EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000007832 (Gene tree)
Gene ID: 100231734
Gene Symbol: RAB7A
Alias: RAB7
Full Name: RAB7A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3697 bases
Position: chr12:9341116-9344812
Accession: 100231734
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000008087	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000008172	RAB7A-201	1237	-	ENSTGUP00000008087	207 (aa)	XP_002198172	H0ZBX9

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tgu04137	Mitophagy - animal	KEGG
tgu04140	Autophagy - animal	KEGG
tgu04144	Endocytosis	KEGG
tgu04145	Phagosome	KEGG
tgu05132	Salmonella infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTGUG00000007832	RAB7A	97	34.597	ENSTGUG00000005228	RAB33A	99	34.597
ENSTGUG00000007832	RAB7A	78	40.491	ENSTGUG00000009279	RAB11A	73	40.491
ENSTGUG00000007832	RAB7A	77	39.375	ENSTGUG00000003680	-	76	39.375
ENSTGUG00000007832	RAB7A	86	37.778	ENSTGUG00000011182	RAB2A	83	37.778
ENSTGUG00000007832	RAB7A	76	33.121	ENSTGUG00000012235	KRAS	87	33.929
ENSTGUG00000007832	RAB7A	77	32.500	ENSTGUG00000004727	MRAS	80	33.918
ENSTGUG00000007832	RAB7A	96	36.500	ENSTGUG00000013470	RAB6A	94	36.500
ENSTGUG00000007832	RAB7A	76	35.185	ENSTGUG00000012794	RAB23	72	35.593
ENSTGUG00000007832	RAB7A	97	35.849	ENSTGUG00000006657	RAB14	95	35.849
ENSTGUG00000007832	RAB7A	77	30.151	ENSTGUG00000008797	RAB20	81	30.151
ENSTGUG00000007832	RAB7A	78	40.491	ENSTGUG00000000084	-	72	40.491
ENSTGUG00000007832	RAB7A	79	35.366	ENSTGUG00000013171	-	96	35.366
ENSTGUG00000007832	RAB7A	87	34.426	ENSTGUG00000017468	-	83	34.426
ENSTGUG00000007832	RAB7A	73	33.775	ENSTGUG00000000988	NRAS	83	34.568
ENSTGUG00000007832	RAB7A	80	34.132	ENSTGUG00000016028	-	76	34.132
ENSTGUG00000007832	RAB7A	83	41.860	ENSTGUG00000003236	RAB5A	78	41.860
ENSTGUG00000007832	RAB7A	80	32.143	ENSTGUG00000009776	-	94	32.143
ENSTGUG00000007832	RAB7A	84	36.571	ENSTGUG00000009985	-	72	36.571
ENSTGUG00000007832	RAB7A	79	39.264	ENSTGUG00000002328	RAB1A	78	39.264
ENSTGUG00000007832	RAB7A	88	36.082	ENSTGUG00000002436	RAB33B	84	36.082
ENSTGUG00000007832	RAB7A	79	37.576	ENSTGUG00000003675	RAB25	75	37.576
ENSTGUG00000007832	RAB7A	88	37.500	ENSTGUG00000012941	RAB30	88	37.500
ENSTGUG00000007832	RAB7A	83	37.791	ENSTGUG00000009359	RAB35	83	37.791
ENSTGUG00000007832	RAB7A	81	37.870	ENSTGUG00000009889	RAB12	78	34.673
ENSTGUG00000007832	RAB7A	86	56.425	ENSTGUG00000006516	RAB9B	99	52.261
ENSTGUG00000007832	RAB7A	85	34.254	ENSTGUG00000003786	RAB17	82	34.254
ENSTGUG00000007832	RAB7A	81	33.505	ENSTGUG00000001105	-	81	33.505
ENSTGUG00000007832	RAB7A	82	40.936	ENSTGUG00000008195	RAB22A	86	40.936

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSG00000075785	RAB7A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSAPOG00000016091	-	100	98.068	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSAPOG00000002585	RAB7A	100	97.101	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSAMEG00000015249	RAB7A	100	99.034	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	95.169	ENSACIG00000022381	-	100	95.169	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	85.990	ENSACIG00000022208	-	100	85.990	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.585	ENSACIG00000013630	RAB7A	100	97.585	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSAOCG00000008820	-	100	98.068	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSAOCG00000005772	RAB7A	100	97.101	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSAPEG00000000306	RAB7A	100	97.101	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSAPEG00000017200	RAB7A	100	98.068	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSATEG00000017237	RAB7A	100	97.101	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSATEG00000002860	RAB7A	100	98.068	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	85	99.435	ENSAPLG00000004323	RAB7A	100	99.435	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.517	ENSACAG00000005993	RAB7A	100	99.517	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSANAG00000029692	RAB7A	100	99.034	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	94.203	ENSACLG00000024502	-	100	94.203	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	77.143	ENSACLG00000024456	-	100	77.143	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSACLG00000018847	RAB7A	100	97.101	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.585	ENSAMXG00000032027	rab7a	100	97.585	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	90.338	ENSAMXG00000031957	zgc:100918	100	90.338	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	93.720	ENSAMXG00000002254	-	100	93.720	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.585	ENSBTAG00000010193	RAB7A	100	97.585	Bos_taurus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSCJAG00000017521	RAB7A	100	99.034	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.551	ENSCAFG00000004157	RAB7A	100	98.551	Canis_familiaris
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.551	ENSCAFG00020004847	RAB7A	100	98.551	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSCHIG00000001138	RAB7A	100	98.068	Capra_hircus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSTSYG00000002313	RAB7A	100	99.034	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.551	ENSCAPG00000010881	RAB7A	100	98.551	Cavia_aperea
