EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTGUG00000014736 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ETF1
Alias: ERF|ERF1|RF1|SUP45L1|TB3-1
Full Name: eukaryotic translation termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Taeniopygia_guttata
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10518 bases
Position: chr13_random:1071792-1082309
Accession: 3477
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTGUP00000015114	eRF1_2	PF03464.15	1.4e-46	1	1
ENSTGUP00000015114	eRF1_3	PF03465.15	4.4e-39	1	1
ENSTGUP00000015114	eRF1_1	PF03463.15	2.2e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTGUT00000015349	ETF1-201	1619	-	ENSTGUP00000015114	409 (aa)	-	H0ZWW3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTGUG00000014736	ETF1	100	100.000	ENSG00000120705	ETF1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.037	ENSAPOG00000004622	etf1a	93	94.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	98.775	ENSAMEG00000016547	ETF1	93	98.775	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	96.725	ENSACIG00000014875	etf1a	93	96.569	Amphilophus_citrinellus
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.037	ENSAOCG00000015573	etf1a	93	94.928	Amphiprion_ocellaris
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.037	ENSAPEG00000015124	etf1a	93	94.928	Amphiprion_percula
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.037	ENSATEG00000009599	etf1a	93	94.928	Anabas_testudineus
ENSTGUG00000014736	ETF1	100	100.000	ENSAPLG00000009740	ETF1	100	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	99.755	ENSACAG00000015818	ETF1	93	99.755	Anolis_carolinensis
ENSTGUG00000014736	ETF1	100	100.000	ENSANAG00000025638	-	97	100.000	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	89.926	ENSANAG00000014418	-	93	89.926	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	80.637	ENSANAG00000023525	-	93	80.637	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	74.693	ENSANAG00000021905	-	92	74.693	Aotus_nancymaae
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.285	ENSACLG00000010368	etf1a	93	95.169	Astatotilapia_calliptera
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.285	ENSAMXG00000040685	etf1b	93	94.928	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	94.293	ENSAMXG00000037774	etf1a	93	93.961	Astyanax_mexicanus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSBTAG00000011415	ETF1	93	100.000	Bos_taurus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	78.431	WBGene00020269	erfa-1	92	78.431	Caenorhabditis_elegans
ENSTGUG00000014736	ETF1	100	100.000	ENSCJAG00000006776	ETF1	97	100.000	Callithrix_jacchus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSCAFG00000001282	ETF1	93	100.000	Canis_familiaris
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSCAFG00000015396	-	93	100.000	Canis_familiaris
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSCAFG00020010400	ETF1	93	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSCHIG00000009685	-	93	100.000	Capra_hircus
ENSTGUG00000014736	ETF1	92	77.454	ENSTSYG00000036069	-	95	77.461	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSTSYG00000011754	ETF1	93	100.000	Carlito_syrichta
ENSTGUG00000014736	ETF1	100	74.572	ENSCAPG00000009035	ETF1	98	74.572	Cavia_aperea
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSCPOG00000002361	ETF1	93	100.000	Cavia_porcellus
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ENSTGUG00000014736	ETF1	100	100.000	ENSCCAG00000035658	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	78.922	ENSCATG00000030269	-	93	78.922	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000014736	ETF1	100	99.756	ENSCATG00000031628	-	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000014736	ETF1	92	66.138	ENSCATG00000029533	-	96	66.138	Cercocebus_atys
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSCLAG00000007158	-	93	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	71.216	ENSCLAG00000001221	-	91	71.216	Chinchilla_lanigera
ENSTGUG00000014736	ETF1	63	92.607	ENSCHOG00000007697	ETF1	59	92.607	Choloepus_hoffmanni
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSCPBG00000021239	ETF1	93	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	87.376	ENSCING00000002292	-	93	87.376	Ciona_intestinalis
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	86.386	ENSCSAVG00000003039	-	93	86.386	Ciona_savignyi
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	74.510	ENSCANG00000043675	-	83	74.510	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000014736	ETF1	93	74.219	ENSCANG00000037950	-	96	74.219	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000014736	ETF1	85	77.364	ENSCANG00000035977	-	96	77.364	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	84.559	ENSCGRG00001007046	Etf1	93	84.559	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTGUG00000014736	ETF1	100	99.756	ENSCGRG00000008154	Etf1	99	99.756	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.037	ENSCSEG00000006451	etf1a	93	94.928	Cynoglossus_semilaevis
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.037	ENSCVAG00000011438	etf1a	93	94.928	Cyprinodon_variegatus
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ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSDNOG00000010830	ETF1	93	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSDORG00000006134	Etf1	93	100.000	Dipodomys_ordii
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ENSTGUG00000014736	ETF1	64	70.076	ENSEBUG00000014212	-	57	70.076	Eptatretus_burgeri
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ENSTGUG00000014736	ETF1	99	78.922	ENSGGOG00000040995	-	93	78.922	Gorilla_gorilla
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ENSTGUG00000014736	ETF1	99	94.203	ENSIPUG00000008892	etf1	93	94.203	Ictalurus_punctatus
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	100.000	ENSSTOG00000025996	ETF1	93	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSTGUG00000014736	ETF1	99	95.411	ENSKMAG00000009423	etf1a	93	95.411	Kryptolebias_marmoratus
ENSTGUG00000014736	ETF1	97	95.037	ENSLBEG00000001321	etf1a	93	94.928	Labrus_bergylta
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	97.549	ENSLACG00000004339	ETF1	93	97.549	Latimeria_chalumnae
ENSTGUG00000014736	ETF1	99	97.794	ENSLOCG00000009715	etf1b	92	97.794	Lepisosteus_oculatus
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