EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000006921 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: utp20
Alias: im:7159098|wu:fb83c08
Full Name: UTP20 small subunit (SSU) processome component
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15305 bases
Position: chr19:6307864-6323168
Accession: ZDB-GENE-080225-38
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000009718	DRIM	PF07539.12	1.7e-162	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000009894	-	8316	-	ENSTNIP00000009718	2771 (aa)	-	H3CN87

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000006921's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000006921's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.168	ENSG00000120800	UTP20	100	53.968	Homo_sapiens
ENSTNIG00000006921	utp20	100	76.562	ENSAPOG00000002429	utp20	99	76.562	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.186	ENSAMEG00000016416	UTP20	100	54.112	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000006921	utp20	100	75.704	ENSACIG00000007987	utp20	99	75.820	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000006921	utp20	61	77.469	ENSAOCG00000015055	utp20	96	77.173	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000006921	utp20	100	76.272	ENSAPEG00000011605	utp20	99	76.307	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000006921	utp20	98	75.827	ENSATEG00000005601	utp20	99	75.544	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000006921	utp20	99	55.827	ENSAPLG00000015651	UTP20	100	55.492	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000006921	utp20	100	55.280	ENSACAG00000011671	UTP20	100	54.919	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.900	ENSANAG00000027152	UTP20	100	52.587	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000006921	utp20	95	81.720	ENSACLG00000008064	utp20	99	81.720	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000006921	utp20	100	63.649	ENSAMXG00000021039	utp20	99	63.829	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	55.082	ENSBTAG00000003239	UTP20	100	54.445	Bos_taurus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.220	ENSCJAG00000001913	UTP20	100	53.925	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.023	ENSCAFG00000006964	UTP20	100	53.994	Canis_familiaris
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.988	ENSCAFG00020024305	UTP20	100	53.994	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.963	ENSCHIG00000009221	UTP20	100	54.329	Capra_hircus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.150	ENSTSYG00000003040	UTP20	100	53.974	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000006921	utp20	99	52.065	ENSCAPG00000014920	UTP20	100	52.082	Cavia_aperea
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.670	ENSCPOG00000003129	UTP20	100	53.667	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.198	ENSCCAG00000031422	UTP20	100	53.881	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.544	ENSCATG00000035636	UTP20	100	52.114	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.300	ENSCLAG00000011569	UTP20	100	54.328	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.558	ENSCSAG00000003388	UTP20	100	54.145	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000006921	utp20	89	71.212	ENSCHOG00000003532	UTP20	92	71.212	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000006921	utp20	95	55.148	ENSCPBG00000004844	UTP20	99	54.981	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000006921	utp20	93	31.042	ENSCSAVG00000008252	-	97	30.412	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000006921	utp20	96	54.645	ENSCANG00000034768	UTP20	99	54.424	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.685	ENSCGRG00001017151	Utp20	100	53.745	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.437	ENSCGRG00000008595	Utp20	100	53.497	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000006921	utp20	98	72.847	ENSCSEG00000014760	utp20	99	72.934	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000006921	utp20	99	72.601	ENSCVAG00000001727	utp20	99	72.424	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000006921	utp20	99	63.175	ENSDARG00000099280	utp20	99	63.543	Danio_rerio
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.890	ENSDNOG00000016845	UTP20	100	53.795	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.554	ENSDORG00000014762	Utp20	99	52.763	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000006921	utp20	89	75.000	ENSETEG00000019983	UTP20	89	75.000	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.816	ENSEASG00005019981	UTP20	99	64.080	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000006921	utp20	96	59.585	ENSECAG00000006876	UTP20	99	64.080	Equus_caballus
ENSTNIG00000006921	utp20	72	62.500	ENSEEUG00000003774	UTP20	75	58.824	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	68.235	ENSELUG00000000798	utp20	99	68.116	Esox_lucius
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.429	ENSFCAG00000006150	UTP20	100	54.261	Felis_catus
