EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000003360 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1a
Alias: im:7151655
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) a
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5887 bases
Position: chrUn_random:28242663-28248549
Accession: ZDB-GENE-050309-201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000005947	CRM1_C	PF08767.11	1.2e-130	1	1
ENSTNIP00000005947	Xpo1	PF08389.12	6.4e-42	1	1
ENSTNIP00000005947	IBN_N	PF03810.19	2.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000006095	-	3198	-	ENSTNIP00000005947	1065 (aa)	-	H3CCH5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSG00000082898	XPO1	100	89.729	Homo_sapiens
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	94.332	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	94.332	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.410	ENSAPOG00000004984	-	100	91.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.392	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	90.392	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	96.471	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	96.471	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	92.234	ENSACIG00000010818	-	100	92.234	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	96.904	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	96.904	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.410	ENSAOCG00000010121	-	100	91.410	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000003360	xpo1a	91	96.894	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	96.894	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.410	ENSAPEG00000007038	-	100	91.410	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.410	ENSATEG00000008816	-	100	91.410	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	96.248	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	96.248	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.570	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	90.570	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.570	ENSACAG00000002501	XPO1	100	90.570	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSANAG00000020802	XPO1	100	89.729	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	96.364	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	96.364	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.317	ENSACLG00000015192	-	100	91.317	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.597	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	91.597	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	92.161	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	92.161	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	90.476	Bos_taurus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	99	50.416	WBGene00002078	xpo-1	99	50.416	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	89.729	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	90.476	Canis_familiaris
ENSTNIG00000003360	xpo1a	93	90.782	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	90.782	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	90.476	Capra_hircus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	90.476	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000003360	xpo1a	53	87.943	ENSCAPG00000006454	-	100	87.943	Cavia_aperea
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.813	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	89.813	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	72.449	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	72.542	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	87.989	ENSCATG00000032674	XPO1	100	90.319	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.196	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	90.196	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	89.729	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	83	91.569	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	91.569	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.570	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	90.570	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000003360	xpo1a	99	78.151	ENSCING00000024562	-	99	78.151	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	99	77.341	ENSCSAVG00000005965	-	99	77.341	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	85.621	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.135	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.449	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	89.449	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.449	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	89.449	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	91.064	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	91.064	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.223	ENSCVAG00000016788	-	100	91.223	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	95.216	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	95.216	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	92.717	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	93.808	Danio_rerio
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.970	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	91.970	Danio_rerio
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.570	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	90.570	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	91	87.346	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	87.346	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000003360	xpo1a	99	68.297	FBgn0020497	emb	99	68.297	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000003360	xpo1a	94	88.745	ENSETEG00000018045	XPO1	94	88.745	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000003360	xpo1a	90	76.245	ENSEBUG00000012580	-	100	84.021	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSEASG00005007223	XPO1	100	90.476	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSECAG00000024920	XPO1	100	90.625	Equus_caballus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	94.043	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.043	Esox_lucius
ENSTNIG00000003360	xpo1a	87	90.364	ENSELUG00000014306	-	99	90.364	Esox_lucius
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	90.476	Felis_catus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.383	ENSFALG00000010989	XPO1	100	90.383	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	88.796	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	88.796	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	95.591	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	95.591	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	93.152	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	93.152	Gadus_morhua
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	85.434	ENSGMOG00000019063	-	100	85.434	Gadus_morhua
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.570	ENSGALG00000029476	XPO1	100	90.570	Gallus_gallus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	95.722	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	95.722	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	91	91.555	ENSGAFG00000003355	-	98	91.555	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.503	ENSGACG00000002743	-	100	91.503	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	96.435	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	96.435	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	90.476	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	89.729	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.410	ENSHBUG00000020037	-	100	91.410	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	96.623	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	96.623	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.103	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	90.103	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.103	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	90.103	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	90.957	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	90.957	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	93.091	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.091	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.690	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	91.690	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.289	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	90.289	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.289	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	90.289	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	95.591	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	95.591	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.850	ENSKMAG00000016218	-	100	90.850	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	93.397	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	93.397	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.410	ENSLBEG00000005740	-	100	91.410	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	71.350	ENSLACG00000018213	XPO1	100	71.350	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.783	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	91.783	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.383	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	90.383	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	89.729	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	89.729	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	89.729	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	88.000	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	88.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	96.341	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	96.341	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.410	ENSMAMG00000010568	-	100	91.410	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.317	ENSMZEG00005018158	-	98	91.761	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	96.623	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	96.623	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000003360	xpo1a	68	89.669	ENSMGAG00000001496	-	100	89.669	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.449	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	89.449	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSMICG00000027770	XPO1	100	90.476	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.729	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	89.729	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000003360	xpo1a	87	91.996	ENSMMOG00000008001	-	99	91.996	Mola_mola
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	96.578	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	96.578	Mola_mola
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.449	ENSMODG00000002831	XPO1	100	89.449	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	94.474	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	94.474	Monopterus_albus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	91.223	ENSMALG00000007085	-	100	91.223	Monopterus_albus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.636	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	89.636	Mus_caroli
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.636	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	89.636	Mus_musculus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.542	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	89.542	Mus_pahari
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	89.636	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	89.636	Mus_spretus
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.476	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	90.476	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.383	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	90.383	Myotis_lucifugus
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