EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000007221 (Gene tree)
Gene ID: 100227809
Gene Symbol: PRPF6
Alias: ANT-1|C20orf14|Prp6|RP60|SNRNP102|TOM|U5-102K|bB152O15.1|hPrp6
Full Name: pre-mRNA processing factor 6
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22975 bases
Position: chr20:8915488-8938462
Accession: 15860
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000007474	PRP1_N	PF06424.12	8.9e-58	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000007550	PRPF6-201	2832	-	ENSTGUP00000007474	944 (aa)	-	H0ZA71

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tgu03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.343	ENSG00000101161	PRPF6	100	97.343	Homo_sapiens
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.585	ENSAPOG00000010395	prpf6	96	92.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	96.825	ENSAMEG00000001916	PRPF6	99	96.825	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.691	ENSACIG00000019862	prpf6	96	93.008	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.691	ENSAOCG00000012988	prpf6	96	93.008	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	86.291	ENSAPEG00000008301	prpf6	100	86.716	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.161	ENSATEG00000005581	prpf6	96	92.479	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	98.517	ENSACAG00000006464	PRPF6	96	98.517	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.450	ENSANAG00000012661	PRPF6	100	98.115	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.585	ENSACLG00000025875	prpf6	96	92.903	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	93.001	ENSAMXG00000001929	prpf6	96	93.319	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.981	ENSBTAG00000011656	PRPF6	100	97.981	Bos_taurus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.450	ENSCJAG00000010616	PRPF6	100	97.450	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.087	ENSCAFG00000013165	PRPF6	100	98.087	Canis_familiaris
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.087	ENSCAFG00020002050	PRPF6	100	98.087	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.981	ENSCHIG00000018187	PRPF6	100	97.981	Capra_hircus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.768	ENSTSYG00000007814	PRPF6	100	97.768	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000007221	PRPF6	97	97.056	ENSCAPG00000015077	PRPF6	100	97.056	Cavia_aperea
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.406	ENSCPOG00000007518	PRPF6	100	98.406	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	94.049	ENSCCAG00000024564	PRPF6	100	94.049	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.450	ENSCATG00000037473	PRPF6	100	97.450	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	94.580	ENSCLAG00000003854	PRPF6	100	94.580	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	92.397	ENSCSAG00000016742	PRPF6	100	92.397	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	84	80.976	ENSCHOG00000003315	-	100	80.976	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	98.729	ENSCPBG00000013964	PRPF6	97	98.729	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	74.101	ENSCING00000008817	-	99	74.101	Ciona_intestinalis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.237	ENSCANG00000038230	PRPF6	100	97.237	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.193	ENSCGRG00001022666	Prpf6	100	98.193	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	87.460	ENSCSEG00000018561	prpf6	100	87.779	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.479	ENSCVAG00000010550	prpf6	96	92.797	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	92.667	ENSDARG00000091367	prpf6	99	92.986	Danio_rerio
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.768	ENSDNOG00000040544	PRPF6	100	97.768	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	91	97.664	ENSDORG00000005406	Prpf6	100	97.664	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	72.068	FBgn0036828	CG6841	99	72.495	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000007221	PRPF6	85	95.468	ENSETEG00000004447	PRPF6	85	95.468	Echinops_telfairi
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	87.831	ENSEBUG00000008835	prpf6	100	87.831	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.875	ENSEASG00005023115	PRPF6	100	97.875	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	93.624	ENSECAG00000013983	PRPF6	100	93.624	Equus_caballus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	90	100.000	ENSEEUG00000000180	PRPF6	81	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	91.419	ENSELUG00000001945	prpf6	93	91.419	Esox_lucius
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.300	ENSFCAG00000001183	PRPF6	100	98.300	Felis_catus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	99.894	ENSFALG00000010326	-	97	99.894	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.373	ENSFALG00000006046	-	97	92.373	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	96.918	ENSFDAG00000006451	PRPF6	100	98.299	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	93.538	ENSFHEG00000000560	prpf6	96	93.538	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	89.463	ENSGMOG00000015622	prpf6	99	89.463	Gadus_morhua
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	99.575	ENSGALG00000006001	PRPF6	100	99.575	Gallus_gallus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	88.242	ENSGAFG00000021109	prpf6	96	88.559	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	91.314	ENSGACG00000002576	prpf6	99	91.314	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	98.623	ENSGAGG00000008653	PRPF6	97	98.623	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.343	ENSGGOG00000016876	PRPF6	100	97.343	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.585	ENSHBUG00000004496	prpf6	96	92.903	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.300	ENSHGLG00000009222	PRPF6	100	98.300	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000007221	PRPF6	97	98.255	ENSHGLG00100016600	PRPF6	100	98.255	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	91.419	ENSHCOG00000011513	prpf6	96	91.737	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	93.220	ENSIPUG00000004912	prpf6	97	93.220	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	95.541	ENSSTOG00000002922	PRPF6	100	95.541	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.406	ENSJJAG00000000836	Prpf6	100	98.406	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.373	ENSKMAG00000017800	prpf6	96	92.691	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	91.843	ENSLBEG00000012582	prpf6	96	91.737	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	95.127	ENSLOCG00000004827	prpf6	95	95.127	Lepisosteus_oculatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.343	ENSLAFG00000005272	PRPF6	100	97.343	Loxodonta_africana