ENSTNIG00000006921	utp20	94	54.368	ENSFALG00000011135	UTP20	100	53.959	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000006921	utp20	96	50.720	ENSFDAG00000007567	UTP20	98	50.512	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000006921	utp20	98	69.720	ENSFHEG00000004142	utp20	99	70.142	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000006921	utp20	99	64.220	ENSGMOG00000006762	utp20	100	64.507	Gadus_morhua
ENSTNIG00000006921	utp20	100	55.896	ENSGALG00000011643	UTP20	100	55.685	Gallus_gallus
ENSTNIG00000006921	utp20	97	72.295	ENSGAFG00000006986	utp20	99	72.340	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000006921	utp20	100	74.370	ENSGACG00000019092	utp20	100	74.405	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000006921	utp20	67	56.780	ENSGAGG00000011169	UTP20	97	56.144	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.593	ENSGGOG00000004904	UTP20	100	53.420	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000006921	utp20	100	75.463	ENSHBUG00000010613	utp20	99	75.356	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.091	ENSHGLG00000006422	UTP20	100	53.912	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.910	ENSHGLG00100001086	UTP20	100	52.731	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000006921	utp20	98	72.695	ENSHCOG00000005421	utp20	99	72.229	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000006921	utp20	100	63.791	ENSIPUG00000013717	utp20	99	63.837	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.037	ENSSTOG00000015995	UTP20	100	53.395	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.918	ENSJJAG00000019321	Utp20	100	53.165	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	70.739	ENSKMAG00000005972	utp20	99	71.068	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000006921	utp20	98	75.577	ENSLBEG00000000781	utp20	99	80.208	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000006921	utp20	80	58.076	ENSLACG00000010098	UTP20	99	57.975	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000006921	utp20	93	60.650	ENSLOCG00000015197	utp20	93	73.864	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.708	ENSLAFG00000012983	UTP20	100	53.814	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.282	ENSMFAG00000037766	UTP20	100	54.039	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.352	ENSMMUG00000012891	UTP20	100	54.109	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.902	ENSMNEG00000037418	UTP20	100	52.482	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.770	ENSMLEG00000029148	UTP20	100	52.344	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	75.371	ENSMAMG00000002063	utp20	99	75.336	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	75.550	ENSMZEG00005018123	utp20	99	75.621	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000006921	utp20	100	55.638	ENSMGAG00000011726	UTP20	100	55.320	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000006921	utp20	65	52.525	ENSMAUG00000011898	Utp20	99	52.122	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	52.128	ENSMICG00000015736	UTP20	100	52.149	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.104	ENSMOCG00000015242	Utp20	100	53.104	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000006921	utp20	100	72.275	ENSMMOG00000003360	utp20	100	72.062	Mola_mola
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.670	ENSMODG00000003141	UTP20	100	54.539	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000006921	utp20	100	75.062	ENSMALG00000002723	utp20	99	75.098	Monopterus_albus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.811	MGP_CAROLIEiJ_G0015713	Utp20	100	53.743	Mus_caroli
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.047	ENSMUSG00000004356	Utp20	100	53.900	Mus_musculus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.892	MGP_PahariEiJ_G0031372	Utp20	100	53.990	Mus_pahari
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.890	MGP_SPRETEiJ_G0016531	Utp20	90	71.429	Mus_spretus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.004	ENSMPUG00000011641	UTP20	100	53.955	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.150	ENSMLUG00000002313	UTP20	100	53.963	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.882	ENSNGAG00000013738	Utp20	100	53.833	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000006921	utp20	80	92.308	ENSNBRG00000019464	utp20	99	93.750	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.426	ENSNLEG00000006166	UTP20	100	54.452	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000006921	utp20	88	81.481	ENSMEUG00000015457	UTP20	88	81.481	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000006921	utp20	85	78.981	ENSOPRG00000010546	UTP20	85	78.981	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.898	ENSODEG00000013411	UTP20	100	53.726	Octodon_degus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	76.618	ENSONIG00000009910	utp20	100	75.805	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000006921	utp20	99	54.022	ENSOANG00000005578	UTP20	99	53.884	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.282	ENSOCUG00000010475	UTP20	100	54.100	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000006921	utp20	95	71.488	ENSORLG00000008900	utp20	99	71.488	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000006921	utp20	95	71.279	ENSORLG00020005879	utp20	99	71.279	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000006921	utp20	98	67.722	ENSORLG00015002843	utp20	99	70.947	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000006921	utp20	98	70.547	ENSOMEG00000023583	utp20	99	73.626	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.609	ENSOGAG00000015130	UTP20	100	52.856	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.894	ENSOARG00000014722	UTP20	100	54.390	Ovis_aries
