EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSTNIG00000008106 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
U2AF2
Alias
wu:fb73g02|zgc:77804
Full Name
U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2
Gene Type
protein_coding
Species
Tetraodon_nigroviridis
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
5518 bases
Position
chr8:8440703-8446220
Accession
23156
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSTNIP00000010931RRM_1PF00076.229.9e-3513
ENSTNIP00000010931RRM_1PF00076.229.9e-3523
ENSTNIP00000010931RRM_1PF00076.229.9e-3533
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSTNIT00000011113U2AF2-2011410-ENSTNIP00000010931469 (aa)-H3CRP7
Gene Model
Click here to download ENSTNIG00000008106's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000008106's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSTNIG00000008106U2AF26137.255ENSTNIG00000013675puf60b5535.294
ENSTNIG00000008106U2AF28479.747ENSTNIG00000011257-10073.348
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSG00000063244U2AF29996.471Homo_sapiens
ENSTNIG00000008106U2AF26594.118ENSAPOG00000023155u2af2a10094.118Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSAPOG00000002208-10074.573Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000008106U2AF27593.162ENSAMEG00000003864U2AF210087.379Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000008106U2AF29672.516ENSACIG00000014173-9076.960Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000008106U2AF29496.825ENSACIG00000005749u2af2a10096.825Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSAOCG00000003595-10074.573Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000008106U2AF29997.021ENSAOCG00000015571u2af2a10097.021Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000008106U2AF29874.672ENSAPEG00000020062-8978.177Amphiprion_percula
ENSTNIG00000008106U2AF28399.486ENSAPEG00000009376u2af2a9596.852Amphiprion_percula
ENSTNIG00000008106U2AF29675.717ENSATEG00000020577-9079.126Anabas_testudineus
ENSTNIG00000008106U2AF210097.452ENSATEG00000022332u2af2a10097.452Anabas_testudineus
ENSTNIG00000008106U2AF210089.619ENSACAG00000015489U2AF210089.619Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000008106U2AF210085.175ENSANAG00000028042U2AF210091.071Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000008106U2AF210097.028ENSACLG00000022181u2af2a10097.028Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSACLG00000020793-10074.573Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000008106U2AF29989.126ENSAMXG00000039454u2af2b9989.979Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.333ENSAMXG00000033347u2af2a10090.021Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000008106U2AF210089.552ENSBTAG00000002830U2AF210089.552Bos_taurus
ENSTNIG00000008106U2AF28459.747WBGene00006697uaf-110054.730Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSCJAG00000017128U2AF210088.445Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSCAFG00000002551U2AF210088.983Canis_familiaris
ENSTNIG00000008106U2AF28593.564ENSCAFG00020015445U2AF29789.201Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000008106U2AF28478.607ENSCHIG00000023595U2AF28778.607Capra_hircus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSTSYG00000007432U2AF29989.693Carlito_syrichta
ENSTNIG00000008106U2AF28493.970ENSCAPG00000008466U2AF210088.646Cavia_aperea
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSCPOG00000001582U2AF210088.445Cavia_porcellus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSCCAG00000023336U2AF210088.445Cebus_capucinus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSCATG00000004637U2AF210088.983Cercocebus_atys
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSCLAG00000000596U2AF210088.983Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSCSAG00000001722U2AF210088.983Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000008106U2AF28392.443ENSCPBG00000004485U2AF210094.463Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000008106U2AF28370.000ENSCING00000003455-8468.127Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000008106U2AF28369.330ENSCSAVG00000006813-9165.105Ciona_savignyi
