EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000007254 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srp9
Alias: zgc:56668
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1257 bases
Position: chrUn_random:26100732-26101988
Accession: ZDB-GENE-040426-1106
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000010057	SRP9-21	PF05486.12	1e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000010237	-	381	-	ENSTNIP00000010057	86 (aa)	-	Q4SRE3

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000007254's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000007254's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSG00000143742	SRP9	100	76.744	Homo_sapiens
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSAPOG00000006089	srp9	100	93.023	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	80.233	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000007254	srp9	100	68.605	ENSACIG00000022298	srp9	100	68.605	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSAOCG00000014643	srp9	100	93.023	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSAPEG00000004398	srp9	100	93.023	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSATEG00000014339	srp9	100	94.186	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000007254	srp9	81	84.286	ENSAPLG00000015368	SRP9	100	84.286	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000007254	srp9	100	82.558	ENSACAG00000005788	SRP9	100	82.558	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSANAG00000022626	SRP9	100	79.070	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSACLG00000018392	srp9	100	94.186	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSAMXG00000010366	srp9	100	94.186	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	80.233	Bos_taurus
ENSTNIG00000007254	srp9	88	50.000	WBGene00013984	ZK512.4	100	50.000	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	79.070	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	80.233	Canis_familiaris
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	80.233	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	80.233	Capra_hircus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	75.581	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	75.581	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	79.070	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	77.907	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSCATG00000041813	SRP9	100	76.744	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSCLAG00000001368	-	100	77.907	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000007254	srp9	99	69.412	ENSCLAG00000017687	-	99	69.412	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000007254	srp9	100	54.651	ENSCHOG00000012912	-	100	54.651	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSCHOG00000006096	-	100	80.233	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000007254	srp9	58	78.000	ENSCHOG00000008435	-	100	78.000	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000007254	srp9	100	82.558	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	82.558	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSCANG00000030765	-	100	76.744	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	75.581	ENSCANG00000012015	-	100	75.581	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	77.907	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000007254	srp9	74	75.000	ENSCGRG00000009651	Srp9	84	75.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000007254	srp9	100	90.698	ENSCSEG00000018438	srp9	100	90.698	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSCVAG00000001083	srp9	100	93.023	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	89.535	ENSDARG00000042851	srp9	100	89.535	Danio_rerio
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSDNOG00000013412	-	100	80.233	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000007254	srp9	90	41.558	FBgn0035827	Srp9	100	41.558	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000007254	srp9	100	70.930	ENSETEG00000012291	SRP9	100	70.930	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000007254	srp9	98	70.238	ENSEBUG00000009080	srp9	100	70.238	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSECAG00000033839	SRP9	100	80.233	Equus_caballus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	73.256	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	73.256	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	ENSELUG00000001506	srp9	100	91.860	Esox_lucius
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	80.233	Felis_catus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSFALG00000011689	SRP9	100	80.233	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	81.395	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	81.395	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSFHEG00000011666	srp9	100	93.023	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	89.535	ENSGMOG00000003565	srp9	100	89.535	Gadus_morhua
ENSTNIG00000007254	srp9	100	81.395	ENSGALG00000026009	SRP9	100	81.395	Gallus_gallus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	ENSGAFG00000009506	srp9	100	91.860	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	90.698	ENSGACG00000004110	srp9	100	90.698	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	82.558	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	82.558	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	76.744	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSHBUG00000021430	srp9	100	94.186	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000007254	srp9	93	80.000	ENSHGLG00000020925	-	100	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	80.233	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000007254	srp9	98	71.429	ENSHGLG00000006535	-	99	71.429	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000007254	srp9	100	73.256	ENSHGLG00000020168	-	100	73.256	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000007254	srp9	81	78.571	ENSHGLG00000019830	-	100	78.