EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000010316 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4399 bases
Position: chrUn_random:18946187-18950585
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000013220	SRP54	PF00448.22	4.1e-48	1	1
ENSTNIP00000013220	SRP54_N	PF02881.19	2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000013412	-	1902	-	ENSTNIP00000013220	633 (aa)	-	H3CY85

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000010316's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000010316's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSG00000182934	SRPRA	100	64.188	Homo_sapiens
ENSTNIG00000010316	srpra	100	82.202	ENSAPOG00000017588	srpra	100	82.202	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	65.653	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.074	ENSACIG00000021588	srpra	100	77.376	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	82.202	ENSAOCG00000018884	srpra	100	82.202	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000010316	srpra	100	82.202	ENSAPEG00000022286	srpra	100	74.885	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.861	ENSATEG00000023578	srpra	95	87.842	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000010316	srpra	94	67.476	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	68.910	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000010316	srpra	100	67.319	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	67.319	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	64.188	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.431	ENSACLG00000000518	srpra	100	78.431	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000010316	srpra	100	68.606	ENSAMXG00000009975	srpra	100	67.737	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.145	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	66.616	Bos_taurus
ENSTNIG00000010316	srpra	99	46.596	WBGene00009521	F38A1.8	99	46.747	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	64.188	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	63.567	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	63.872	Canis_familiaris
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.244	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	65.549	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.364	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	66.313	Capra_hircus
ENSTNIG00000010316	srpra	79	77.904	ENSTSYG00000005187	SRPRA	91	81.905	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000010316	srpra	95	62.360	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	88.722	Cavia_aperea
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.706	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	88.722	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.250	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	65.502	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.706	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	64.492	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	64.340	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	64.340	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000010316	srpra	53	86.702	ENSCHOG00000010015	-	71	86.702	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.413	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	66.968	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000010316	srpra	99	54.091	ENSCING00000008954	-	100	55.303	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000010316	srpra	99	54.985	ENSCSAVG00000005602	-	100	54.985	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	64.340	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.297	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	65.099	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.297	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.889	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.711	ENSCSEG00000002374	srpra	100	77.861	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.711	ENSCVAG00000019881	srpra	100	77.711	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	73.083	ENSDARG00000061124	srpra	100	73.083	Danio_rerio
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.165	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	65.165	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.857	ENSDORG00000016719	Srpr	100	65.706	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000010316	srpra	99	48.632	FBgn0010391	Gtp-bp	100	50.076	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000010316	srpra	100	63.939	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	63.595	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.159	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	66.261	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.159	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	66.261	Equus_caballus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	61.002	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	61.002	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	75.940	ENSELUG00000017643	srpra	100	78.281	Esox_lucius
ENSTNIG00000010316	srpra	80	59.962	ENSFCAG00000030894	-	99	58.459	Felis_catus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.061	ENSFCAG00000011274	-	100	64.848	Felis_catus
ENSTNIG00000010316	srpra	99	64.894	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	65.350	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.250	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.861	ENSFHEG00000016959	srpra	100	77.711	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	75.841	ENSGMOG00000013244	srpra	100	77.064	Gadus_morhua
ENSTNIG00000010316	srpra	100	68.037	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	69.532	Gallus_gallus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.788	ENSGAFG00000000453	srpra	100	78.939	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.149	ENSGACG00000006550	srpra	100	78.354	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.819	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	67.424	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	64.188	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.281	ENSHBUG00000000119	srpra	100	78.281	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.012	ENSHCOG00000010749	srpra	100	78.012	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000010316	srpra	94	69.712	ENSIPUG00000000867	srpra	99	69.872	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.250	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	64.036	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	65.805	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.074	ENSKMAG00000002280	srpra	100	77.074	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.550	ENSLBEG00000009608	srpra	100	79.909	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.964	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	66.767	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000010316	srpra	100	71.108	ENSLOCG00000002733	srpra	100	71.599	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	64.706	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	65.402	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.706	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	64.492	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.706	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	64.492	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.706	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	64.492	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.706	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	64.492	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	76.923	ENSMAMG00000000473	srpra	100	78.281	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.431	ENSMZEG00005013432	srpra	100	78.431	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000010316	srpra	94	67.264	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	69.032	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.297	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	65.099	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	64.502	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	64.992	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	64.795	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000010316	srpra	100	75.191	ENSMMOG00000005019	srpra	100	75.038	Mola_mola