ENSTNIG00000008106U2AF210082.627ENSCANG00000043845-10083.475Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000008106U2AF29188.345ENSCANG00000031002-9688.345Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000008106U2AF29980.042ENSCGRG00001007486-9980.467Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000008106U2AF210089.765ENSCGRG00001003185-10089.765Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000008106U2AF29980.042ENSCGRG00000018587-9980.467Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000008106U2AF29971.915ENSCSEG00000020504-8877.919Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000008106U2AF29798.089ENSCSEG00000018709u2af2a9598.089Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000008106U2AF210096.802ENSCVAG00000001259u2af2a10096.802Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSCVAG00000023307-10074.573Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000008106U2AF210089.474ENSDARG00000012505u2af2a10090.546Danio_rerio
ENSTNIG00000008106U2AF210089.099ENSDARG00000011740u2af2b10089.308Danio_rerio
ENSTNIG00000008106U2AF29188.345ENSDNOG00000047039U2AF29688.345Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSDORG00000003250U2af210088.445Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000008106U2AF28650.348FBgn0034834LS28553.401Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000008106U2AF29266.438FBgn0005411U2af5010071.429Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000008106U2AF29172.131ENSEBUG00000010917U2AF210067.377Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000008106U2AF28162.895ENSEBUG00000001732U2AF28762.785Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000008106U2AF28493.734ENSEASG00005020708U2AF29089.278Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000008106U2AF210089.765ENSECAG00000010110U2AF210089.765Equus_caballus
ENSTNIG00000008106U2AF29972.292ENSELUG00000018459-10072.436Esox_lucius
ENSTNIG00000008106U2AF210093.737ENSELUG00000015850u2af2a10093.946Esox_lucius
ENSTNIG00000008106U2AF210086.837ENSELUG00000022291u2af2b10084.713Esox_lucius
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSFCAG00000011504U2AF210088.445Felis_catus
ENSTNIG00000008106U2AF28493.970ENSFDAG00000011264U2AF29887.794Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000008106U2AF210096.802ENSFHEG00000016025u2af2a10096.802Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000008106U2AF210095.137ENSGMOG00000004535u2af2a10095.137Gadus_morhua
ENSTNIG00000008106U2AF29889.130ENSGALG00000052748U2AF26589.371Gallus_gallus
ENSTNIG00000008106U2AF29973.932ENSGAFG00000005628-10075.641Gambusia_affinis
ENSTNIG00000008106U2AF210096.802ENSGAFG00000013626u2af2a8896.802Gambusia_affinis
ENSTNIG00000008106U2AF29971.670ENSGACG00000014500-10073.053Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000008106U2AF210096.383ENSGACG00000010632U2AF210096.383Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000008106U2AF26594.463ENSGAGG00000011849U2AF210094.463Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000008106U2AF25582.879ENSGGOG00000036399-9682.879Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSHBUG00000017424-10074.573Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000008106U2AF210097.028ENSHBUG00000013935u2af2a10097.028Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSHGLG00000005889U2AF210088.445Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000008106U2AF28493.970ENSHGLG00100004757U2AF210088.646Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000008106U2AF210093.515ENSHCOG00000019367u2af2a10094.142Hippocampus_comes
ENSTNIG00000008106U2AF210087.949ENSIPUG00000007717u2af2a10088.819Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000008106U2AF29972.436ENSIPUG00000009844-10071.154Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000008106U2AF29988.632ENSIPUG00000009077u2af29989.684Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSSTOG00000019595U2AF210088.445Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSJJAG00000017705U2af210088.445Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000008106U2AF210096.391ENSKMAG00000005960u2af2a10096.391Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000008106U2AF210097.240ENSLBEG00000016162u2af2a10097.240Labrus_bergylta
ENSTNIG00000008106U2AF29773.922ENSLBEG00000005001-9076.722Labrus_bergylta
ENSTNIG00000008106U2AF27895.095ENSLACG00000001648U2AF210095.095Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000008106U2AF25996.377ENSLOCG00000008050u2af2b9389.286Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000008106U2AF29972.973ENSLOCG00000010843-10076.383Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000008106U2AF210077.083ENSLAFG00000028496-10077.083Loxodonta_africana
ENSTNIG00000008106U2AF210089.831ENSLAFG00000018056-10089.407Loxodonta_africana
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSMFAG00000038383U2AF210088.445Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000008106U2AF210088.235ENSMMUG00000004810U2AF210088.235Macaca_mulatta
