EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000007483 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9199 bases
Position: chr4:6003856-6013054
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000010292	IBN_N	PF03810.19	2.7e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000010473	-	1788	-	ENSTNIP00000010292	595 (aa)	-	H3CPV8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	75.926	ENSTNIG00000003295	TNPO2	66	75.717
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	84.317	ENSTNIG00000014071	TNPO2	68	84.317

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSG00000083312	TNPO1	87	81.148	Homo_sapiens
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	92.208	ENSAPOG00000003453	tnpo1	69	92.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	86.538	ENSAMEG00000007147	TNPO1	68	87.660	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.558	ENSACIG00000003711	tnpo1	79	91.558	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	92.370	ENSAOCG00000008154	tnpo1	69	92.370	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	92.370	ENSAPEG00000001112	tnpo1	69	92.370	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.721	ENSATEG00000010408	tnpo1	69	91.721	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	98	85.430	ENSAPLG00000009619	-	65	87.671	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.286	ENSACAG00000009599	TNPO1	69	89.286	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSANAG00000022453	-	68	88.636	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	82.667	ENSANAG00000025351	-	68	82.667	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	57.661	ENSANAG00000027118	-	68	57.464	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.448	ENSACLG00000027223	tnpo1	69	89.448	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.806	ENSAMXG00000009842	tnpo1	69	89.806	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSBTAG00000007979	TNPO1	71	88.799	Bos_taurus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSCJAG00000016409	TNPO1	68	88.799	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	89.194	ENSCAFG00000008081	TNPO1	68	89.194	Canis_familiaris
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	85.390	ENSCAFG00020017397	TNPO1	82	86.087	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSCHIG00000023462	TNPO1	71	88.799	Capra_hircus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	84.918	ENSTSYG00000001871	TNPO1	65	87.952	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSCCAG00000026472	TNPO1	69	88.636	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSCATG00000043792	TNPO1	78	88.799	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSCLAG00000016191	TNPO1	69	88.636	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSCSAG00000015616	TNPO1	68	88.799	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	78.084	ENSCHOG00000001746	TNPO1	73	78.084	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.448	ENSCPBG00000000260	TNPO1	65	89.448	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000007483	tnpo1	98	73.597	ENSCSAVG00000010981	-	88	70.083	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSCANG00000004353	TNPO1	68	88.799	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	68	88.636	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	89.329	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	67	89.329	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	90.422	ENSCSEG00000012674	tnpo1	69	90.422	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.396	ENSCVAG00000001010	tnpo1	69	91.396	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	90.276	ENSDARG00000035390	tnpo1	69	90.276	Danio_rerio
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.368	ENSDNOG00000006647	TNPO1	72	88.368	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	90	89.209	ENSDORG00000006476	Tnpo1	66	89.189	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	59.235	FBgn0035693	CG8219	67	59.235	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000007483	tnpo1	81	60.792	ENSETEG00000017805	TNPO1	58	60.792	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000007483	tnpo1	92	82.447	ENSEBUG00000001895	tnpo1	67	82.447	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSEASG00005018055	TNPO1	69	88.799	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSECAG00000024424	TNPO1	71	88.799	Equus_caballus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	79.938	ENSELUG00000002821	tnpo1	69	79.938	Esox_lucius
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSFCAG00000013181	TNPO1	69	88.799	Felis_catus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.448	ENSFALG00000010292	TNPO1	69	89.448	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSFDAG00000013345	TNPO1	68	88.636	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.410	ENSFHEG00000019234	tnpo1	69	91.410	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.691	ENSGMOG00000000347	tnpo1	68	88.691	Gadus_morhua
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.474	ENSGALG00000015014	TNPO1	71	88.474	Gallus_gallus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	90.777	ENSGAFG00000000943	tnpo1	69	90.777	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.396	ENSGACG00000015841	tnpo1	68	91.396	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.610	ENSGAGG00000013419	TNPO1	69	89.610	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	74.959	ENSGGOG00000022535	-	68	74.959	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSGGOG00000026800	TNPO1	69	88.799	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.558	ENSHBUG00000008068	tnpo1	69	91.558	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSHGLG00000000970	-	68	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	89.329	ENSHGLG00100017090	-	67	89.329	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	70.179	ENSHGLG00100000963	-	65	68.761	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	66	88.799	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.234	ENSKMAG00000018195	tnpo1	69	91.234	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.572	ENSLBEG00000009521	tnpo1	73	91.572	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	88.014	ENSLACG00000012199	TNPO1	68	88.014	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	90.097	ENSLOCG00000011092	tnpo1	67	90.097	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	90.893	ENSLAFG00000011796	TNPO1	67	90.893	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSMFAG00000003636	TNPO1	68	88.799	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	80.328	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSMNEG00000044581	TNPO1	68	88.799	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSMLEG00000030740	TNPO1	68	88.799	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.721	ENSMAMG00000001357	tnpo1	69	91.721	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.396	ENSMZEG00005004913	tnpo1	69	91.396	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	90.110	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	83.442	ENSMICG00000008468	TNPO1	67	83.442	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	68	88.636	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.586	ENSMMOG00000005551	tnpo1	79	91.586	Mola_mola
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	93.514	ENSMODG00000001721	TNPO1	55	93.514	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	90.097	ENSMALG00000009782	tnpo1	69	90.097	Monopterus_albus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	90.110	Mus_caroli
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	90.110	Mus_musculus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.636	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	90.110	Mus_pahari
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.474	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	90.110	Mus_spretus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.961	ENSMPUG00000014387	TNPO1	68	88.961	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	88.718	ENSMLUG00000016317	TNPO1	68	88.718	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	68	88.799	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.721	ENSNBRG00000009998	tnpo1	79	91.721	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSNLEG00000004572	TNPO1	69	88.799	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000007483	tnpo1	89	85.804	ENSOPRG00000012390	TNPO1	58	85.804	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.474	ENSODEG00000001771	TNPO1	68	88.474	Octodon_degus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.558	ENSONIG00000011151	tnpo1	68	91.558	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	90.189	ENSOANG00000015785	TNPO1	70	90.189	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	83.684	ENSOCUG00000013318	TNPO1	67	83.684	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	91.191	ENSORLG00000003182	tnpo1	79	91.191	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	91.191	ENSORLG00020011559	tnpo1	69	91.191	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	91.191	ENSORLG00015019113	tnpo1	69	91.191	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	90.538	ENSOMEG00000014567	tnpo1	69	90.538	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSOGAG00000000808	TNPO1	68	88.799	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSOARG00000005038	TNPO1	58	88.799	Ovis_aries
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSPPAG00000042518	TNPO1	68	88.799	Pan_paniscus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSPPRG00000022336	TNPO1	69	88.799	Panthera_pardus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSPTIG00000018839	TNPO1	69	88.799	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSPTRG00000016972	TNPO1	68	88.799	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000007483	tnpo1	98	79.077	ENSPTRG00000047731	-	74	79.077	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.799	ENSPANG00000006074	TNPO1	71	88.799	Papio_anubis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	84.740	ENSPKIG00000019795	tnpo1	68	84.740	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.773	ENSPSIG00000014366	TNPO1	68	89.773	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	89.739	ENSPMGG00000017014	tnpo1	69	89.739	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	89.329	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	67	89.329	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	90.097	ENSPCIG00000026080	TNPO1	71	90.097	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.438	ENSPFOG00000011447	tnpo1	69	91.438	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.438	ENSPLAG00000018696	tnpo1	69	91.438	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.721	ENSPMEG00000024121	tnpo1	69	91.721	Poecilia_mexicana
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