EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000003295 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO2 (1 of many)
Alias: -
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8047 bases
Position: chr3:8988163-8996209
Accession: 19998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000005879	IBN_N	PF03810.19	6.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000006027	TNPO2 (1 of many)-201	2584	-	ENSTNIP00000005879	829 (aa)	-	H3CCA7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000003295	TNPO2	66	75.717	ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	75.926
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	86.636	ENSTNIG00000014071	TNPO2	100	86.636

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSG00000105576	TNPO2	100	89.286	Homo_sapiens
ENSTNIG00000003295	TNPO2	78	95.101	ENSAPOG00000013185	-	96	77.503	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	85.489	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	70.628	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	81.271	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000003295	TNPO2	83	95.954	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	86.122	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	84	93.372	ENSACIG00000009586	-	100	83.938	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSAOCG00000010152	-	100	85.489	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	89.426	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	89.426	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	89.426	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	89.426	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSAPEG00000013268	-	100	85.489	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSATEG00000019171	-	100	85.489	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.414	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	88.414	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	94.397	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	84.234	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	83.540	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.414	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	88.414	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.660	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	82.151	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	83.089	Bos_taurus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.139	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	82.720	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	83.540	Canis_familiaris
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	83.766	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	88.825	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	78.595	Capra_hircus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	83.653	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000003295	TNPO2	91	89.347	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	80.810	Cavia_aperea
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	83.766	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	83.653	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.139	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	82.720	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	83.766	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	83.653	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	94.181	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	84.234	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000003295	TNPO2	94	93.103	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	83.626	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.350	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	82.832	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	83.766	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000003295	TNPO2	84	92.264	ENSCSEG00000011477	-	100	82.558	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	84.831	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	84.831	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	95.474	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	84.624	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	85.489	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	78.090	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	83.577	Danio_rerio
ENSTNIG00000003295	TNPO2	85	91.036	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	73.402	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	89.112	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	87.591	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	75.862	FBgn0024921	Tnpo	100	61.006	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000003295	TNPO2	89	82.915	ENSETEG00000014785	TNPO2	84	82.915	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	83.202	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	83.766	Equus_caballus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	95.474	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	85.794	Esox_lucius
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.350	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	82.720	Felis_catus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	83.766	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000003295	TNPO2	94	92.644	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	84.535	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	95.474	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	84.736	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	81.456	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	81.342	Gadus_morhua
ENSTNIG00000003295	TNPO2	77	94.937	ENSGMOG00000014237	-	90	87.037	Gadus_morhua
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.750	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	85.264	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	94.524	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	87.865	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	94.181	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	84.234	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.414	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	88.414	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSHBUG00000018317	-	100	85.489	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	83.653	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.350	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	86.861	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	87.289	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	87.289	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.534	ENSHCOG00000020440	-	100	85.377	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.750	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	86.052	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	94.181	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	84.927	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	83.766	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.139	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	82.720	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	79.438	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	85.407	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.750	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	85.377	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSLBEG00000005301	-	100	85.714	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.976	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	88.976	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	80.631	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	95.259	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	86.052	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.350	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	82.832	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.361	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	82.720	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	83.653	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	83.653	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000003295	TNPO2	94	91.361	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	82.659	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	86.570	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	86.570	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSMAMG00000011862	-	100	85.489	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSMZEG00005007408	-	100	85.489	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	94.813	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	83.596	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.414	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	88.414	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.103	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	83.653	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	83.766	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000003295	TNPO2	83	93.064	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	81.596	Mola_mola
ENSTNIG00000003295	TNPO2	85	92.795	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	83.227	Mola_mola
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	92.405	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	82.759	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	87.514	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	87.514	Monopterus_albus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	85.264	Monopterus_albus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	83.202	Mus_caroli
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	87.591	Mus_musculus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	83.315	Mus_pahari
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	83.202	Mus_spretus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	83.766	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000003295	TNPO2	94	93.319	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	83.626	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	83.766	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	83.465	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	83.465	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.966	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	85.489	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	65.212	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	74.276	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	88.608	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	77.197	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.319	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	83.766	Octodon_degus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.526	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	88.526	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	92.507	ENSONIG00000017706	-	100	84.633	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	93.750	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	83.559	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	88	92.903	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	88.372	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.976	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	88.976	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000003295	TNPO2	51	92.219	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	78.400	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000003295	TNPO2	51	91.931	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	78.200	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.976	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	88.976	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000003295	TNPO2	51	92.219	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	78.400	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.952	ENSORLG00015005489	tnpo2	100	88.952	Oryzias_latipes_hsok
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ENSTNIG00000003295	TNPO2	100	88.751	ENSOMEG00000014877	TNPO2	100	88.751	Oryzias_melastigma
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