EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000004382 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: SKI2 homolog%2C superkiller viralicidic activity 2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11679 bases
Position: chr21_random:3231839-3243517
Accession: ZDB-GENE-010430-5
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000007016	ResIII	PF04851.15	1.1e-05	1	1
ENSTNIP00000007016	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.3e-32	1	1
ENSTNIP00000007016	DEAD	PF00270.29	5e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000007172	-	3714	-	ENSTNIP00000007016	1237 (aa)	-	H3CFI9

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000004382's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000004382's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000004382	skiv2l	52	32.170	ENSTNIG00000001578	mtrex	99	31.563

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.919	ENSG00000204351	SKIV2L	99	59.841	Homo_sapiens
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.948	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	84.868	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.435	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.603	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	83.603	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.188	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	85.188	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.948	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	84.948	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.708	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	84.868	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	61.172	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	61.406	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.919	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	59.952	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.096	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	85.016	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	77.769	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	77.689	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	59.681	Bos_taurus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	92	41.030	WBGene00008502	skih-2	78	45.373	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	59.745	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.516	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	59.507	Canis_familiaris
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.516	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	59.507	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.677	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	59.602	Capra_hircus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.468	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	59.554	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.838	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	59.585	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.839	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	59.841	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.839	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	59.841	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.097	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.522	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.919	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	59.761	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	89	59.086	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	58.728	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000004382	skiv2l	93	49.614	ENSCING00000005576	-	99	49.616	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.855	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	59.968	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.113	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	59.856	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	82.612	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	82.612	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.087	ENSCVAG00000003072	skiv2l	95	88.935	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	80.175	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	79.777	Danio_rerio
ENSTNIG00000004382	skiv2l	92	64.119	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	99	56.780	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	92	45.017	FBgn0039117	tst	97	44.708	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000004382	skiv2l	68	83.333	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	83.333	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000004382	skiv2l	90	53.694	ENSEBUG00000013680	-	98	52.709	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000004382	skiv2l	92	60.825	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	61.274	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	93	59.813	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	60.151	Equus_caballus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	51	73.913	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	73.913	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	80.223	ENSELUG00000000181	skiv2l	98	84.221	Esox_lucius
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	59.522	Felis_catus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	58.690	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.473	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.307	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	84.147	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	78.981	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	78.411	Gadus_morhua
ENSTNIG00000004382	skiv2l	76	56.726	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.625	Gallus_gallus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.307	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	84.067	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.147	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	84.282	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.081	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	60.080	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.256	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	85.176	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.823	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	59.777	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	58.132	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	58.108	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	79.590	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	79.590	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	77.273	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	77.553	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	59.666	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	59.809	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	56	58.844	ENSLACG00000002986	-	60	58.844	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.129	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.319	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	59.761	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	59.761	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	59.681	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.758	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	59.761	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.812	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	84.732	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.256	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	85.176	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000004382	skiv2l	69	45.957	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	46.072	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.774	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.522	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.000	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	60.080	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	58.819	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.486	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000004382	skiv2l	100	82.249	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	82.249	Mola_mola
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	60.159	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.398	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	80.513	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	80.353	Monopterus_albus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.065	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	59.729	Mus_caroli
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.146	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	59.888	Mus_musculus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.307	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	59.968	Mus_pahari
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.984	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	59.729	Mus_spretus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.355	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	59.522	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.532	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	59.363	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	81.511	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	81.592	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.611	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.646	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000004382	skiv2l	78	57.701	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	58.046	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.435	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.283	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.855	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	59.395	Octodon_degus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.105	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	85.024	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.371	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	60.111	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.853	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	83.613	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.853	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	83.613	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.693	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	83.453	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.574	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	83.574	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.903	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	59.713	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	56.019	ENSOARG00000002411	-	99	55.988	Ovis_aries
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.663	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	59.777	Pan_paniscus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.677	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	59.681	Panthera_pardus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.355	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.363	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.081	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	60.080	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.212	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	59.330	Papio_anubis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	75.099	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	74.762	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	82.053	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	81.649	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.709	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	59.377	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	60.175	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	60.350	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.147	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	83.907	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.987	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	83.747	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.307	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	84.067	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	80.259	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	80.016	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.677	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.681	Pongo_abelii
ENSTNIG00000004382	skiv2l	76	66.346	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	74	83.562	Procavia_capensis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.839	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	59.841	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.178	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	60.111	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	80.695	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	80.517	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	79.628	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	79.409	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.226	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	59.968	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	58.753	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	58.782	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.000	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	60.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000004382	skiv2l	89	38.315	YLR398C	-	77	41.336	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.000	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	59.761	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.044	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	77.345	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	77.027	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.693	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	83.693	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	85.268	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	85.108	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	79.419	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	79.338	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	58.417	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	58.495	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	95	85.232	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	85.232	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	59.745	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	59.761	Sus_scrofa
ENSTNIG00000004382	skiv2l	73	85.027	ENSTRUG00000000966	skiv2l	99	71.509	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000004382	skiv2l	92	62.209	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.209	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	55.403	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.538	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.597	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	59.602	Ursus_americanus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	92	60.739	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	60.929	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	59.435	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	100	58.870	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	57.188	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	56.871	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.845	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	83.764	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.227	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	83.907	Xiphophorus_maculatus