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000007254	srp9	93	81.250	ENSHGLG00100016521	-	98	81.250	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSHGLG00100019986	-	100	80.233	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000007254	srp9	98	71.429	ENSHGLG00100009760	-	99	71.429	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000007254	srp9	100	73.256	ENSHGLG00100020800	-	100	73.256	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000007254	srp9	100	69.767	ENSHGLG00100011806	-	100	69.767	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000007254	srp9	100	67.442	ENSHCOG00000006978	srp9	100	67.442	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	ENSIPUG00000020674	srp9	100	91.860	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	80.233	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	82.558	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	82.558	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	ENSKMAG00000014117	srp9	100	91.860	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSLBEG00000020620	srp9	100	93.023	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000007254	srp9	100	82.558	ENSLACG00000007546	SRP9	100	82.558	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000007254	srp9	100	89.535	ENSLOCG00000015903	srp9	100	89.535	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	76.744	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	76.744	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	76.744	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	76.744	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSMAMG00000004755	srp9	100	94.186	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSMZEG00005015517	srp9	100	94.186	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000007254	srp9	100	81.395	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	81.395	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	77.907	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSMICG00000030104	-	100	77.907	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	77.907	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.954	ENSMMOG00000014838	srp9	100	91.954	Mola_mola
ENSTNIG00000007254	srp9	100	81.395	ENSMODG00000025664	SRP9	100	81.395	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	ENSMALG00000004262	srp9	100	91.860	Monopterus_albus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	77.907	Mus_caroli
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	77.907	Mus_musculus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	75.581	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	75.581	Mus_pahari
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	77.907	Mus_spretus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	79.070	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	79.070	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSNBRG00000010915	srp9	100	94.186	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	76.744	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	80.233	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000007254	srp9	100	68.182	ENSODEG00000010125	-	76	68.182	Octodon_degus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	73.256	ENSODEG00000015075	-	100	73.256	Octodon_degus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSONIG00000011409	srp9	100	93.023	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	81.395	ENSOANG00000001472	SRP9	100	81.395	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	80.233	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	89.535	ENSORLG00020003090	srp9	100	89.535	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000007254	srp9	100	89.535	ENSORLG00015001636	srp9	89	89.535	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000007254	srp9	100	90.698	ENSOMEG00000020548	srp9	100	90.698	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000007254	srp9	100	75.581	ENSOGAG00000001752	-	100	75.581	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000007254	srp9	100	75.581	ENSOGAG00000031299	-	100	75.581	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	76.744	Pan_paniscus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	80.233	Panthera_pardus
ENSTNIG00000007254	srp9	71	80.328	ENSPTIG00000014838	SRP9	71	80.328	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	76.744	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSPANG00000030164	SRP9	100	76.744	Papio_anubis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	88.372	ENSPKIG00000015012	srp9	100	88.372	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000007254	srp9	100	82.558	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	82.558	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	65.116	ENSPMGG00000002318	srp9	100	65.116	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	79.070	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000007254	srp9	100	81.395	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	81.395	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	ENSPREG00000020242	srp9	100	91.860	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000007254	srp9	97	77.108	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	77.108	Pongo_abelii
ENSTNIG00000007254	srp9	100	77.907	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	77.907	Procavia_capensis
ENSTNIG00000007254	srp9	71	78.689	ENSPCOG00000021743	-	98	78.689	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000007254	srp9	100	64.045	ENSPCOG00000012531	-	100	64.045	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	80.233	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSPNYG00000010536	srp9	100	94.186	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSPNAG00000008264	srp9	100	94.186	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	80.233	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	76.744	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000007254	srp9	100	76.744	ENSRROG00000028703	SRP9	100	76.744	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	81.395	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	81.395	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000007254	srp9	100	88.372	ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	91.860	ENSSMAG00000001318	srp9	100	91.860	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	93.023	ENSSDUG00000008772	srp9	100	93.023	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000007254	srp9	87	93.333	ENSSLDG00000019141	srp9	95	93.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000007254	srp9	100	63.953	ENSSPUG00000014436	SRP9	100	63.953	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	94.186	ENSSPAG00000017244	srp9	100	94.186	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSSSCG00000031664	-	100	80.233	Sus_scrofa
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSTGUG00000004123	SRP9	100	80.233	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000007254	srp9	100	97.674	ENSTRUG00000024107	srp9	100	97.674	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	79.070	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000007254	srp9	71	80.328	ENSTTRG00000010081	SRP9	98	80.328	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	80.233	Ursus_americanus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	80.233	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000007254	srp9	71	80.328	ENSVPAG00000001698	SRP9	98	80.328	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000007254	srp9	100	80.233	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	80.233	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000007254	srp9	100	90.698	ENSXCOG00000000662	srp9	100	90.698	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000007254	srp9	100	90.698	ENSXMAG00000029514	srp9	100	90.698	Xiphophorus_maculatus