EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000010861 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13892 bases
Position: chr1:12760802-12774693
Accession: ZDB-GENE-070706-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000013790	Xpo1	PF08389.12	9.7e-23	1	1
ENSTNIP00000013790	IBN_N	PF03810.19	3.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000013985	-	2901	-	ENSTNIP00000013790	966 (aa)	-	H3CZV4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	64.700	ENSTNIG00000007857	si:ch73-182a11.2	99	64.700

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSG00000117408	IPO13	98	78.737	Homo_sapiens
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	68.828	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	68.828	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	91.476	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	91.476	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSAMEG00000001123	IPO13	98	78.737	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000010861	ipo13	95	86.862	ENSACIG00000008146	ipo13	100	86.768	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	68.704	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	68.704	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	67.678	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	98	67.678	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	91.164	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	91.164	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	67.678	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	98	67.678	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	91.060	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	91.060	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	91.060	ENSATEG00000018367	ipo13	100	91.060	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	65.876	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	66.772	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	78.820	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	79.663	ENSACAG00000014300	IPO13	99	79.663	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSANAG00000034183	IPO13	98	78.737	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000010861	ipo13	96	91.116	ENSACLG00000011458	ipo13	100	91.116	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	67.559	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	67.559	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	86.708	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	86.708	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	62.434	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	62.434	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.609	ENSBTAG00000018887	IPO13	98	78.421	Bos_taurus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSCJAG00000007453	IPO13	98	78.842	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSCAFG00000004875	IPO13	98	78.632	Canis_familiaris
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSCAFG00020017359	IPO13	98	78.632	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.504	ENSCHIG00000008341	IPO13	98	78.526	Capra_hircus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSTSYG00000035980	IPO13	98	78.737	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000010861	ipo13	88	77.374	ENSCAPG00000001972	IPO13	99	77.374	Cavia_aperea
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	78.168	ENSCPOG00000012445	IPO13	97	78.191	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSCCAG00000022035	IPO13	98	78.842	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSCATG00000041276	IPO13	98	78.737	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.398	ENSCLAG00000002914	IPO13	98	78.421	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSCSAG00000001190	IPO13	98	78.737	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000010861	ipo13	95	79.194	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	79.194	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	38.263	ENSCING00000001863	-	100	38.263	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	36.760	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.760	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSCANG00000009091	IPO13	98	78.737	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	77.766	ENSCGRG00001021177	Ipo13	98	77.789	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	77.766	ENSCGRG00000012411	Ipo13	98	77.789	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	61.562	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	98	61.562	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000010861	ipo13	100	88.509	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	88.462	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	91.372	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	91.372	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	95	65.129	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	65.418	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	64.842	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	64.842	Danio_rerio
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	86.000	ENSDARG00000060618	ipo13	99	86.000	Danio_rerio
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.504	ENSDNOG00000016583	IPO13	98	78.526	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSDORG00000005471	Ipo13	98	78.632	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	67.396	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.487	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSEASG00005001738	IPO13	98	78.842	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.820	ENSECAG00000015508	IPO13	98	78.842	Equus_caballus
ENSTNIG00000010861	ipo13	67	82.275	ENSEEUG00000011681	IPO13	81	82.275	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	65.142	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	65.142	Esox_lucius
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	88.773	ENSELUG00000001498	ipo13	100	88.773	Esox_lucius
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSFCAG00000006488	IPO13	98	78.737	Felis_catus
ENSTNIG00000010861	ipo13	95	79.303	ENSFALG00000005368	IPO13	100	79.303	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.293	ENSFDAG00000015599	IPO13	98	78.316	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	66.358	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	66.358	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	90.956	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	90.956	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	89.326	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	89.326	Gadus_morhua
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	58.230	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	58.557	Gadus_morhua
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	78.794	ENSGALG00000010087	IPO13	100	78.794	Gallus_gallus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	91.476	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	91.476	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	66.667	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	66.667	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000010861	ipo13	100	88.625	ENSGACG00000014562	ipo13	100	88.625	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	67.398	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	98	67.398	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	79.384	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	79.384	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSGGOG00000016375	IPO13	98	78.737	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	90.852	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	90.852	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	66.632	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	66.735	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.082	ENSHGLG00000001822	IPO13	98	78.105	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.082	ENSHGLG00100015830	IPO13	98	78.105	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	87.526	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	89.885	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	62.979	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	62.979	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	85.833	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	85.803	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	59.832	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	99	59.832	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.609	ENSSTOG00000003611	IPO13	98	78.632	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.504	ENSJJAG00000018591	Ipo13	98	78.526	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	67.250	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	67.250	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	90.985	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	90.985	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	66.874	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	99	67.082	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000010861	ipo13	100	90.269	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	90.269	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	74.497	ENSLACG00000016657	IPO13	99	73.548	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000010861	ipo13	83	32.418	ENSLACG00000002351	TNPO3	94	32.812	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	81.270	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	81.270	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	76.996	ENSLAFG00000017144	IPO13	98	77.020	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSMFAG00000032846	IPO13	98	78.737	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSMMUG00000015142	IPO13	98	78.737	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSMNEG00000041971	IPO13	98	78.737	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.714	ENSMLEG00000044330	IPO13	98	78.737	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	90.748	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	90.748	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	68.691	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	68.691	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	90.852	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	90.852	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000010861	ipo13	99	67.456	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	67.559	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	77.766	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	77.766	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000010861	ipo13	81	79.108	ENSMAUG00000013018	Ipo13	98	79.135	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000010861	ipo13	92	83.529	ENSMICG00000011003	IPO13	98	83.626	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.293	ENSMOCG00000008881	Ipo13	98	78.316	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	65.798	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	65.798	Mola_mola
ENSTNIG00000010861	ipo13	97	89.670	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	89.670	Mola_mola
ENSTNIG00000010861	ipo13	95	78.649	ENSMODG00000003017	IPO13	100	78.649	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000010861	ipo13	95	88.612	ENSMALG00000010805	ipo13	100	88.612	Monopterus_albus
ENSTNIG00000010861	ipo13	81	66.204	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	66.204	Monopterus_albus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.293	MGP_CAROLIEiJ_G0026367	Ipo13	98	78.316	Mus_caroli
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.293	ENSMUSG00000033365	Ipo13	98	78.316	Mus_musculus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	80.115	MGP_PahariEiJ_G0028698	Ipo13	99	80.115	Mus_pahari
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	78.293	MGP_SPRETEiJ_G0027339	Ipo13	98	78.316	Mus_spretus
ENSTNIG00000010861	ipo13	98	73.241	ENSMPUG00000013635	IPO13	98	73.267	Mustela_putorius_furo
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