EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000005288 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1%2C soluble
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4517 bases
Position: chrUn_random:76824024-76828540
Accession: ZDB-GENE-031118-76
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000007967	Aconitase	PF00330.20	4.5e-181	1	1
ENSTNIP00000007967	Aconitase_C	PF00694.19	2.4e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000008128	-	2670	-	ENSTNIP00000007967	890 (aa)	-	H3CI89

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	ENSG00000122729	ACO1	99	79.571	Homo_sapiens
ENSTNIG00000005288	aco1	99	81.777	ENSAPOG00000008670	aco1	99	81.777	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.369	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	79.369	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000005288	aco1	99	81.777	ENSACIG00000014377	aco1	99	81.777	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.677	ENSAOCG00000007699	aco1	99	82.677	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.677	ENSAPEG00000014370	aco1	99	82.677	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.751	ENSATEG00000000560	aco1	99	82.751	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.765	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	77.765	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000005288	aco1	97	78.580	ENSACAG00000001541	ACO1	99	78.580	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.217	ENSANAG00000003359	ACO1	99	78.217	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000005288	aco1	99	83.015	ENSACLG00000007755	aco1	99	83.015	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.496	ENSAMXG00000002499	aco1	99	80.496	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.143	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	79.143	Bos_taurus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.781	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	78.781	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.256	ENSCAFG00000001786	ACO1	98	79.256	Canis_familiaris
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.345	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	79.345	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.256	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	79.256	Capra_hircus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.684	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	79.684	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000005288	aco1	99	63.093	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	62.980	Cavia_aperea
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.330	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	78.330	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.668	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	78.668	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.684	ENSCATG00000045333	ACO1	99	79.684	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.442	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	78.442	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.458	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	79.458	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000005288	aco1	90	62.033	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	61.862	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.781	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	78.781	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.322	ENSCANG00000014847	ACO1	99	79.322	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.023	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	80.023	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.120	ENSCGRG00000004877	-	99	79.120	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.918	ENSCSEG00000018262	aco1	99	78.918	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.903	ENSCVAG00000020264	aco1	99	77.903	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.947	ENSDARG00000026376	aco1	99	80.947	Danio_rerio
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.233	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	79.233	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	ENSDORG00000014246	Aco1	99	79.571	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000005288	aco1	85	60.428	ENSETEG00000012415	-	84	60.428	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000005288	aco1	99	55.932	ENSEBUG00000015441	aco1	97	56.038	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.910	ENSEASG00005004602	ACO1	99	79.910	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.797	ENSECAG00000014846	ACO1	99	79.797	Equus_caballus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	68.284	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	68.284	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.369	ENSELUG00000016812	aco1	97	79.369	Esox_lucius
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.458	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	79.458	Felis_catus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.765	ENSFALG00000001167	ACO1	99	77.765	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.345	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	79.345	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.300	ENSFHEG00000005619	aco1	99	82.300	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.918	ENSGMOG00000005514	aco1	99	78.918	Gadus_morhua
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.765	ENSGALG00000002162	ACO1	99	77.765	Gallus_gallus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.990	ENSGACG00000001637	aco1	99	80.990	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.781	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	78.781	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.458	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	79.458	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000005288	aco1	99	83.127	ENSHBUG00000008952	aco1	99	83.127	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.894	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	78.894	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.894	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	78.894	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.369	ENSHCOG00000015881	aco1	99	79.369	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.820	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	79.820	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.910	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	79.910	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.910	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	79.910	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	81.060	ENSKMAG00000015759	aco1	99	81.060	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.079	ENSLBEG00000013866	aco1	99	77.079	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000005288	aco1	75	67.010	ENSLACG00000000936	ACO1	99	66.815	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	ENSLOCG00000011082	aco1	99	79.571	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.314	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	77.314	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.345	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	79.345	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.458	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	79.458	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.345	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	79.345	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.684	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	79.684	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.002	ENSMAMG00000002915	aco1	99	82.002	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.418	ENSMZEG00005012733	aco1	99	79.083	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000005288	aco1	99	64.627	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	64.627	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.797	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	79.797	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.910	ENSMICG00000006540	ACO1	99	79.910	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.248	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	80.248	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000005288	aco1	99	81.890	ENSMMOG00000020282	aco1	99	81.890	Mola_mola
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.894	ENSMODG00000004463	ACO1	99	78.894	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.115	ENSMALG00000019764	aco1	99	82.115	Monopterus_albus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.135	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	80.135	Mus_caroli
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.023	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	80.023	Mus_musculus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.797	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	79.797	Mus_pahari
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.023	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	80.023	Mus_spretus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	79.571	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.765	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	77.765	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	79.571	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000005288	aco1	99	65.845	ENSNBRG00000008973	aco1	99	65.733	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.233	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	79.233	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000005288	aco1	89	72.831	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	72.831	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000005288	aco1	99	74.831	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	74.831	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000005288	aco1	99	76.524	ENSODEG00000001240	-	99	76.524	Octodon_degus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	74.099	ENSODEG00000015432	-	99	74.099	Octodon_degus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.902	ENSONIG00000019869	aco1	99	82.902	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000005288	aco1	81	79.363	ENSOANG00000012132	ACO1	99	79.363	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.795	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	78.013	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	83.202	ENSORLG00000020656	aco1	99	83.202	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000005288	aco1	99	83.089	ENSORLG00020010991	aco1	99	83.089	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000005288	aco1	99	83.089	ENSORLG00015011785	aco1	99	83.089	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000005288	aco1	99	81.828	ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.828	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.135	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	80.135	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.256	ENSOARG00000014707	ACO1	98	79.256	Ovis_aries
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	79.571	Pan_paniscus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.233	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	79.233	Panthera_pardus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.120	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	79.120	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.571	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	79.571	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.684	ENSPANG00000025270	ACO1	99	79.684	Papio_anubis
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.865	ENSPKIG00000023168	aco1	99	79.865	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000005288	aco1	99	79.120	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	79.120	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000005288	aco1	99	81.285	ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.285	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.248	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	80.248	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000005288	aco1	99	77.703	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	78.806	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000005288	aco1	99	82.167	ENSPFOG00000013405	aco1	98	82.167	Poecilia_formosa
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ENSTNIG00000005288	aco1	78	89.623	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	89.623	Procavia_capensis
ENSTNIG00000005288	aco1	89	81.242	ENSPCOG00000021198	ACO1	99	81.242	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000005288	aco1	96	74.386	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	74.386	Pteropus_vampyrus
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