EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000005533 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2419 bases
Position: chrUn_random:79056125-79058543
Accession: ZDB-GENE-040801-225
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000008232	PRP38	PF03371.15	2e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000008398	-	936	-	ENSTNIP00000008232	311 (aa)	-	H3CJ03

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSG00000134748	PRPF38A	71	86.547	Homo_sapiens
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	94.212	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	94.212	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	71	86.547	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000005533	prpf38a	72	91.071	ENSACIG00000012292	prpf38a	73	91.071	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	94.212	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	94.212	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	94.212	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	94.212	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	94.534	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	94.534	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	79	75.200	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	81.646	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	79.048	ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	85.202	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	59.621	ENSANAG00000029204	-	70	55.947	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSANAG00000027839	PRPF38A	71	86.547	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	93.569	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	93.569	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	83.492	ENSAMXG00000029274	prpf38a	71	92.377	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	75	86.547	Bos_taurus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	63	61.929	WBGene00008380	prp-38	68	58.824	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	74	86.547	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	71	86.547	Canis_familiaris
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	71	86.547	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	71	86.547	Capra_hircus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSTSYG00000009868	-	71	86.547	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000005533	prpf38a	86	76.103	ENSTSYG00000031994	-	63	82.778	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	81.470	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	71	86.547	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	77.707	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	71	86.547	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	93	52.921	ENSCATG00000044190	-	57	55.263	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCATG00000032296	PRPF38A	71	86.547	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	71	86.547	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	79.048	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	71	85.202	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000005533	prpf38a	75	66.524	ENSCSAVG00000009580	-	71	68.493	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000005533	prpf38a	75	85.837	ENSCANG00000032608	PRPF38A	74	86.547	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCGRG00001018502	-	71	86.547	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000005533	prpf38a	85	69.962	ENSCGRG00001002557	-	74	73.094	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	71	86.547	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000005533	prpf38a	72	91.031	ENSCSEG00000001269	prpf38a	76	91.031	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	94.534	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	94.534	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	81.905	ENSDARG00000039213	prpf38a	71	90.583	Danio_rerio
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	72	86.547	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	85	74.340	ENSDORG00000023691	-	75	79.545	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000005533	prpf38a	84	95.833	ENSDORG00000023857	-	66	69.955	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000005533	prpf38a	85	74.340	ENSDORG00000025371	-	75	79.545	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000005533	prpf38a	93	55.782	FBgn0050342	Prp38	57	72.632	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000005533	prpf38a	77	80.083	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.556	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSEASG00005014427	PRPF38A	71	86.547	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSECAG00000022628	PRPF38A	71	86.547	Equus_caballus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	92.605	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	92.605	Esox_lucius
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	71	86.547	Felis_catus
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ENSTNIG00000005533	prpf38a	87	76.277	ENSFALG00000005598	-	66	82.418	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	81.150	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	72	86.547	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000005533	prpf38a	95	93.939	ENSFHEG00000014317	prpf38a	99	93.919	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	54	93.452	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	93.452	Gadus_morhua
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	79.365	ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	85.650	Gallus_gallus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	93.569	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	93.569	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000005533	prpf38a	72	92.889	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	93.610	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	54	92.353	ENSGACG00000000182	-	100	92.353	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	79.048	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	71	85.202	Gopherus_agassizii
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ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	71	86.547	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	72.843	ENSHGLG00100003928	-	71	74.888	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	71	86.547	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000005533	prpf38a	59	92.935	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	93.158	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000005533	prpf38a	90	77.352	ENSIPUG00000005757	prpf38a	71	88.839	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	71	86.547	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	93.891	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	93.891	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	93.569	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	93.569	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.635	ENSLACG00000011495	PRPF38A	71	86.547	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	89.744	ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	87.500	Lepisosteus_oculatus
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ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.000	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	71	86.547	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	94.534	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	94.534	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	93.569	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	93.569	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000005533	prpf38a	75	84.979	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	74	85.650	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000005533	prpf38a	85	80.827	ENSMAUG00000018029	-	84	82.063	Mesocricetus_auratus
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ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	93.291	ENSMMOG00000016972	prpf38a	84	90.114	Mola_mola
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	77.848	ENSMODG00000000644	PRPF38A	71	83.482	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	94.855	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	94.855	Monopterus_albus
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ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	80.511	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	72	86.547	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000005533	prpf38a	72	91.071	ENSNBRG00000004013	prpf38a	71	91.071	Neolamprologus_brichardi
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ENSTNIG00000005533	prpf38a	97	61.765	ENSNLEG00000012592	-	67	57.848	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000005533	prpf38a	100	77.143	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	71	82.511	Notamacropus_eugenii
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