EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000005191 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12649 bases
Position: chr6:578575-591223
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000001587	IBN_N	PF03810.19	2.4e-14	1	1
ENSTNIP00000007867	IBN_N	PF03810.19	5.5e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000008028	-	3231	-	ENSTNIP00000007867	1077 (aa)	-	H3CHY9
ENSTNIT00000000110	-	3267	-	ENSTNIP00000001587	1088 (aa)	-	H3C021

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.547	ENSG00000196497	IPO4	99	43.659	Homo_sapiens
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.861	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	73.321	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.068	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.041	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.125	ENSACIG00000004246	ipo4	99	72.401	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	75.989	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	76.725	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	76.357	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	76.817	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000005191	ipo4	92	78.308	ENSATEG00000017082	ipo4	99	78.706	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000005191	ipo4	84	43.226	ENSACAG00000003973	-	97	43.459	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.309	ENSANAG00000037973	IPO4	99	43.278	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	71.849	ENSACLG00000019742	ipo4	99	72.493	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	66.359	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	67.219	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.478	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.478	Bos_taurus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.959	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	43.831	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	44.725	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	44.588	Canis_familiaris
ENSTNIG00000005191	ipo4	98	44.227	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.669	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.324	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	43.386	Capra_hircus
ENSTNIG00000005191	ipo4	98	43.568	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	43.535	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.941	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	43.848	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.959	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	43.923	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.959	ENSCATG00000040395	IPO4	99	44.015	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.663	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	43.571	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000005191	ipo4	91	43.333	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	40.917	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000005191	ipo4	92	36.027	ENSCING00000008639	-	99	35.833	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000005191	ipo4	93	34.678	ENSCSAVG00000011482	-	99	34.686	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.680	ENSCANG00000029513	IPO4	99	43.646	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	41.867	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	41.959	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	41.867	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	41.959	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.089	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	71.996	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	70.230	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	69.973	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	69.316	ENSDARG00000041493	ipo4	99	69.465	Danio_rerio
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.923	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	43.346	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.884	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	43.848	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.739	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.015	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000005191	ipo4	91	45.132	ENSEASG00005011954	IPO4	96	45.030	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	44.126	ENSECAG00000009909	IPO4	99	44.033	Equus_caballus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	69.181	ENSELUG00000020628	ipo4	99	69.181	Esox_lucius
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.241	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	44.033	Felis_catus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	39.760	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	39.742	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000005191	ipo4	88	73.516	ENSFHEG00000009351	ipo4	96	73.913	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000005191	ipo4	100	70.367	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.018	Gadus_morhua
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	74.105	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	74.380	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000005191	ipo4	100	74.265	ENSGACG00000002276	ipo4	99	73.897	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.587	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	43.646	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.861	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	73.045	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.756	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	43.663	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.386	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	43.293	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	70.909	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	71.000	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	67.739	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	68.015	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	44.218	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	44.126	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.097	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	43.068	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	73.801	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	73.893	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	75.437	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	75.713	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	47.834	ENSLACG00000001428	IPO4	99	48.014	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000005191	ipo4	78	58.779	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	58.779	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.081	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	43.161	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.866	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	43.923	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.866	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	43.923	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.773	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	43.831	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.866	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	43.923	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	74.238	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	74.885	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.861	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	73.505	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.699	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	42.699	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.832	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.033	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.017	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	42.198	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	77.198	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	77.502	Mola_mola
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	41.897	ENSMODG00000003337	IPO4	96	41.882	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.727	ENSMALG00000001587	ipo4	99	72.911	Monopterus_albus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.013	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	43.511	Mus_caroli
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	41.736	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	43.140	Mus_musculus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	41.867	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	43.210	Mus_pahari
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	41.828	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	43.527	Mus_spretus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	44.824	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	44.732	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.386	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	43.201	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.241	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	43.478	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	75.713	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	76.173	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.583	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	43.583	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.808	ENSODEG00000002609	IPO4	99	43.715	Octodon_degus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	77.001	ENSONIG00000014574	ipo4	99	77.001	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.606	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	43.715	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	71.389	ENSORLG00000006457	ipo4	99	72.927	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.335	ENSORLG00020004286	ipo4	99	72.518	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	72.243	ENSORLG00015021856	ipo4	99	72.335	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	71.601	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	71.547	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.135	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	43.571	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000005191	ipo4	98	42.924	ENSOARG00000019188	IPO4	99	42.430	Ovis_aries
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.419	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	42.910	Pan_paniscus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.756	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	44.218	Panthera_pardus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.663	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	44.126	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.309	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	43.370	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.959	ENSPANG00000026278	IPO4	99	44.015	Papio_anubis
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	64.477	ENSPKIG00000007683	-	99	64.477	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	61.914	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	62.123	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	67.801	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	67.518	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	41.567	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	41.897	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000005191	ipo4	94	43.976	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	44.031	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	74.357	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	74.357	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	74.449	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	74.449	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	74.265	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	74.265	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	73.989	ENSPREG00000017605	ipo4	99	74.081	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.401	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	43.370	Pongo_abelii
ENSTNIG00000005191	ipo4	98	44.651	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	44.608	Procavia_capensis
ENSTNIG00000005191	ipo4	98	43.286	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	43.163	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000005191	ipo4	98	43.944	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	43.907	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	74.333	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	74.977	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	68.918	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	68.969	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.183	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	42.421	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.587	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	43.646	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.587	ENSRROG00000011492	IPO4	99	43.646	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.256	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	43.226	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	43.041	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	42.844	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	63.437	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	63.448	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	61.376	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	61.213	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000005191	ipo4	99	76.379	ENSSMAG00000019912	ipo4	99	76.374	Scophthalmus_maximus
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