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.062	ENSPPAG00000001381	UTP20	100	53.862	Pan_paniscus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.429	ENSPPRG00000001026	UTP20	100	54.190	Panthera_pardus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.391	ENSPTIG00000020972	UTP20	100	54.084	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.133	ENSPTRG00000005349	UTP20	100	53.933	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.178	ENSPANG00000020388	UTP20	100	53.968	Papio_anubis
ENSTNIG00000006921	utp20	100	63.107	ENSPKIG00000007196	utp20	99	63.536	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000006921	utp20	94	54.884	ENSPSIG00000016689	UTP20	100	54.590	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000006921	utp20	100	72.935	ENSPMGG00000004066	utp20	99	73.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.368	ENSPEMG00000024120	Utp20	100	54.623	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000006921	utp20	98	56.660	ENSPCIG00000009298	UTP20	100	54.017	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000006921	utp20	92	73.620	ENSPFOG00000003312	utp20	100	74.041	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000006921	utp20	98	70.883	ENSPLAG00000012874	utp20	99	71.101	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000006921	utp20	98	69.130	ENSPMEG00000005915	utp20	99	70.113	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000006921	utp20	98	71.408	ENSPREG00000013285	utp20	99	71.408	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000006921	utp20	89	54.110	ENSPPYG00000004871	UTP20	100	53.843	Pongo_abelii
ENSTNIG00000006921	utp20	82	69.697	ENSPCAG00000012791	UTP20	80	69.697	Procavia_capensis
ENSTNIG00000006921	utp20	96	54.133	ENSPCOG00000024948	UTP20	100	54.133	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.216	ENSPVAG00000008113	UTP20	100	53.081	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	74.876	ENSPNYG00000011561	utp20	99	74.912	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000006921	utp20	100	63.601	ENSPNAG00000006176	utp20	99	63.601	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.214	ENSRNOG00000005823	Utp20	100	53.789	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.307	ENSRBIG00000025384	UTP20	100	52.713	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.516	ENSRROG00000041254	UTP20	100	54.270	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.168	ENSSBOG00000035762	UTP20	100	53.993	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000006921	utp20	98	53.424	ENSSHAG00000002298	UTP20	78	54.483	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000006921	utp20	100	65.433	ENSSFOG00015001674	utp20	100	65.539	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000006921	utp20	98	72.740	ENSSMAG00000016460	utp20	99	74.829	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	78.197	ENSSDUG00000013730	utp20	99	77.991	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000006921	utp20	100	79.085	ENSSLDG00000012844	utp20	99	78.908	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000006921	utp20	57	72.222	ENSSARG00000002796	-	55	72.222	Sorex_araneus
ENSTNIG00000006921	utp20	99	54.088	ENSSPUG00000004513	UTP20	99	53.838	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	75.462	ENSSPAG00000014674	utp20	99	75.355	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.310	ENSSSCG00000000869	UTP20	100	54.319	Sus_scrofa
ENSTNIG00000006921	utp20	78	54.843	ENSTGUG00000009053	-	100	54.592	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000006921	utp20	99	84.632	ENSTRUG00000005849	utp20	99	84.703	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000006921	utp20	91	52.216	ENSTBEG00000011917	UTP20	90	52.314	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000006921	utp20	97	54.900	ENSTTRG00000017195	UTP20	98	55.018	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	54.128	ENSUAMG00000016363	UTP20	100	54.176	Ursus_americanus
ENSTNIG00000006921	utp20	100	53.778	ENSUMAG00000000077	UTP20	100	53.670	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000006921	utp20	89	54.902	ENSVPAG00000011620	UTP20	92	55.016	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000006921	utp20	98	56.473	ENSVVUG00000018110	UTP20	99	56.947	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000006921	utp20	98	54.168	ENSXETG00000032346	UTP20	99	54.203	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000006921	utp20	98	71.309	ENSXMAG00000006503	utp20	99	71.116	Xiphophorus_maculatus