EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000002277 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: zfp36l1a
Alias: fc06f10|wu:fc06f10|zfp36l1l|zgc:77882
Full Name: zinc finger protein 36%2C C3H type-like 1a
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1913 bases
Position: chrUn_random:87498922-87500834
Accession: ZDB-GENE-030131-9860
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000004746	zf-CCCH	PF00642.24	5.1e-23	1	2
ENSTNIP00000004746	zf-CCCH	PF00642.24	5.1e-23	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000004891	-	1026	-	ENSTNIP00000004746	341 (aa)	-	H3C924

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000002277's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000002277's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	47.287	ENSTNIG00000017103	zfp36l2	99	48.705

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSG00000185650	ZFP36L1	99	60.615	Homo_sapiens
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	87.332	ENSAPOG00000020931	zfp36l1a	99	86.792	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSAMEG00000014353	ZFP36L1	99	61.173	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	83.761	ENSACIG00000016314	zfp36l1a	99	83.761	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	87.027	ENSAOCG00000019239	zfp36l1a	99	86.486	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	87.027	ENSAPEG00000010246	zfp36l1a	99	86.486	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	62.873	ENSATEG00000014086	zfp36l1b	99	60.434	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	84.865	ENSATEG00000004546	zfp36l1a	99	85.676	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSANAG00000037142	ZFP36L1	99	61.173	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	81.671	ENSACLG00000007768	zfp36l1a	99	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	57.778	ENSAMXG00000029887	zfp36l1b	99	58.611	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	70.933	ENSAMXG00000036093	zfp36l1a	99	70.933	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSBTAG00000025434	ZFP36L1	99	60.894	Bos_taurus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSCJAG00000042187	ZFP36L1	99	60.894	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSCAFG00000016497	ZFP36L1	99	60.615	Canis_familiaris
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSCAFG00020005951	ZFP36L1	99	60.615	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSCHIG00000022716	ZFP36L1	99	60.894	Capra_hircus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSTSYG00000034276	ZFP36L1	99	60.615	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	96	60.997	ENSCAPG00000005988	ZFP36L1	90	62.080	Cavia_aperea
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSCPOG00000040127	ZFP36L1	99	60.894	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSCCAG00000007439	ZFP36L1	99	60.894	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSCATG00000043529	ZFP36L1	99	60.894	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSCLAG00000003695	ZFP36L1	99	61.173	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSCSAG00000013114	ZFP36L1	99	60.894	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.017	ENSCPBG00000021516	ZFP36L1	99	60.734	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSCANG00000031505	ZFP36L1	99	60.894	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSCGRG00001010926	Zfp36l1	99	61.173	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSCGRG00000007735	Zfp36l1	99	60.894	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	84.140	ENSCSEG00000007039	zfp36l1a	99	82.527	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	44.963	ENSCVAG00000020132	-	96	45.946	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	79.032	ENSCVAG00000008482	zfp36l1a	99	77.628	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	99	64.738	ENSDARG00000021443	zfp36l1b	99	63.912	Danio_rerio
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	72.533	ENSDARG00000016154	zfp36l1a	99	70.557	Danio_rerio
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	66	45.122	ENSDARG00000040725	zgc:114130	64	44.867	Danio_rerio
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	75	60.662	ENSDNOG00000005159	ZFP36L1	100	61.029	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSDORG00000029853	Zfp36l1	99	60.894	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSEASG00005008760	ZFP36L1	99	61.173	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSECAG00000018860	ZFP36L1	99	61.173	Equus_caballus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	67	48.347	ENSELUG00000013045	sb:cb81	63	46.281	Esox_lucius
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	72.519	ENSELUG00000021506	zfp36l1a	99	68.861	Esox_lucius
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	64.304	ENSELUG00000008675	zfp36l1b	99	66.142	Esox_lucius
