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Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000005460 (Gene tree)
Gene ID: 100226440
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 105698 bases
Position: chrZ:64878230-64983927
Accession: 100226440
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000005661	ResIII	PF04851.15	1.3e-08	1	1
ENSTGUP00000005661	BRK	PF07533.16	9e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000005719	SMARCA2-201	5290	XM_004177169	ENSTGUP00000005661	1567 (aa)	XP_004177217	H0Z515

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	54	78.512	ENSTGUG00000015488	-	98	78.410

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.273	ENSG00000080503	SMARCA2	100	97.987	Homo_sapiens
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.439	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.871	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	80	95.700	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.700	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	79.362	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.897	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.276	ENSAOCG00000009647	-	97	79.897	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.439	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	79.936	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	81.246	ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	80.691	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	87.282	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	100	87.282	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	92.102	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	91.975	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.331	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	90.776	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.417	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	78.974	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	82.453	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	81.979	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.204	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	90.782	Bos_taurus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	90.519	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	90.552	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.903	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	90.967	Canis_familiaris
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	76	94.794	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	96	94.794	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.458	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	91.481	Capra_hircus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	88.454	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	90.230	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	97	87.178	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	97	85.594	Cavia_aperea
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	90.147	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	98	88.811	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.458	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	90.903	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.407	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	89.384	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	88.799	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	90.470	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	93	90.544	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	90.731	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	85	87.821	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	87.821	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	94.204	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	94.331	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	91.455	ENSCANG00000039597	SMARCA2	98	91.672	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	82	88.605	ENSCGRG00001002323	Smarca2	97	85.052	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	76.407	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	94	74.836	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	82.680	ENSDARG00000008904	smarca2	97	82.025	Danio_rerio
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	90.833	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	90.869	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	91.069	ENSDORG00000014832	Smarca2	98	91.471	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	94	70.120	ENSEBUG00000011442	-	96	68.289	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	89	61.315	ENSEBUG00000002449	-	95	64.396	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.649	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	91.031	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	67	94.444	ENSEEUG00000015540	-	67	94.444	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	92	81.497	ENSELUG00000010318	smarca2	95	80.226	Esox_lucius
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.522	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	90.585	Felis_catus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	99.043	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	99.177	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	97	89.579	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	96	89.777	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.248	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.936	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	77.121	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.785	Gadus_morhua
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	97.895	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	97.895	Gallus_gallus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	95	75.498	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	91	74.863	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	78.901	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	78.474	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	94.204	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	94.331	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	92	96.490	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	84	94.968	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.288	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.231	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	97	89.994	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	96	89.320	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	91.033	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	97	89.877	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	78	86.053	ENSHCOG00000015348	-	86	85.968	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	82.334	ENSIPUG00000011060	smarca2	96	81.872	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	91.016	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	98	91.482	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	90.933	ENSJJAG00000010867	Smarca2	98	90.406	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	79.342	ENSKMAG00000015844	-	98	79.262	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	83.873	ENSLOCG00000011499	smarca2	98	84.207	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	88.973	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	89.434	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	88.728	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	98	91.738	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.522	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	90.799	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.152	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	90.661	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	94	96.585	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	89.199	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.633	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.331	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.439	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.386	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	74	79.548	ENSMGAG00000005160	-	100	79.150	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.267	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	90.776	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	91.004	ENSMOCG00000001611	Smarca2	98	91.211	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	78.512	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	95	77.955	Mola_mola
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	93.380	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	93.253	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	80.231	ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	78.320	Monopterus_albus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	83	94.817	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	98	90.316	Mus_caroli
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	83	94.885	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.324	Mus_musculus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	83	94.656	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	98	90.427	Mus_pahari
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	83	95.455	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	95	100.000	Mus_spretus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	81	95.554	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	95.554	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	97	86.680	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	85.877	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	97	89.251	ENSNGAG00000000108	Smarca2	96	88.846	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	95	68.588	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	81	95.728	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	89.172	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	83.763	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	83.826	Notamacropus_eugenii
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	85.035	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	84.975	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	97	87.101	ENSODEG00000005452	SMARCA2	96	90.183	Octodon_degus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	80.163	ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	79.974	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	50	93.077	ENSOANG00000008299	-	95	96.635	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	81	96.609	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	88.184	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	79.198	ENSORLG00000020820	SMARCA2	97	79.692	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	79.373	ENSORLG00015006289	SMARCA2	97	78.676	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	80.345	ENSOMEG00000009736	-	97	79.896	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	81	96.288	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	87.133	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	89.651	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	88.483	Ovis_aries
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	93	96.554	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	83	96.554	Pan_paniscus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.585	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	90.649	Panthera_pardus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	92.052	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	90.915	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	84.191	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	83.688	Papio_anubis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	84.150	ENSPKIG00000018469	-	97	83.344	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	93.897	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	94.024	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	98	73.913	ENSPMGG00000013696	-	96	73.204	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	83	93.893	ENSPEMG00000019821	Smarca2	98	89.511	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	94	73.235	ENSPMAG00000005337	-	94	72.900	Petromyzon_marinus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	93.189	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	93.253	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	80.262	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.288	Poecilia_formosa
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	79.837	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	94	79.381	Poecilia_latipinna
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	99	79.761	ENSPMEG00000001815	-	97	79.161	Poecilia_mexicana
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	79.752	ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.302	Poecilia_reticulata
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	90.140	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	90.419	Pongo_abelii
ENSTGUG00000005460	SMARCA2	76	79.298	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.298	Procavia_capensis
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