EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000006512 (Gene tree)
Gene ID: 100220104
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 31104 bases
Position: chr3:26259204-26290307
Accession: 100220104
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000006726	CRM1_C	PF08767.11	2e-135	1	1
ENSTGUP00000006726	Xpo1	PF08389.12	3e-38	1	1
ENSTGUP00000006726	IBN_N	PF03810.19	1.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000006792	XPO1-201	3863	XM_002199283	ENSTGUP00000006726	1079 (aa)	XP_002199319	H0Z824

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tgu03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
tgu03013	RNA transport	KEGG
tgu05164	Influenza A	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSG00000082898	XPO1	100	98.387	Homo_sapiens
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.459	ENSAPOG00000004984	-	100	95.459	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	90.042	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.042	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.333	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.333	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	96.186	ENSACIG00000010818	-	100	96.186	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	92.373	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.373	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.459	ENSAOCG00000010121	-	100	95.459	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	91.196	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.196	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000006512	XPO1	90	92.308	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.308	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.459	ENSAPEG00000007038	-	100	95.459	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	90.825	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	90.825	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.459	ENSATEG00000008816	-	100	95.459	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.703	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.703	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.517	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.517	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSANAG00000020802	XPO1	100	97.312	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	92.691	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.691	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.273	ENSACLG00000015192	-	100	95.273	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	93.962	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.962	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.922	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.922	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	98.424	Bos_taurus
ENSTGUG00000006512	XPO1	99	51.512	WBGene00002078	xpo-1	99	51.512	Caenorhabditis_elegans
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.312	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	98.424	Canis_familiaris
ENSTGUG00000006512	XPO1	93	98.900	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.900	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	98.424	Capra_hircus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	98.424	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000006512	XPO1	52	95.035	ENSCAPG00000006454	-	100	95.035	Cavia_aperea
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	96.942	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	96.942	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	78.453	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.637	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.564	ENSCATG00000032674	XPO1	100	97.775	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.146	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.146	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.312	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000006512	XPO1	83	98.074	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.074	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.610	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.610	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	80.499	ENSCING00000024562	-	100	80.499	Ciona_intestinalis
ENSTGUG00000006512	XPO1	99	79.518	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.518	Ciona_savignyi
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	93.234	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.227	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.312	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	97.312	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	95.021	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.021	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.366	ENSCVAG00000016788	-	100	95.366	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	90.547	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.547	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	92.122	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	93.731	Danio_rerio
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	96.293	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.293	Danio_rerio
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.517	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.517	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000006512	XPO1	92	94.784	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.784	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000006512	XPO1	99	70.512	FBgn0020497	emb	99	70.512	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000006512	XPO1	94	97.419	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.419	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000006512	XPO1	90	79.649	ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSEASG00005007223	XPO1	100	98.424	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.241	Equus_caballus
ENSTGUG00000006512	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	92.751	ENSELUG00000014306	-	99	92.751	Esox_lucius
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	94.809	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.809	Esox_lucius
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	98.424	Felis_catus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.795	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.795	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	96.571	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	96.571	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	90.918	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.918	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	91.937	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	91.937	Gadus_morhua
ENSTGUG00000006512	XPO1	94	95.995	ENSGMOG00000019063	-	94	95.995	Gadus_morhua
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.703	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.703	Gallus_gallus
ENSTGUG00000006512	XPO1	90	95.897	ENSGAFG00000003355	-	98	95.897	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	92.267	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.267	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.181	ENSGACG00000002743	-	100	95.181	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	90.732	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.732	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.517	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.517	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	97.312	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	91.381	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.381	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.366	ENSHBUG00000020037	-	100	95.366	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.054	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.054	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.054	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.054	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	95.127	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.127	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	93.142	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.142	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.922	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.922	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.239	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.239	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.146	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.146	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	90.825	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.825	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	94.810	ENSKMAG00000016218	-	100	94.810	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	89.768	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.768	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.366	ENSLBEG00000005740	-	100	95.366	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	76.810	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.810	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	96.015	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.015	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.054	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.054	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	97.312	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	97.312	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	97.312	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.568	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	95.568	Mandrillus_leucophaeus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.366	ENSMAMG00000010568	-	100	95.366	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	91.103	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.103	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	91.381	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.381	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	95.273	ENSMZEG00005018158	-	98	95.897	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000006512	XPO1	67	99.587	ENSMGAG00000001496	-	100	99.587	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.312	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	97.312	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSMICG00000027770	XPO1	100	98.424	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.590	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	97.590	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	95.855	ENSMMOG00000008001	-	99	95.855	Mola_mola
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	92.373	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.373	Mola_mola
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.498	ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.498	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000006512	XPO1	87	91.640	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.640	Monopterus_albus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	94.995	ENSMALG00000007085	-	100	94.995	Monopterus_albus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.498	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	97.498	Mus_caroli
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.590	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	97.590	Mus_musculus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.590	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.590	Mus_pahari
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	97.590	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	97.590	Mus_spretus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.424	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	98.424	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.332	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	98.332	Myotis_lucifugus
ENSTGUG00000006512	XPO1	100	98.239	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	98.239	Nannospalax_galili
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