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSFCAG00000026617	ZFP36L1	99	61.173	Felis_catus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	94	61.976	ENSFALG00000015146	ZFP36L1	96	62.346	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSFDAG00000014938	ZFP36L1	99	61.173	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	77.297	ENSFHEG00000001313	zfp36l1a	99	77.507	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.734	ENSGALG00000039228	ZFP36L1	99	60.452	Gallus_gallus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	75.200	ENSGAFG00000018711	zfp36l1a	99	75.401	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	65	42.742	ENSGAFG00000015700	sb:cb81	58	45.946	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	87.812	ENSGACG00000011271	zfp36l1a	99	88.089	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.017	ENSGAGG00000007315	ZFP36L1	99	60.452	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSGGOG00000041615	ZFP36L1	99	60.615	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	81.671	ENSHBUG00000016051	zfp36l1a	99	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSHGLG00000016491	ZFP36L1	99	60.894	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSHGLG00100018163	ZFP36L1	99	60.894	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	57	62.694	ENSHCOG00000012747	zfp36l1b	91	62.694	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	78.075	ENSHCOG00000013932	zfp36l1a	99	78.342	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	70.400	ENSIPUG00000023681	ZFP36L1	99	69.600	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSSTOG00000009758	ZFP36L1	99	60.894	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	93	60.060	ENSJJAG00000017247	Zfp36l1	87	60.870	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	80.707	ENSKMAG00000013156	zfp36l1a	99	80.978	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	92	89.783	ENSLBEG00000008102	zfp36l1a	86	89.783	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	99	46.867	ENSLACG00000012879	-	99	44.389	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	63.128	ENSLACG00000015967	ZFP36L1	99	62.570	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	38.400	ENSLACG00000015732	sb:cb81	65	49.798	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	99	34.232	ENSLACG00000015980	-	67	38.636	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	69.459	ENSLOCG00000013957	zfp36l1a	99	70.270	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	41.706	ENSLOCG00000016446	-	97	43.160	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.453	ENSLAFG00000028594	ZFP36L1	99	61.453	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSMFAG00000033125	ZFP36L1	99	60.894	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSMMUG00000044603	ZFP36L1	99	60.894	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	99	60.674	ENSMNEG00000032614	ZFP36L1	99	60.674	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSMLEG00000044247	ZFP36L1	99	60.894	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	83.696	ENSMAMG00000000274	zfp36l1a	87	81.522	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	81.671	ENSMZEG00005014679	zfp36l1a	99	80.000	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSMAUG00000020087	Zfp36l1	99	61.173	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSMICG00000037296	ZFP36L1	99	60.894	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSMOCG00000003189	Zfp36l1	99	61.173	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	85.405	ENSMMOG00000011231	zfp36l1a	99	86.486	Mola_mola
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	56.704	ENSMODG00000010122	ZFP36L1	99	56.704	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	56.720	ENSMALG00000016768	zfp36l1b	85	60.372	Monopterus_albus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	66	65.909	ENSMALG00000021140	-	97	40.171	Monopterus_albus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	80.000	ENSMALG00000021238	zfp36l1a	99	81.081	Monopterus_albus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	MGP_CAROLIEiJ_G0017893	Zfp36l1	99	60.894	Mus_caroli
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSMUSG00000021127	Zfp36l1	99	60.894	Mus_musculus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	MGP_PahariEiJ_G0029649	Zfp36l1	99	60.894	Mus_pahari
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	MGP_SPRETEiJ_G0018738	Zfp36l1	99	60.894	Mus_spretus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	58.101	ENSMPUG00000007282	ZFP36L1	99	58.101	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSNGAG00000024367	Zfp36l1	99	61.173	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	81.941	ENSNBRG00000010827	zfp36l1a	99	80.270	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSNLEG00000001046	ZFP36L1	99	60.615	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	62.570	ENSMEUG00000003070	ZFP36L1	99	62.291	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSODEG00000014162	ZFP36L1	99	61.173	Octodon_degus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	85.196	ENSONIG00000000973	zfp36l1a	99	84.916	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSOCUG00000003168	ZFP36L1	99	60.615	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	82.880	ENSORLG00000029605	zfp36l1a	99	82.337	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	82.609	ENSORLG00020021609	zfp36l1a	99	82.065	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	83.152	ENSORLG00015019460	zfp36l1a	99	82.609	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	45.906	ENSOMEG00000001264	-	96	46.269	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	83.243	ENSOMEG00000018296	zfp36l1a	99	82.703	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSOGAG00000010033	ZFP36L1	99	60.894	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	48.725	ENSOARG00000021177	ZFP36L1	99	48.442	Ovis_aries