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.237	ENSMFAG00000037542	PRPF6	100	97.237	Macaca_fascicularis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	90.658	ENSMMUG00000015558	PRPF6	98	98.960	Macaca_mulatta
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	82.945	ENSMNEG00000045555	PRPF6	100	82.945	Macaca_nemestrina
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.691	ENSMAMG00000010718	prpf6	96	93.008	Mastacembelus_armatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.063	ENSMZEG00005015261	-	99	92.381	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000007221	PRPF6	93	92.404	ENSMZEG00005026539	prpf6	100	92.744	Maylandia_zebra
ENSTGUG00000007221	PRPF6	97	99.782	ENSMGAG00000006634	PRPF6	100	99.782	Meleagris_gallopavo
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.193	ENSMAUG00000013969	Prpf6	100	98.193	Mesocricetus_auratus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	87	97.202	ENSMICG00000017793	PRPF6	99	97.202	Microcebus_murinus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.193	ENSMOCG00000001701	Prpf6	100	98.193	Microtus_ochrogaster
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	92.136	ENSMMOG00000020419	prpf6	100	92.455	Mola_mola
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.890	ENSMODG00000017051	PRPF6	99	98.890	Monodelphis_domestica
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	92.911	ENSMALG00000000089	prpf6	100	92.911	Monopterus_albus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	91.605	MGP_CAROLIEiJ_G0024814	Prpf6	100	98.148	Mus_caroli
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.193	ENSMUSG00000002455	Prpf6	100	98.193	Mus_musculus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.193	MGP_PahariEiJ_G0026262	Prpf6	100	98.193	Mus_pahari
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.193	MGP_SPRETEiJ_G0025741	Prpf6	100	98.193	Mus_spretus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	91	97.855	ENSMPUG00000008673	PRPF6	99	97.855	Mustela_putorius_furo
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.406	ENSNGAG00000003365	Prpf6	100	98.406	Nannospalax_galili
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.691	ENSNBRG00000015025	prpf6	96	93.008	Neolamprologus_brichardi
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.237	ENSNLEG00000010208	PRPF6	100	97.237	Nomascus_leucogenys
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	89.921	ENSMEUG00000009824	-	90	89.921	Notamacropus_eugenii
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	92.242	ENSODEG00000004841	PRPF6	100	92.242	Octodon_degus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.585	ENSONIG00000017406	prpf6	96	92.903	Oreochromis_niloticus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.937	ENSOANG00000004920	PRPF6	100	98.937	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	96.137	ENSOCUG00000014151	PRPF6	100	96.137	Oryctolagus_cuniculus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.479	ENSORLG00000009592	prpf6	96	92.479	Oryzias_latipes
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.585	ENSORLG00020001458	prpf6	96	92.585	Oryzias_latipes_hni
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.585	ENSORLG00015018762	prpf6	96	92.585	Oryzias_latipes_hsok
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.161	ENSOMEG00000012174	prpf6	96	92.479	Oryzias_melastigma
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	90.340	ENSOGAG00000007573	PRPF6	100	90.340	Otolemur_garnettii
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	97.352	ENSOARG00000008776	PRPF6	99	97.352	Ovis_aries
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.343	ENSPPAG00000008686	PRPF6	100	97.343	Pan_paniscus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.193	ENSPPRG00000008497	PRPF6	100	98.193	Panthera_pardus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	97	98.146	ENSPTIG00000011184	PRPF6	97	98.146	Panthera_tigris_altaica
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.343	ENSPTRG00000013765	PRPF6	100	97.343	Pan_troglodytes
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	97.024	ENSPANG00000024135	PRPF6	100	97.024	Papio_anubis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	94.492	ENSPKIG00000005627	prpf6	99	94.492	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTGUG00000007221	PRPF6	93	98.980	ENSPSIG00000007717	PRPF6	100	98.980	Pelodiscus_sinensis
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	89.947	ENSPMGG00000008925	prpf6	96	90.053	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.087	ENSPEMG00000016036	Prpf6	100	98.087	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	88.523	ENSPMAG00000006144	prpf6	99	88.523	Petromyzon_marinus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	99	98.937	ENSPCIG00000017909	PRPF6	100	98.937	Phascolarctos_cinereus
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	93.008	ENSPFOG00000006431	prpf6	96	93.326	Poecilia_formosa
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	92.903	ENSPLAG00000005974	prpf6	96	93.220	Poecilia_latipinna
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	93.114	ENSPMEG00000009977	prpf6	96	93.432	Poecilia_mexicana
ENSTGUG00000007221	PRPF6	100	93.008	ENSPREG00000017993	prpf6	92	93.326	Poecilia_reticulata
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