.641	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	95.660	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.966	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	95.479	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000005380	SBNO1	83	94.133	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	93.955	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	96	88.462	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	88.354	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	95.399	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	95.399	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	87.097	ENSCANG00000042688	-	100	86.872	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.392	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	94.575	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.392	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	94.575	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	74.718	ENSCSEG00000011919	sbno1	98	75.447	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.494	ENSCVAG00000007038	sbno1	98	75.899	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	79.128	ENSDARG00000099080	sbno1	98	79.288	Danio_rerio
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	89.238	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	91.572	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	85.222	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	91.802	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000005380	SBNO1	93	86.207	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	86.207	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000005380	SBNO1	75	62.546	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	61.776	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000005380	SBNO1	51	87.288	ENSEASG00005012595	-	92	88.136	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.181	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	92.103	Equus_caballus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	83	92.308	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	92.308	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	78.154	ENSELUG00000002886	sbno1	98	78.033	Esox_lucius
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	92.247	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	92.170	Felis_catus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	99.641	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	99.641	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	90.302	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	91.123	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.292	ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.496	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	94	79.237	ENSGMOG00000018229	sbno1	98	79.441	Gadus_morhua
ENSTGUG00000005380	SBNO1	88	98.535	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	98.535	Gallus_gallus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.325	ENSGAFG00000003960	sbno1	98	76.602	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	94	79.224	ENSGACG00000015633	sbno1	98	78.886	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	94.752	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	97.649	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.032	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	95.660	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	69.308	ENSHBUG00000011910	sbno1	98	69.058	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.822	ENSHGLG00000014165	-	99	95.118	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000005380	SBNO1	91	85.573	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	85.573	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	79.487	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.862	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.103	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	95.298	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.181	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	91.888	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.292	ENSKMAG00000009696	sbno1	98	76.331	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.110	ENSLBEG00000007623	sbno1	98	75.857	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	82.546	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	85.008	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	82.303	ENSLOCG00000005725	sbno1	96	82.272	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.105	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	91.027	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.253	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	91.960	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.319	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	92.026	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	90.674	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	95.660	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.695	ENSMAMG00000005473	sbno1	98	76.619	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	98.634	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	98.634	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000005380	SBNO1	50	86.963	ENSMAUG00000004834	-	100	87.393	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	90.961	ENSMICG00000006573	-	99	92.405	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	95	95.324	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	95.298	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	72.837	ENSMMOG00000008691	sbno1	97	71.942	Mola_mola
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	93.242	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	93.242	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.617	ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.071	Monopterus_albus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	91.667	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	96.930	Mus_caroli
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	91.667	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	96.930	Mus_musculus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	92.014	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	96.930	Mus_pahari
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	91.523	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	96.930	Mus_spretus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.253	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	92.175	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.822	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	91.744	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.037	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	95.661	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	74.768	ENSNBRG00000019189	sbno1	98	74.528	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	88.442	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.466	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000005380	SBNO1	67	77.444	ENSMEUG00000008768	-	93	85.350	Notamacropus_eugenii
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	89.606	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	89.527	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.175	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	95.118	Octodon_degus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.090	ENSONIG00000015348	sbno1	98	76.017	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	98	90.956	ENSOCUG00000002441	SBNO1	93	91.976	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.476	ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.964	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.529	ENSORLG00020015216	sbno1	98	75.233	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.670	ENSORLG00015002726	sbno1	98	75.305	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.618	ENSOMEG00000019313	sbno1	98	75.018	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000005380	SBNO1	50	84.241	ENSOGAG00000010781	-	100	85.100	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	91.750	ENSOARG00000004404	SBNO1	98	92.026	Ovis_aries
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.894	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	95.479	Pan_paniscus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	92.247	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	92.170	Panthera_pardus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.679	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.888	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.966	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	95.660	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.103	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	95.660	Papio_anubis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	81.487	ENSPKIG00000001441	sbno1	98	81.428	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000005380	SBNO1	92	90.747	ENSPSIG00000009256	-	100	90.435	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	94.850	ENSPSIG00000009572	-	100	94.850	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	91.320	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	94.575	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	92.960	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	93.175	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	76.554	ENSPFOG00000005069	sbno1	98	76.636	Poecilia_formosa
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ENSTGUG00000005380	SBNO1	100	92.181	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	95.455	Propithecus_coquereli
ENSTGUG00000005380	SBNO1	87	95.040	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	95.040	Pteropus_vampyrus
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