EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000014604 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB7A
Alias: RAB7
Full Name: RAB7A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1127 bases
Position: chr11:7232675-7233801
Accession: 9788
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000017632	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000017853	RAB7A-201	624	-	ENSTNIP00000017632	207 (aa)	-	Q4RXU9

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000014604's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000014604's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000014604	RAB7A	72	31.250	ENSTNIG00000003649	rasl11a	66	31.250
ENSTNIG00000014604	RAB7A	77	34.783	ENSTNIG00000007566	si:ch73-116o1.2	80	36.047
ENSTNIG00000014604	RAB7A	78	34.969	ENSTNIG00000004004	-	86	34.969
ENSTNIG00000014604	RAB7A	84	54.913	ENSTNIG00000001956	RAB9A	82	54.913
ENSTNIG00000014604	RAB7A	78	40.491	ENSTNIG00000011081	rab11bb	72	40.491
ENSTNIG00000014604	RAB7A	76	37.975	ENSTNIG00000003472	rab2a	72	37.975
ENSTNIG00000014604	RAB7A	76	37.975	ENSTNIG00000014859	rab12	80	33.333
ENSTNIG00000014604	RAB7A	81	38.323	ENSTNIG00000008717	rab18a	79	38.323
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	40.000	ENSTNIG00000009039	rab14	73	40.000
ENSTNIG00000014604	RAB7A	86	37.430	ENSTNIG00000018319	-	88	37.430
ENSTNIG00000014604	RAB7A	100	31.364	ENSTNIG00000001260	RAB15	100	31.364
ENSTNIG00000014604	RAB7A	80	33.735	ENSTNIG00000017951	rabl2	71	33.735
ENSTNIG00000014604	RAB7A	84	34.857	ENSTNIG00000016414	rab15	80	34.857
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	38.462	ENSTNIG00000015000	zgc:101559	69	38.462
ENSTNIG00000014604	RAB7A	78	39.877	ENSTNIG00000013184	-	72	39.877
ENSTNIG00000014604	RAB7A	78	39.264	ENSTNIG00000013182	-	73	39.264
ENSTNIG00000014604	RAB7A	78	32.515	ENSTNIG00000016158	rab34b	62	32.515
ENSTNIG00000014604	RAB7A	77	37.349	ENSTNIG00000016575	rab23	75	37.569
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	40.244	ENSTNIG00000018267	rab22a	82	40.244
ENSTNIG00000014604	RAB7A	78	36.420	ENSTNIG00000004511	-	98	36.420
ENSTNIG00000014604	RAB7A	72	38.065	ENSTNIG00000012343	-	64	38.065
ENSTNIG00000014604	RAB7A	81	33.728	ENSTNIG00000001043	si:ch211-247i17.1	81	33.728
ENSTNIG00000014604	RAB7A	86	42.697	ENSTNIG00000011711	rab5c	78	42.697
ENSTNIG00000014604	RAB7A	96	35.961	ENSTNIG00000016831	RAB41	93	35.961
ENSTNIG00000014604	RAB7A	81	33.333	ENSTNIG00000013137	ran	75	33.333
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	36.527	ENSTNIG00000010122	rab33a	70	36.527
ENSTNIG00000014604	RAB7A	82	36.757	ENSTNIG00000010125	rab33ba	75	36.757
ENSTNIG00000014604	RAB7A	81	36.905	ENSTNIG00000006650	RAB19	76	36.905
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	31.098	ENSTNIG00000017844	-	85	31.098
ENSTNIG00000014604	RAB7A	78	34.524	ENSTNIG00000005090	rab25a	75	34.524
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	36.905	ENSTNIG00000003679	-	76	36.905
ENSTNIG00000014604	RAB7A	84	32.571	ENSTNIG00000016231	rab34a	66	32.571
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	36.585	ENSTNIG00000001448	-	95	36.585
ENSTNIG00000014604	RAB7A	73	34.437	ENSTNIG00000012154	kras	83	35.185
ENSTNIG00000014604	RAB7A	81	38.095	ENSTNIG00000018498	-	73	38.095
ENSTNIG00000014604	RAB7A	80	35.119	ENSTNIG00000006596	dnajc27	61	35.119
ENSTNIG00000014604	RAB7A	77	38.750	ENSTNIG00000002003	-	76	38.750
ENSTNIG00000014604	RAB7A	79	37.576	ENSTNIG00000008784	-	99	37.576
ENSTNIG00000014604	RAB7A	100	98.551	ENSTNIG00000011114	-	100	98.551
ENSTNIG00000014604	RAB7A	83	35.260	ENSTNIG00000011300	si:dkey-16l2.16	78	36.095
ENSTNIG00000014604	RAB7A	62	34.109	ENSTNIG00000006917	si:cabz01085950.1	95	34.109
ENSTNIG00000014604	RAB7A	90	30.481	ENSTNIG00000011385	hrasb	96	31.313
ENSTNIG00000014604	RAB7A	83	40.462	ENSTNIG00000009196	rab5aa	78	40.462
ENSTNIG00000014604	RAB7A	98	50.739	ENSTNIG00000001195	rab9a	99	50.739
ENSTNIG00000014604	RAB7A	80	30.583	ENSTNIG00000013920	rab20	83	30.583
ENSTNIG00000014604	RAB7A	81	37.725	ENSTNIG00000007882	rab18b	79	37.725
ENSTNIG00000014604	RAB7A	96	36.500	ENSTNIG00000015257	rab6bb	94	36.500