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSMNEG00000042096U2AF210088.983Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000008106U2AF28494.670ENSMLEG00000032219U2AF29087.905Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000008106U2AF29973.718ENSMAMG00000020158-10073.718Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000008106U2AF210095.178ENSMAMG00000019817u2af2a10095.178Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000008106U2AF210097.028ENSMZEG00005016563u2af2a10097.028Maylandia_zebra
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSMZEG00005023318-10074.573Maylandia_zebra
ENSTNIG00000008106U2AF28493.970ENSMAUG00000008180U2af29888.671Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSMICG00000027681U2AF210088.983Microcebus_murinus
ENSTNIG00000008106U2AF210079.916ENSMOCG00000007227-10079.368Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSMOCG00000013214-10088.445Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000008106U2AF26591.531ENSMOCG00000001018-10091.531Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000008106U2AF29597.072ENSMMOG00000016600u2af2a10097.072Mola_mola
ENSTNIG00000008106U2AF29967.842ENSMMOG00000000531-10067.635Mola_mola
ENSTNIG00000008106U2AF210095.966ENSMALG00000009985u2af2a10095.966Monopterus_albus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983MGP_CAROLIEiJ_G0029150U2af210088.983Mus_caroli
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSMUSG00000030435U2af210094.463Mus_musculus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983MGP_PahariEiJ_G0021017U2af210088.983Mus_pahari
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983MGP_SPRETEiJ_G0030203U2af210088.983Mus_spretus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSMPUG00000007135U2AF210088.983Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000008106U2AF25187.967ENSMLUG00000011051-10087.967Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.655ENSNGAG00000020369U2af210088.655Nannospalax_galili
ENSTNIG00000008106U2AF29674.026ENSNBRG00000011100-9077.197Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000008106U2AF210097.028ENSNBRG00000002568u2af2a10097.028Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000008106U2AF210074.105ENSNLEG00000010562U2AF210094.463Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000008106U2AF28479.847ENSMEUG00000002346U2AF210074.187Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000008106U2AF210083.403ENSODEG00000012729-10083.403Octodon_degus
ENSTNIG00000008106U2AF29963.656ENSODEG00000009254-9965.161Octodon_degus
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSONIG00000009682-10074.573Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000008106U2AF210096.195ENSONIG00000012793u2af2a10096.195Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000008106U2AF210093.220ENSORLG00000011545u2af2a10095.111Oryzias_latipes
ENSTNIG00000008106U2AF210093.220ENSORLG00020006941u2af2a10095.111Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000008106U2AF210093.220ENSORLG00015012843u2af2a10093.644Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000008106U2AF210095.754ENSOMEG00000011386u2af2a10095.973Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000008106U2AF29655.240ENSOGAG00000034729-8062.097Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSOGAG00000007206-10088.445Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000008106U2AF210078.882ENSOARG00000001091U2AF210078.838Ovis_aries
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSPPAG00000039782U2AF210088.445Pan_paniscus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSPPRG00000013843U2AF210088.445Panthera_pardus
ENSTNIG00000008106U2AF29977.707ENSPTIG00000005489U2AF29780.401Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSPTRG00000011523U2AF210094.463Pan_troglodytes
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSPANG00000008459U2AF210088.983Papio_anubis
ENSTNIG00000008106U2AF29973.237ENSPKIG00000014878-10073.932Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000008106U2AF210090.890ENSPKIG00000024346u2af2b9393.961Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000008106U2AF28571.845ENSPSIG00000008014U2AF210070.488Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000008106U2AF29688.937ENSPMGG00000022980u2af2a10088.937Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSPEMG00000007378U2af210094.463Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000008106U2AF28176.823ENSPMAG00000004097u2af2a8777.444Petromyzon_marinus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.235ENSPCIG00000018013U2AF210088.235Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000008106U2AF29973.673ENSPFOG00000006433-10075.641Poecilia_formosa
