EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000007725 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1484 bases
Position: chr16:1843131-1844614
Accession: ZDB-GENE-040718-311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000010542	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000010723	-	783	-	ENSTNIP00000010542	261 (aa)	-	H3CQK8

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000007725's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000007725's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000007725	srprb	56	31.034	ENSTNIG00000014595	arf3b	75	31.034
ENSTNIG00000007725	srprb	56	31.034	ENSTNIG00000015063	-	75	31.034
ENSTNIG00000007725	srprb	50	31.298	ENSTNIG00000016097	sar1b	63	31.298
ENSTNIG00000007725	srprb	50	32.061	ENSTNIG00000002029	arf2b	69	32.061

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000007725	srprb	99	82.759	ENSAPOG00000021219	srprb	94	82.759	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.061	ENSACIG00000014621	srprb	98	82.061	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000007725	srprb	99	82.375	ENSAOCG00000017265	srprb	94	82.375	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000007725	srprb	99	82.375	ENSAPEG00000024541	srprb	83	82.375	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.298	ENSATEG00000014016	srprb	95	81.298	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.890	ENSACLG00000016748	srprb	95	82.890	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000007725	srprb	100	65.649	ENSAMXG00000044118	srprb	98	65.649	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	80.153	ENSCSEG00000017194	srprb	95	80.153	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.061	ENSCVAG00000004221	srprb	98	82.061	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	67.176	ENSDARG00000030949	srprb	98	67.176	Danio_rerio
ENSTNIG00000007725	srprb	100	74.254	ENSELUG00000009740	srprb	99	74.254	Esox_lucius
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.824	ENSFHEG00000006004	srprb	98	82.824	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000007725	srprb	95	81.200	ENSGMOG00000002081	srprb	96	78.626	Gadus_morhua
ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.298	ENSGAFG00000012593	srprb	99	81.298	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.824	ENSGACG00000009891	srprb	97	82.824	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.890	ENSHBUG00000002145	srprb	95	82.890	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000007725	srprb	98	77.099	ENSHCOG00000007732	srprb	98	77.099	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000007725	srprb	97	63.386	ENSIPUG00000004177	srprb	95	63.386	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	80.916	ENSKMAG00000020736	srprb	98	80.916	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.298	ENSLBEG00000021483	srprb	95	81.298	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000007725	srprb	98	66.926	ENSLOCG00000009740	srprb	86	67.315	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000007725	srprb	99	84.291	ENSMAMG00000011876	srprb	95	84.291	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000007725	srprb	98	82.879	ENSMZEG00005016621	srprb	99	82.879	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.609	ENSMMOG00000012550	srprb	97	81.609	Mola_mola
ENSTNIG00000007725	srprb	99	81.609	ENSMALG00000012595	srprb	95	81.609	Monopterus_albus
ENSTNIG00000007725	srprb	75	87.179	ENSNBRG00000004699	srprb	91	81.221	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.824	ENSONIG00000003788	srprb	78	82.824	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000007725	srprb	99	80.695	ENSORLG00000006430	srprb	95	80.695	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000007725	srprb	99	80.309	ENSORLG00020003413	srprb	94	80.309	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000007725	srprb	99	80.309	ENSORLG00015000166	srprb	94	80.309	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000007725	srprb	99	81.467	ENSOMEG00000012735	srprb	94	81.467	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000007725	srprb	100	65.399	ENSPKIG00000013147	srprb	98	65.399	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000007725	srprb	100	75.573	ENSPMGG00000014061	srprb	96	74.809	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.679	ENSPFOG00000011347	srprb	95	81.679	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000007725	srprb	98	82.812	ENSPLAG00000001156	srprb	99	82.812	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000007725	srprb	98	82.031	ENSPMEG00000012169	srprb	99	82.031	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000007725	srprb	98	81.641	ENSPREG00000001449	srprb	99	81.641	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000007725	srprb	100	82.890	ENSPNYG00000005911	srprb	95	82.890	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000007725	srprb	100	64.885	ENSPNAG00000009983	srprb	98	64.885	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000007725	srprb	95	69.323	ENSSFOG00015019355	srprb	94	69.323	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000007725	srprb	99	82.759	ENSSMAG00000013202	srprb	95	82.759	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.298	ENSSDUG00000018746	srprb	89	81.298	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.679	ENSSLDG00000020560	srprb	95	81.679	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000007725	srprb	99	81.609	ENSSPAG00000008898	srprb	94	81.609	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000007725	srprb	100	85.878	ENSTRUG00000022463	srprb	95	85.878	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000007725	srprb	98	83.594	ENSXCOG00000012585	srprb	99	83.594	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000007725	srprb	98	83.203	ENSXMAG00000028725	srprb	99	83.203	Xiphophorus_maculatus