EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000005346 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7890 bases
Position: chr3:13522547-13530436
Accession: ZDB-GENE-040426-1569
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000008028	GTP_EFTU	PF00009.27	2.7e-33	1	1
ENSTNIP00000008028	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSTNIP00000008028	EFG_IV	PF03764.18	1.2e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000008191	-	2868	-	ENSTNIP00000008028	955 (aa)	-	H3CIF0

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000005346's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000005346's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000005346	eftud2	79	36.398	ENSTNIG00000010631	-	97	36.398

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.203	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.308	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	86.885	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.097	ENSACIG00000009096	eftud2	100	91.097	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000005346	eftud2	89	86.737	ENSAOCG00000023385	eftud2	97	86.737	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.205	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.205	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.308	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.308	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	83.470	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	83.676	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	85.963	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	86.475	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.267	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	87.474	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.000	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.000	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.379	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	88.379	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000005346	eftud2	100	86.605	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	86.885	Bos_taurus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	67.626	WBGene00001166	eftu-2	99	67.181	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.010	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	87.216	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	86.885	Canis_familiaris
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	86.885	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	86.885	Capra_hircus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	86.988	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	86.885	Cavia_aperea
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	86.885	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	86.988	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	86.988	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	86.783	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	86.988	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000005346	eftud2	86	97.238	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	93	97.238	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	86.885	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	74.642	ENSCING00000009372	-	100	74.438	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	74.466	ENSCSAVG00000004985	-	100	73.957	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.203	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	87.410	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	86.578	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	86.578	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.897	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.282	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.282	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.741	ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.741	Danio_rerio
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	86.783	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	86.680	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	71.152	FBgn0039566	CG4849	100	71.093	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000005346	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000005346	eftud2	75	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	86.546	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	86.885	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	86.783	Equus_caballus
ENSTNIG00000005346	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.821	ENSELUG00000017169	eftud2	100	88.410	Esox_lucius
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	86.783	Felis_catus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	86.680	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	86.885	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.385	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.385	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	89.333	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	89.333	Gadus_morhua
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.373	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	88.203	Gallus_gallus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.179	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.179	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.692	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.692	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	86.988	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.897	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	86.680	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	86.680	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.701	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.676	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	89.026	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	89.026	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	90	87.896	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	96	87.896	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	94	88.095	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	88.203	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.385	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.385	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000005346	eftud2	95	91.398	ENSLBEG00000005875	eftud2	99	91.505	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.000	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	88.000	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.730	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	88.308	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	100	86.401	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	100	86.605	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	86.988	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	86.988	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.203	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	87.410	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.803	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	91.795	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.000	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.000	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.299	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	86.503	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	86.680	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	86.988	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000005346	eftud2	91	74.403	ENSMOCG00000017653	-	90	74.516	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	ENSMOCG00000009039	-	100	86.680	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000005346	eftud2	89	93.075	ENSMMOG00000020811	eftud2	97	93.075	Mola_mola
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	86.988	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000005346	eftud2	89	91.549	ENSMALG00000014501	eftud2	97	91.549	Monopterus_albus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.894	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	86.997	Mus_caroli
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.894	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	86.997	Mus_musculus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.894	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	86.997	Mus_pahari
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.894	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	86.997	Mus_spretus
ENSTNIG00000005346	eftud2	97	86.076	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	86.287	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000005346	eftud2	100	86.503	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	100	86.810	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	86.578	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.897	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000005346	eftud2	97	84.444	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	84.762	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	82.992	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	83.299	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	78.689	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	78.996	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000005346	eftud2	93	74.392	ENSODEG00000003385	-	100	74.499	Octodon_degus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSODEG00000018041	-	100	86.168	Octodon_degus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.000	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.000	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	86.885	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	90.974	ENSORLG00000003109	eftud2	100	90.974	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.077	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.077	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	90.974	ENSORLG00015002611	eftud2	100	91.323	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	85.509	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	85.714	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000005346	eftud2	100	86.605	ENSOARG00000009078	EFTUD2	98	86.810	Ovis_aries
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	86.988	Pan_paniscus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	86.885	Panthera_pardus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	86.885	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	86.988	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	86.988	Papio_anubis
ENSTNIG00000005346	eftud2	93	84.523	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	84.742	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	83.881	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	83.881	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	86.783	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	86.988	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.385	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.385	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.385	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.385	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.385	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.385	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.280	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	87.487	Pongo_abelii
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	83.094	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	83.299	Procavia_capensis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	86.988	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	82.462	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	82.667	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.897	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	89.231	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	89.231	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.769	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	86.769	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	86.885	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	86.885	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000005346	eftud2	97	32.940	YKL173W	SNU114	91	33.438	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.087	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	87.293	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000005346	eftud2	94	88.095	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	88.203	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	89.538	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	89.128	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.897	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.103	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.103	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.205	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.205	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	78.996	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	79.201	Sorex_araneus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.373	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	86.680	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	100	92.016	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.016	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	86.680	Sus_scrofa
ENSTNIG00000005346	eftud2	82	86.139	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	86.262	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	94.256	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	94.256	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	81.455	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	81.660	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000005346	eftud2	90	84.258	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	84.258	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.307	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	86.515	Ursus_americanus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	86.885	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000005346	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	86.885	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000005346	eftud2	96	86.688	ENSXETG00000003394	eftud2	98	87.324	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000005346	eftud2	82	92.112	ENSXCOG00000017309	eftud2	93	92.112	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.179	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.179	Xiphophorus_maculatus