EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000005729 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 88050 bases
Position: chrZ:66198178-66286227
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000005916	IBN_N	PF03810.19	2.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000005975	TNPO1-201	2688	-	ENSTGUP00000005916	896 (aa)	-	H0Z5S0
ENSTGUT00000005983	TNPO1-202	1893	-	ENSTGUP00000005924	630 (aa)	-	H0Z5S8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSG00000083312	TNPO1	99	95.201	Homo_sapiens
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	92.076	ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	92.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.358	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	94.358	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000005729	TNPO1	86	92.487	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.487	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	92.188	ENSAOCG00000008154	tnpo1	99	92.188	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	92.188	ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	92.188	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.964	ENSATEG00000010408	tnpo1	99	91.964	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	99	91.629	ENSAPLG00000009619	-	99	91.629	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	96.317	ENSACAG00000009599	TNPO1	99	96.317	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	61.674	ENSANAG00000027118	-	97	62.543	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	84.598	ENSANAG00000025351	-	99	84.598	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.754	ENSANAG00000022453	-	99	94.754	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	90.067	ENSACLG00000027223	tnpo1	99	90.067	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	90.980	ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	90.646	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	95.089	Bos_taurus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.866	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	94.866	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	96	95.035	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	95.035	Canis_familiaris
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	92.634	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	92.634	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.978	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	94.978	Capra_hircus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	99	91.387	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	93.750	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.754	ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	94.754	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	95.201	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.754	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	94.754	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	95.201	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	94	82.722	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.722	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	97.433	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.433	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000005729	TNPO1	99	74.222	ENSCSAVG00000010981	-	99	74.000	Ciona_savignyi
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	95.201	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	95.089	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000005729	TNPO1	96	95.139	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	95.139	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.071	ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	91.071	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.518	ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	91.518	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.304	ENSDARG00000035390	tnpo1	99	90.635	Danio_rerio
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	89.321	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	89.321	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	94	94.994	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.988	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000005729	TNPO1	99	56.872	FBgn0035693	CG8219	99	56.872	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000005729	TNPO1	86	91.667	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	91.667	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000005729	TNPO1	95	83.392	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	83.510	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSEASG00005018055	TNPO1	99	95.201	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	95.089	Equus_caballus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	84.957	ENSELUG00000002821	tnpo1	99	84.416	Esox_lucius
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSFCAG00000013181	TNPO1	99	95.201	Felis_catus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	97.768	ENSFALG00000010292	TNPO1	99	97.768	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.866	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	94.866	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.862	ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	91.862	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	88.877	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	88.877	Gadus_morhua
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	96.205	ENSGALG00000015014	TNPO1	99	96.205	Gallus_gallus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	90.757	ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	90.757	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.518	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.518	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	97.210	ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	97.210	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	79.287	ENSGGOG00000022535	-	98	79.287	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSGGOG00000026800	TNPO1	99	95.201	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.741	ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	91.741	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.531	ENSHGLG00000000970	-	99	94.531	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000005729	TNPO1	97	73.763	ENSHGLG00100000963	-	99	73.303	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000005729	TNPO1	97	94.451	ENSHGLG00100017090	-	99	94.451	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.312	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	95.312	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.853	ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	91.853	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	91	89.681	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.681	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000005729	TNPO1	97	87.917	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.917	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.085	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.085	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	98	94.743	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	94.743	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	95.201	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	95.089	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	95.201	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	95.201	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.964	ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	91.964	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.406	ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	91.406	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	98	97.714	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.183	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	91.183	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	95.089	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000005729	TNPO1	86	92.149	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.149	Mola_mola
ENSTGUG00000005729	TNPO1	99	95.763	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.763	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	90.625	ENSMALG00000009782	tnpo1	99	90.625	Monopterus_albus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.866	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	98	97.714	Mus_caroli
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	98	97.714	Mus_musculus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.978	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	98	97.714	Mus_pahari
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.866	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	98	97.714	Mus_spretus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	95.089	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000005729	TNPO1	96	94.585	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	94.585	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	95.089	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000005729	TNPO1	86	92.487	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.487	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSNLEG00000004572	TNPO1	99	95.201	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000005729	TNPO1	91	91.054	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	91.054	Ochotona_princeps
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	94.531	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	94.531	Octodon_degus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.020	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.020	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	93	96.140	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	96.140	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	96	88.786	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	88.439	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	86	92.000	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.000	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.295	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	91.295	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.518	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	91.518	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.406	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	91.406	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	95.201	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.089	ENSOARG00000005038	TNPO1	83	95.089	Ovis_aries
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	95.201	Pan_paniscus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSPPRG00000022336	TNPO1	99	95.201	Panthera_pardus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSPTIG00000018839	TNPO1	99	95.201	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000005729	TNPO1	93	83.795	ENSPTRG00000047731	-	99	83.795	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	95.201	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	95.201	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	95.201	Papio_anubis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	88.393	ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	88.393	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	97.210	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.210	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	88.740	ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	88.517	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000005729	TNPO1	97	95.029	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	95.139	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.741	ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	91.741	Poecilia_mexicana
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