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.335	ENSPPAG00000027452	ZFP36L1	99	60.615	Pan_paniscus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSPPRG00000015094	ZFP36L1	99	61.173	Panthera_pardus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	55.028	ENSPTIG00000019155	ZFP36L1	99	55.028	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.335	ENSPTRG00000051193	ZFP36L1	99	60.615	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSPANG00000009731	ZFP36L1	99	60.894	Papio_anubis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	70.765	ENSPKIG00000009504	-	99	70.572	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	67.480	ENSPKIG00000007298	ZFP36L1	99	68.649	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.864	ENSPSIG00000008151	ZFP36L1	99	61.582	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	82.709	ENSPMGG00000000442	zfp36l1a	99	82.709	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	78	40.357	ENSPMGG00000009232	sb:cb81	52	51.899	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSPEMG00000011361	Zfp36l1	99	61.173	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	62.570	ENSPCIG00000019895	ZFP36L1	88	62.291	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	76.330	ENSPFOG00000017436	zfp36l1a	99	75.467	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	74.462	ENSPLAG00000005641	zfp36l1a	99	74.663	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	76.596	ENSPMEG00000013028	zfp36l1a	99	75.733	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	75.202	ENSPREG00000013484	zfp36l1a	99	75.405	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.335	ENSPPYG00000005933	ZFP36L1	99	60.335	Pongo_abelii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSPCAG00000005383	ZFP36L1	99	61.173	Procavia_capensis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.615	ENSPCOG00000022518	ZFP36L1	99	60.615	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	95	60.947	ENSPVAG00000011686	ZFP36L1	96	61.162	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	81.671	ENSPNYG00000004953	zfp36l1a	99	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	91	64.013	ENSPNAG00000000386	zfp36l1b	87	65.287	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	70.822	ENSPNAG00000015712	zfp36l1a	99	70.292	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	69	50.201	ENSPNAG00000030063	sb:cb81	63	50.201	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.335	ENSRNOG00000058646	Zfp36l1	99	60.615	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	96	60.526	ENSRBIG00000040496	-	93	62.080	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSRROG00000040595	ZFP36L1	99	60.894	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSSBOG00000025671	ZFP36L1	99	60.894	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	62.291	ENSSHAG00000011647	ZFP36L1	99	62.011	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	64.624	ENSSFOG00015020649	ZFP36L1	99	68.156	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	67.663	ENSSFOG00015002575	-	99	66.848	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	82.940	ENSSMAG00000012821	zfp36l1a	64	82.677	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	85	55.305	ENSSMAG00000018208	-	79	62.205	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.705	ENSSDUG00000001019	zfp36l1b	99	59.350	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	86.757	ENSSDUG00000009669	zfp36l1a	99	86.216	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	86.757	ENSSLDG00000021382	zfp36l1a	99	86.216	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	58.808	ENSSLDG00000011048	zfp36l1b	99	57.995	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	62.254	ENSSPUG00000002037	ZFP36L1	99	61.972	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	87.027	ENSSPAG00000010371	zfp36l1a	99	86.486	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSSSCG00000028304	ZFP36L1	99	60.894	Sus_scrofa
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	78	62.094	ENSTGUG00000011494	ZFP36L1	99	62.007	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	89.130	ENSTRUG00000022418	zfp36l1	99	89.130	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSTTRG00000003475	ZFP36L1	99	60.894	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSUAMG00000010751	ZFP36L1	99	61.173	Ursus_americanus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	61.173	ENSUMAG00000010126	ZFP36L1	99	61.173	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	60.894	ENSVVUG00000003551	ZFP36L1	99	60.894	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	62.500	ENSXETG00000016987	zfp36l1	88	64.174	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	76.471	ENSXCOG00000001799	zfp36l1a	99	75.871	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	100	75.467	ENSXMAG00000022234	zfp36l1a	99	75.936	Xiphophorus_maculatus
ENSTNIG00000002277	zfp36l1a	65	42.742	ENSXMAG00000004681	sb:cb81	58	45.946	Xiphophorus_maculatus