ENSTNIG00000008106U2AF29996.596ENSPFOG00000010799u2af2a10096.596Poecilia_formosa
ENSTNIG00000008106U2AF210096.802ENSPLAG00000014365u2af2a10096.802Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000008106U2AF28481.013ENSPLAG00000003275-9178.641Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000008106U2AF210096.802ENSPMEG00000002969u2af2a10096.802Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000008106U2AF28480.759ENSPMEG00000003734-9178.398Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000008106U2AF29974.145ENSPREG00000013036-10074.324Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000008106U2AF210096.603ENSPREG00000008739u2af2a10096.674Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000008106U2AF25892.336ENSPPYG00000010429-7891.697Pongo_abelii
ENSTNIG00000008106U2AF28479.592ENSPCAG00000003709-9679.592Procavia_capensis
ENSTNIG00000008106U2AF210072.117ENSPCAG00000014399-10072.117Procavia_capensis
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSPCOG00000025870U2AF210088.445Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000008106U2AF210088.025ENSPVAG00000004540U2AF210088.025Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000008106U2AF210097.028ENSPNYG00000001438u2af2a10097.028Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000008106U2AF29974.573ENSPNYG00000011605-10074.573Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000008106U2AF29974.627ENSPNAG00000007182-10074.359Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000008106U2AF210090.063ENSPNAG00000017620u2af2a10091.772Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000008106U2AF29989.552ENSPNAG00000027289u2af2b9990.618Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSRNOG00000015914U2af210088.983Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000008106U2AF210088.235ENSRBIG00000041018U2AF210088.235Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000008106U2AF28787.923ENSRROG00000031103-10087.923Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000008106U2AF210083.898ENSRROG00000031238-10083.898Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000008106U2AF210088.983ENSSBOG00000023891U2AF210088.983Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000008106U2AF26467.374ENSSHAG00000001167U2AF28771.353Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000008106U2AF28496.725ENSSFOG00015019182u2af2b8996.725Scleropages_formosus
ENSTNIG00000008106U2AF29975.319ENSSFOG00015003884-9481.122Scleropages_formosus
ENSTNIG00000008106U2AF210095.957ENSSMAG00000012582u2af2a10095.957Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000008106U2AF29973.932ENSSMAG00000013779-10073.932Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000008106U2AF29673.707ENSSDUG00000021434-8676.832Seriola_dumerili
ENSTNIG00000008106U2AF29996.809ENSSDUG00000009457u2af2a10096.809Seriola_dumerili
ENSTNIG00000008106U2AF29673.707ENSSLDG00000016151-9076.832Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000008106U2AF210096.815ENSSLDG00000022742u2af2a10096.815Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000008106U2AF210088.260ENSSPUG00000010229U2AF210088.260Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000008106U2AF210097.028ENSSPAG00000022519u2af2a10097.028Stegastes_partitus
ENSTNIG00000008106U2AF29974.786ENSSPAG00000005241-10074.786Stegastes_partitus
ENSTNIG00000008106U2AF210089.765ENSSSCG00000034815U2AF210089.765Sus_scrofa
ENSTNIG00000008106U2AF29795.143ENSTRUG00000005514u2af2a9995.143Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000008106U2AF27589.296ENSTBEG00000009104U2AF29689.296Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000008106U2AF210088.445ENSTTRG00000000987U2AF210088.445Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000008106U2AF28493.500ENSUAMG00000019883U2AF28793.970Ursus_americanus
ENSTNIG00000008106U2AF28493.500ENSUMAG00000024586U2AF210094.463Ursus_maritimus
ENSTNIG00000008106U2AF28494.670ENSVVUG00000006956U2AF26986.864Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000008106U2AF210087.238ENSXETG00000019128u2af210087.238Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000008106U2AF29696.667ENSXCOG00000019406u2af2a10096.667Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000008106U2AF29973.932ENSXMAG00000000768-9673.932Xiphophorus_maculatus
ENSTNIG00000008106U2AF210096.802ENSXMAG00000011979u2af2a10096.802Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us