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.350	ENSMODG00000004576	-	100	65.350	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000010316	srpra	100	80.392	ENSMALG00000011343	srpra	100	80.845	Monopterus_albus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.449	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	90.152	Mus_caroli
ENSTNIG00000010316	srpra	100	64.795	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	89.394	Mus_musculus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	64.947	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	89.394	Mus_pahari
ENSTNIG00000010316	srpra	100	62.084	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	62.084	Mus_spretus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.109	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	66.261	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000010316	srpra	100	63.885	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	65.706	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	64.795	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	64.036	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.431	ENSNBRG00000017311	srpra	100	78.431	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000010316	srpra	99	61.985	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	63.376	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000010316	srpra	94	64.297	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	64.297	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000010316	srpra	100	62.064	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	60.850	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.250	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	64.643	Octodon_degus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.130	ENSONIG00000005324	srpra	100	78.130	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.857	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	65.706	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.812	ENSORLG00000014676	srpra	95	87.576	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.964	ENSORLG00020009240	srpra	100	77.964	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.812	ENSORLG00015015405	srpra	100	77.812	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.995	ENSOMEG00000005872	srpra	100	78.995	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.396	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	65.502	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000010316	srpra	100	63.126	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	64.599	Ovis_aries
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	64.188	Pan_paniscus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.061	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	64.848	Panthera_pardus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.061	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	64.848	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	64.188	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.706	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	64.492	Papio_anubis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	71.752	ENSPKIG00000016106	srpra	100	71.822	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000010316	srpra	94	66.990	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	67.308	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.571	ENSPMGG00000001393	srpra	100	78.571	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.145	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	64.947	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000010316	srpra	99	59.084	ENSPMAG00000009559	srpra	99	59.909	Petromyzon_marinus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	64.414	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	65.601	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	79.035	ENSPFOG00000003114	srpra	100	78.733	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.884	ENSPLAG00000007323	srpra	100	78.582	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.884	ENSPMEG00000015658	srpra	100	78.582	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000010316	srpra	100	79.186	ENSPREG00000004937	srpra	100	79.035	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000010316	srpra	88	85.526	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	85.526	Pongo_abelii
ENSTNIG00000010316	srpra	64	89.922	ENSPCAG00000003801	-	62	89.922	Procavia_capensis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	64.188	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.402	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	65.502	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.431	ENSPNYG00000012371	srpra	100	78.431	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000010316	srpra	100	74.962	ENSPNAG00000013476	srpra	100	74.057	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000010316	srpra	100	64.992	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	64.795	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	64.340	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.701	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	65.854	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000010316	srpra	56	38.071	YDR292C	-	52	39.210	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.099	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	63.885	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000010316	srpra	94	64.355	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	64.355	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000010316	srpra	100	67.228	ENSSFOG00015008837	srpra	100	67.939	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	72.508	ENSSMAG00000002783	srpra	100	72.508	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	80.000	ENSSDUG00000013920	srpra	100	74.734	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000010316	srpra	100	80.000	ENSSLDG00000008601	srpra	93	80.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000010316	srpra	80	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.364	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	66.316	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	81.955	ENSSPAG00000005103	srpra	100	81.955	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.009	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.261	Sus_scrofa
ENSTNIG00000010316	srpra	94	65.113	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	65.595	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000010316	srpra	100	87.253	ENSTRUG00000006856	srpra	100	87.405	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.413	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	66.362	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.857	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	64.492	Ursus_americanus
ENSTNIG00000010316	srpra	96	64.182	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	64.019	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000010316	srpra	72	89.922	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	89.922	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.396	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	65.549	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000010316	srpra	100	59.104	ENSXETG00000003920	srpra	100	60.773	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000010316	srpra	100	62.717	ENSXCOG00000001286	srpra	100	88.288	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000010316	srpra	100	79.242	ENSXMAG00000028401	srpra	100	79.242	Xiphophorus_maculatus