EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000012102 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13512 bases
Position: chrUn_random:24541451-24554962
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000015066	PAZ	PF02170.22	1.1e-26	1	1
ENSTNIP00000015066	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000015269	-	2577	-	ENSTNIP00000015066	858 (aa)	-	H3D3H8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000012102	ago1	98	81.338	ENSTNIG00000002635	AGO3	98	81.338
ENSTNIG00000012102	ago1	98	82.964	ENSTNIG00000006331	ago4	99	82.964
ENSTNIG00000012102	ago1	98	82.130	ENSTNIG00000017760	ago2	98	82.130

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSG00000092847	AGO1	100	96.935	Homo_sapiens
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.534	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	95.925	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000012102	ago1	82	93.030	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.030	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.534	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.534	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.534	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	89.340	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.340	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000012102	ago1	91	96.807	ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.807	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.799	ENSANAG00000037711	AGO1	100	95.925	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.534	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000012102	ago1	80	99.709	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.709	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.925	Bos_taurus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	95.925	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	95.925	Canis_familiaris
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.314	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.991	ENSCHIG00000011848	-	100	95.133	Capra_hircus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	75.437	ENSTSYG00000032426	-	99	78.031	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	ENSTSYG00000009767	-	100	95.925	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000012102	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.925	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	95.925	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.576	ENSCATG00000031521	AGO1	100	96.935	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.925	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	95.925	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000012102	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.809	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.809	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSCANG00000039798	AGO1	100	95.925	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.005	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	95.925	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.344	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000012102	ago1	99	97.454	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.454	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.185	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.185	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	98.719	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.719	Danio_rerio
ENSTNIG00000012102	ago1	91	96.935	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	96.935	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000012102	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000012102	ago1	83	89.563	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.058	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	ENSEASG00005012086	AGO1	100	95.925	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSECAG00000024353	AGO1	100	95.925	Equus_caballus
ENSTNIG00000012102	ago1	92	88.579	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.579	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000012102	ago1	91	99.489	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.489	Esox_lucius
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	95.925	Felis_catus
ENSTNIG00000012102	ago1	91	90.701	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.701	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.925	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.925	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.401	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.401	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000012102	ago1	87	86.533	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.533	Gadus_morhua
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.336	ENSGALG00000002249	AGO1	100	95.809	Gallus_gallus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.302	ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.302	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000012102	ago1	87	99.202	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.202	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000012102	ago1	91	96.807	ENSGAGG00000012893	-	100	96.807	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.460	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	95.925	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.534	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	95.925	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	95.925	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000012102	ago1	99	99.529	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.529	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.185	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.185	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.673	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	95.925	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.925	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	95.925	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.418	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.418	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.418	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.418	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000012102	ago1	99	90.599	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.599	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000012102	ago1	100	94.296	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.296	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.005	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.005	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	95.925	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000012102	ago1	99	91.745	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	91.825	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000012102	ago1	100	92.084	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	96.935	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	95.925	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.534	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.534	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.534	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000012102	ago1	99	90.382	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.382	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	95.925	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.799	ENSMICG00000016147	AGO1	100	95.925	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.336	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	95.809	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000012102	ago1	78	99.553	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.553	Mola_mola
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.693	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.693	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000012102	ago1	99	99.411	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.411	Monopterus_albus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSTNIG00000012102	ago1	84	97.636	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.636	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000012102	ago1	61	94.275	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.275	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.809	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	95.809	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000012102	ago1	91	99.617	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.617	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.925	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.925	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000012102	ago1	84	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000012102	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000012102	ago1	100	94.694	ENSODEG00000005321	AGO1	100	95.925	Octodon_degus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	99.530	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.530	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	88.283	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.283	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.336	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	95.809	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.418	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.418	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.418	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.418	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.418	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.418	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.418	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.418	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.789	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	95.789	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSOARG00000019591	AGO1	100	95.925	Ovis_aries
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.460	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	95.925	Pan_paniscus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	95.925	Panthera_pardus
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.217	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	95.693	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.460	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	95.925	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSPANG00000009060	AGO1	100	95.925	Papio_anubis
ENSTNIG00000012102	ago1	98	95.611	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.611	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000012102	ago1	80	98.403	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.403	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.678	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.925	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.693	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.693	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.302	ENSPFOG00000005867	ago1	100	99.302	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.302	ENSPLAG00000002824	ago1	100	99.302	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.302	ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.302	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.302	ENSPREG00000006534	ago1	100	99.302	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000012102	ago1	98	96.454	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	95.925	Pongo_abelii
ENSTNIG00000012102	ago1	58	98.868	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	Procavia_capensis
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