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.551	ENSCPOG00000034570	RAB7A	100	98.551	Cavia_porcellus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSCCAG00000036322	RAB7A	100	99.034	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	75.845	ENSCLAG00000006333	RAB7A	100	75.845	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSCSAG00000008628	RAB7A	100	99.034	Chlorocebus_sabaeus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	85	99.432	ENSCHOG00000000365	RAB7A	100	99.432	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSCPBG00000014343	RAB7A	100	99.034	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	83.092	ENSCING00000007769	-	100	83.092	Ciona_intestinalis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	82.609	ENSCSAVG00000011162	-	100	82.609	Ciona_savignyi
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSCANG00000041683	RAB7A	100	99.034	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.551	ENSCGRG00001021807	Rab7	100	98.551	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.551	ENSCGRG00000011649	Rab7	100	98.551	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSCSEG00000005357	-	100	97.101	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	92.271	ENSCSEG00000002970	RAB7A	93	92.271	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.585	ENSCVAG00000005429	-	100	97.585	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	96.618	ENSCVAG00000000281	RAB7A	100	96.618	Cyprinodon_variegatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	90.338	ENSDARG00000087243	zgc:100918	100	90.338	Danio_rerio
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	87.440	ENSDARG00000021287	rab7b	100	87.440	Danio_rerio
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.585	ENSDARG00000020497	rab7a	100	97.585	Danio_rerio
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSDORG00000027671	-	100	99.034	Dipodomys_ordii
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	76.329	FBgn0015795	Rab7	100	76.329	Drosophila_melanogaster
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	76.329	ENSEBUG00000003339	-	100	76.329	Eptatretus_burgeri
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSEASG00005006800	RAB7A	100	98.068	Equus_asinus_asinus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.585	ENSECAG00000012559	RAB7A	100	97.585	Equus_caballus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	89.855	ENSELUG00000000175	zgc:100918	100	89.855	Esox_lucius
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSELUG00000006539	RAB7A	100	97.101	Esox_lucius
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSELUG00000016682	-	100	97.101	Esox_lucius
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSFCAG00000022971	-	100	99.034	Felis_catus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	100.000	ENSFALG00000007930	RAB7A	100	100.000	Ficedula_albicollis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.551	ENSFDAG00000008524	RAB7A	100	98.551	Fukomys_damarensis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSFHEG00000007101	RAB7A	100	98.068	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSFHEG00000005588	RAB7A	88	97.101	Fundulus_heteroclitus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSGMOG00000007712	RAB7A	99	98.068	Gadus_morhua
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSGMOG00000011308	-	100	97.101	Gadus_morhua
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSGALG00000005902	RAB7A	100	99.034	Gallus_gallus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	96.135	ENSGAFG00000020476	RAB7A	100	96.135	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSGAFG00000021688	-	100	98.068	Gambusia_affinis
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSGACG00000009647	RAB7A	100	97.101	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSGACG00000000807	-	99	98.068	Gasterosteus_aculeatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSGAGG00000012234	RAB7A	100	99.034	Gopherus_agassizii
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSGGOG00000005557	RAB7A	100	99.034	Gorilla_gorilla
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSHBUG00000010852	RAB7A	100	97.101	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	94.203	ENSHBUG00000009014	-	100	94.203	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	76.667	ENSHBUG00000009027	-	100	76.667	Haplochromis_burtoni
ENSTGUG00000007832	RAB7A	85	99.432	ENSHGLG00000000127	RAB7A	88	99.432	Heterocephalus_glaber_female
ENSTGUG00000007832	RAB7A	96	95.980	ENSHGLG00100008802	RAB7A	96	95.980	Heterocephalus_glaber_male
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	93.237	ENSHCOG00000004225	-	99	96.000	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	97.101	ENSHCOG00000016322	RAB7A	100	97.101	Hippocampus_comes
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	90.338	ENSIPUG00000007246	rab7a	100	90.338	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	96.618	ENSIPUG00000022445	RAB7A	100	96.618	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	90.338	ENSIPUG00000017200	-	100	90.338	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	98.068	ENSSTOG00000028487	RAB7A	100	98.068	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	99.034	ENSJJAG00000014204	Rab7	100	99.034	Jaculus_jaculus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	96.618	ENSKMAG00000006812	RAB7A	100	96.618	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000007832	RAB7A	100	94.686	ENSKMAG00000020013	-	100	94.686	Kryptolebias_marmoratus
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